Metody populační biologie rostlin - MB120P22

• Anglický název: Methods in plant population biology
• Český název: Metody populační biologie rostlin
• Zajišťuje: Katedra botaniky (31-120)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2012
• Semestr: letní
• E-Kredity: 2
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:1/1, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Další informace: http://www.natur.cuni.cz/~herben/kurspopmetod.html
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D.

Anotace

čeština

Předmět je vyučován anglicky v případě přítomnosti zahraničních studentů.
Cílem praktika je podat přehled běžných postupů ve dvou oblastech:
? analýza běžných datových souborů v populační biologii rostlin
? použití základních technik pro modelování v populační biologii a jejich aplikace v praktických situacích
? seznámení s možným softwarovým vybavením pro práci v populační biologii (zejména Matlab a S-plus)

Poslední úprava: MUNZBERG (28.04.2006)

angličtina

The lectures can be given in English.

Poslední úprava: MUNZBERG (28.04.2006)

Literatura

čeština

Caswell H.: Matrix Population Models: Construction, Analysis, and Interpretation. Základní příručka pro analýzu maticových populačních modelů.

Gibson, D. J. 2002. Methods in comparative plant population ecology. Oxford University Press, Oxford.

Scheiner S.M. & Gurevitch J. (1993): Design and analysis of ecological experiments. Chapman & Hall, New York.

Herben T. a Münzbergová Z.: Zpracování geobotanických dat v příkladech - Část II. Demografická data

Poslední úprava: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (31.05.2019)

angličtina

Gibson, D. J. 2002. Methods in comparative plant population ecology. Oxford University Press, Oxford.

Scheiner S.M. & Gurevitch J. (1993): Design and analysis of ecological experiments. Chapman & Hall, New York.

Poslední úprava: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (31.05.2019)

Sylabus

Kurs má část teoretickou (přednášky, demonstrace analýzy dat a modelování), a část praktickou (analýza a modelování dat přinesených posluchači, nebo dat, která přinesou přednášející). Závěrem kursu posluchači vypracují krátký report o vybraném zpracovávaném problému, který přednesou a obhájí na společném sezení.

Náplň cyklu vychází z problémů a technik, které uvádíme v manuálu pro analýzu dat v populační biologii (Herben a Münzbergová: Zpracování geobotanických dat v příkladech - Část II. Demografická data). Obsah se mezi jednotlivými běhy trochu mění. Jednotlivé okruhy:

• analýza dat o natalitě a mortalitě: logistická regrese, analýza přežívání

• analýza dat o růstu rostlin

• analýza dat o kvetení, produkci semen, analýza dat z polinačních pokusů: Poissonovská regrese

• analýza dat o klíčení a přežívání semenáčků, analýza dat o přežívání semen v půdě

• identifikace jednosměrných vztahů v datových souborech pomocí parciální regrese a path analysis

• konstrukce populačních přechodových matic, kritika sebraných dat

• maticové modelování populační dynamiky: stabilní věková struktura, růstová rychlost, její variabilita, průměrná délka života

• elasticita, příspěvky jednotlivých fází k růstové rychlosti, zjišťování "kritických" fází

• spolehlivost predikcí maticových modelů

• metapopulační dynamika: stanovení parametrů křivky šíření, metapopulační kapacity

• metapopulační dynamika: modelování šíření druhu v krajině s explicitní strukturou

• analýza dat na úrovni populace

Poslední úprava: MUNZBERG (28.04.2006)