Praktikum probíhá jako týdenní praktický kurz.
Je naplánován od 18.5. do 22.5.2026, v místnosti praktika v BIOCEVu vždy od 9:00 hod.
S pozdravem
Vojtěch Šroller a kol.
Moodle - Praktikum molekulární biologie a virologie MB140C77
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=3944
Týdenní turnusový kurz z molekulární biologie a virologie poskytuje praktický a teoretický nácvik laboratorních
metod z molekulární biologie a virologie. Vybrané úlohy umožňují studentům se seznámit jak se základními
metodami (jako izolace DNA, gelová elektroforéza) tak i s metodami pokročilejšími, které jsou používány ve
výzkumných a diagnostických laboratořích věnující se biomedicínskému výzkumu (např. Elektronová mikroskopie,
PCR, sekvenování). Laboratorní kurz je vhodný především pro studenty se zaměření na molekulární biologii a
virologii.
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)
One week course from molecular biology and virology provides both practical and theoretical training in laboratory
methods from molecular biology and virology. The selected experiments allow students to practice not only basic
methods (like DNA isolation, gel electrophoresis) but also methods more advances, which are used in biomedical
research and diagnostics laboratories (like electron microscopy, PCR, sequencing). Laboratory course is well
suited for students interested in molecular biology and virology.
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (08.01.2024)
Podmínky zakončení předmětu -
Podmínkou pro udělení zápočtu je aktivní účast, vypracování protokolů a jejich schválení vedoucím praktika.
Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Credits are given based on active participation on the course and written up completed protocols approved by the supervisor of laboratory course.
Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Literatura -
Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell
Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press
Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.10.2019)
Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell
Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press
Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (25.10.2019)
Požadavky ke zkoušce -
Zápočet na základě odevzdaných protokolů
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (30.08.2019)
credit based on written protocols
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (30.08.2019)
Sylabus -
Úlohy řešené v průběhu praktik: (mohou být mírně upraveny podle aktuální situace) 1. Izolace DNA, RNA a proteinů z buněčné linie myších buněk, měření jejich množství a čistoty (spektrofotometrie). 2. Izolace bakteriálních vektorů, vizualizace na gelové elektroforéze, restrikční analýza, metody klonování genů. 3. Detekce virus-specifických protilátek v prasečím séru pomocí hemaglutinačního a neutralizačně inhibičního testu. 4. Vizualizace pseudovirionů pomocí elektronové mikroskopie. 5. Izolace a detekce virové DNA z povrchu kůže za použití metod amplifikace rolujícím kruhem, amplifikace PCR (multiplex), sekvenace a identifikace získané DNA porovnáním s databázemi.
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)
The work schedule of practical course:
1. Isolation of DNA, RNA and proteins from mouse cell line, measuring concentration and purity (spectrophotometry)
2. Isolation of bacterial plasmid DNA, visualization on gel electrophoresis, restriction analysis, methods for cloning of genes.
3. Detection of virus specific antibodies in pigs’ sera, using hemagglutination and neutralization inhibition test.
4. Visualization of pseudovirions by electron microscopy.
5. Isolation and detection viral DNA from skin using methods rolling cycle amplification, PCR multiplex amplification, sequencing and identification of DNA by computer analysis.
Poslední úprava: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Výsledky učení
Po absolvování předmětu student/ka:
Vysvětlí principy základních molekulárně biologických a virologických metod, zejména postup při práci s buněčnými kulturami a jejich infekce virem, virus neutralizační test, imunofluorescenční barvení, izolaci plazmidové DNA z bakteriální kultury, kvantitativní polymerázovou řetězovou reakci, Sangerovo sekvenování, elektronovou mikroskopii, a jejich využití ve výzkumné, lékařské a biotechnologické praxi.
Samostatně provede vybrané základní laboratorní postupy, jako je práce se savčími tkáňovými kulturami, fixace a imunofluorescenční barvení buněk, infekce buněk viry, fluorescenční mikroskopie, kvantitativní PCR, izolace plazmidové DNA, příprava sekvenační reakce a dodržuje zásady správné laboratorní praxe.
Dokáže analyzovat a interpretovat experimentální výsledky, včetně pořízení a vyhodnocení snímků z fluorescenčního mikroskopu, výpočtů podle vzorečků u kvantifikačních metod a srozumitelně je zpracovat ve formě laboratorního protokolu.
Využívá základní bioinformatické nástroje a veřejné databáze pro vyhodnocení výsledků sekvenační reakce, kvantitativní PCR a kontrolu výpočtů a řešení jednoduchých teoretických úloh v molekulární biologii.
Poslední úprava: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)
