|
|
|
||
Předmět mikrobiologie je součástí biologických disciplín, poskytující základní poznatky o biologii, morfologii, metabolismu, genetice a patogenitě mikroorganismů. Důraz v tomto předmětu je primárně kladen na podstatné aspekty vztahu mikroorganismus - hostitel - prostředí a ovlivnění tohoto vztahu antimikrobními látkami. Student během studia tohoto předmětu získá přehled o různých mikrobiálních entitách. Dále bude obeznámen s problematikou antimikrobní terapie. Mimo jiné, bude obeznámen s klinicky nejdůležitějšími původci infekčních onemocnění a se základními technikami průkazu mikrobiálních činitelů v mikrobiologických laboratořích. Cílem výuky je připravit studenty rozvíjet získané poznatky při dalším studiu a aplikovat je ve zdravotnické praxi.
Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
Podmínky pro udělení zápočtu:
Podmínky zkoušky z mikrobiologie:
Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
Povinná:
Doporučená:
Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
· přednášky, PPT prezentace · semináře - diskuse na dané téma · praktická cvičení - úvod do základních technik využívaných v mikrobiologické laboratoři Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
Znalosti definované souborem otázek v dokumentech Výstupy učení Znalosti oboru dané oporami uvedenými v rámci sylabu předmětu
Okruhy ke zkoušce z předmětu Mikrobiologie · Obecná mikrobiologie · 1. Obor mikrobiologie, disciplíny – speciální/aplikované mikrobiologické vědy. · 2. Role mikroorganismů v přírodě – ekologická role, role v lékařství. · 3. Využití mikroorganismů člověkem – potravinářství, biotechnologie, bioremediace. · 4. Mikrobi – metabolismus a vztah ke kyslíku - fotoautotrof, fotoheterotrof, chemoautotrof, chemoheterotrof, striktní aerob, anaerob, fakultativní anaerob, …, (zdroj energie, zdroj uhlíku, příklady). · 5. Růstová křivka a faktory ovlivňující růst. · 6. Role bakterií v ekosystémech – destruent, saprofyt, parazit, patogen. Vztahy mezi organismy – symbióza, komensalismus, mutualismus, parazitismus. · 7. Klasifikace mikroorganismů, klasifikační skupiny – sestupný/vzestupný přehled, binomická nomenklatura. · 8. Srovnání prokaryotické a eukaryotické buňky - bakterie, mykobakterie, mykotická agens (stavba buňky, buněčná stěna, cytoplazmatická membrána, genetika, rozmnožování). · 9. Archebakterie – jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus. · 10. Bakterie - jejich obecná charakteristika – velikost, stavba buňky, metabolismus, ekologická role. · 11. Eukaryota, eukaryotní mikro/organismy – jejich obecná charakteristika - velikost, stavba buňky, ekologická role. · 12. Mykotická agens – stavba buňky (cytoplazmatická membrána, buněčná stěna), metabolismus, růst hub – blastospora, mycelium, hyfa, dimorfismus; role v ekosystému, onemocnění (mycetismus, mykotoxikóza, mykoalergie, mykóza, dermatomykóza, endemické mykózy, oportunní mykózy). · 13. Viry – obecná charakteristika, struktura, reprodukce, klasifikace (DNA viry, RNA viry, symetrie kapsidy, obal), bakteriofág – charakterizace, využití pro genové inženýrství, fágová terapie, lyzogenní konverze. · 14. Patogeneze virových infekcí – lytický, lyzogenní cyklus, transformace. · 15. Priony – obecná charakteristika. · 16. Hypotéza spontánní generace, teorie biogeneze. · 17. A. van Leeuwenhoek, L. Pasteur, R. Koch, J. Lister, E. Jenner, A. Fleming a jejich přínos pro mikrobiologii. · 18. Genetika bakterií – chromozom, plazmid, transpozon, genotyp, fenotyp, DNA polymeráza, operon, mutace. · 19. Parasexuální procesy u bakterií – transformace, transdukce, konjugace. · 20. Obligátní vs. oportunní patogen/parazit, intracelulární parazit. · 21. Přenos infekčních agens – přímá cesta, nepřímá cesta, vektor, antropozoonóza, zoonóza. · 22. Infekce (inaparentní, latentní, manifestativní), anatomické lokalizace infekce, fáze infekce. · 23. Obrana hostitele před infekcí – mechanické, chemické, imunitní, ekologické bariéry. · 24. Patogeneze, faktory virulence - adhesiny, enzymy, toxiny, dimorfismus. · 25. Rezistence – primární, sekundární, klinická rezistence, mikrobiologická rezistence, multirezistence, polyrezistence, zkřížená/sdružená rezistence, přenos genů kódujících rezistenci, molekulární mechanismy rezistence - inaktivace, alterace cílové struktury, změna permeability. · 26. Určování citlivosti na antimikrobní látky in vitro - diskový difúzní test, E-test, mikrodiluční bujónový test – MIC, MBC. · · Klinická mikrobiologie · 27. Klinicky významné Gram pozitivní koky - St. aureus, St. epidermidis, … (morfologie, kataláza, plazmakoaguláza, hemolýza, produkce toxinů, enzymů, infekce), MRSA, VRSA. · 28. Klinicky významné Gram pozitivní koky – streptokoky, enterokoky, dělení streptokoků do skupin dle hemolýzy, dle antigenní struktury, dle patofyziologie, Streptococcus pyogenes, Str. agalactiae, viridující streptokoky, Str. pneumoniae, E. faecium, E. faecalis, … (onemocnění, produkce toxinů, enzymů, léčba). · 29. Klinicky významné Gram negativní koky – meningokok, gonokok (Neisseria meningitidis, N. gonorrhoeae), onemocnění, cesta přenosu, klinický obraz, léčba, prevence, laboratorní diagnostika – oxidáza, kultivace. · 30. Klinicky významné Gram negativní bakterie - obligátně patogenní/oportunně patogenní, rody: Salmonella, Shigella, Yersinia (onemocnění, přenos, diagnostika - sérotypizace), střevní fakultativně anaerobní bakterie – Escherichia (EHEC, EIEC, EPEC, ETEC), Klebsiella, Citrobacter sp., Enterobacter sp. (onemocnění, diagnostika), aerobní Gram negativní bakterie – Pseudomonas sp., Vibrio sp. (onemocnění, diagnostika). · 31. Klinicky významné spirochety: Treponema pallidum, Borrelia burgdorferi (přenos, onemocnění, léčba). · 32. Mykobakterie – tuberkulóza (původce), mykobakteriózy (původci) – onemocnění, diagnostika, léčba. · 33. Pohlavně přenosná onemocnění – syfilis, kapavka, ulcus molle, lymphogranuloma venereum, AIDS, trichomoniáza, vulvovaginální kandidóza, herpes genitalis, condylomata accuminata, pediculosis pubis, chlamydiové infekce (původce, stádia onemocnění, příznaky, terapie). · 34. Klinicky významné viry - čeleď: Poxviridae, virus varioly, virus vakcinie (přenos, formy onemocnění, prevence). · 35. Klinicky významné viry - čeleď: Herpesviridae, HSV1, HSV2, herpes virus varicellae-zosteris, cytomegalovirus, virus Epstein-Barrové (přenos, onemocnění, léčba, prevence). · 36. Klinicky významné viry - viry chřipky (přenos, antigenní shift, antigenní drift, onemocnění, léčba, prevence). · 37. Virus příušnic, zarděnek, spalniček (přenos, onemocnění, léčba, prevence). · 38. Retroviry – HIV (přenos, tropismus viru, stadia onemocnění, léčba, prevence). · 39. Viry hepatitid -HAV, HBV, HCV, HDV (přenos, onemocnění, léčba, prevence). · 40. Superficiální mykózy - infekce (pityriasis versicolor, dermatomykózy – tinea, onychomykóza, bílá/černá piedra). · 41. Subkutánní mykózy - chromoblastomykóza, subkutánní zygomykóza, mycetom. · 42. Dimorfní houby – výskyt, onemocnění, původci. · 43. Kvasinkové infekce – Candida albicans, dimorfismus, patogeneze, rizikové faktory, onemocnění (kožní, mukokutánní, systémové), Cryptococcus neoformans – faktor virulence, onemocnění, rizikové faktory. · 44. Vláknité houby – Aspergillus spp., Mucorales - onemocnění. · 45. Prvoci jako původci onemocnění – formy (trofozoit, cysta), améby – Entamoeba histolytica, Entamoeba gingivalis, přenos, onemocnění, terapie; bičíkovci – Giardia lamblia (intestinalis), Trichomonas vaginalis, Trypanosoma gamblinese, Leishmania sp. – výskyt, přenos, onemocnění; výtrusovci -Toxoplasma gondii – přenos, onemocnění. · 46. Krevní prvoci – Plasmodium, výskyt onemocnění, přenos, malarický záchvat (maligní, benigní terciány), laboratorní diagnostika (tlustá kapka, tenký roztěr), prevence onemocnění, léčba onemocnění. · 47. Parazitické hlístice – stavba těla, způsoby přenosu, zástupci: Trichinella spiralis, Trichuris trichura, Strongyloides sp., měchovci, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides, Toxocara canis, filárie (výskyt, přenos, onemocnění, léčba). · 48. Parazitičtí ploštěnci – stavba těla, zástupci: Taenia saginata, Taenia solium, Echinococcus granulosus (výskyt, přenos, onemocnění, léčba), motolice – Schistosoma haematobium (výskyt, přenos, onemocnění, léčba). · 49. Typy biologického materiálu (přirozeně sterilní, nesterilní). · 50. Příprava preparátů pro světelnou mikroskopii (nativní, barvený – Gram, Ziehl-Neelsen, Burry, Giemsa). · 51. Kultivace mikroorganismů - podmínky pro kultivaci, závislost na teplotě, závislost na kyslíku, typy kultivačních médií (diagnostická půda, selektivní půda, selektivně diagnostická půda, půda pro antibiotické zkoušky – krevní, Endův, Loewenstein-Jensen agar, Mueller-Hinton, McConkey, Sabouraudův agar). · 52. Mikrobiální flóra – její role, zastoupení. · · Farmaceutická mikrobiologie · 53. Antimikrobní látky, pojmy: dezinficiencia, antiseptika, konzervancia, antibiotika. · 54. Dezinficiencia/dezinfekce- definice pojmu, kategorizace dezinfekce (fyzikální, chemická), účel, vlastnosti, mechanismus účinku, použití, volba dezinficiens, příklady. · 55. Antiseptika/antisepse – definice pojmu, vlastnosti, mechanismus účinku, příklady. · 56. Dekontaminace, sanace, asepse – definice pojmů. · 57. Konzervancia/konzervace – účel, efekt, vlastnosti, použití. · 58. Faktory ovlivňující efekt antimikrobních látek. · 59. Antiinfektiva – účel využití, vlastnosti (mikrobistatický/mikrobicidní efekt), klasifikace – antivirotika, antibiotika, antimykotika, antiparazitika, anthelmintika, …). · 60. Antibiotika, chemoterapeutika – definice pojmu, použití, klasifikace (cidní/statická, úzko/širokospektrá, dle buněčného cíle, dle chemické struktury). · 61. Beta-laktamová antibiotika - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, mechanismy rezistence – poriny, modifikace PBP, beta-laktamasa. Skupiny beta-laktamových antibiotik – penamy (příklady, účinek), cefemy (příklady, účinek), karbapenemy/monobaktamy (příklady, účinek). · 62. Inhibitory beta-laktamas – účinek, příklady. · 63. Aminoglykosidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 64. Tetracykliny - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 65. Chloramfenikol – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky. · 66. Makrolidy, linkosamidy- cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 67. Glykopeptidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, nežádoucí účinky. · 68. Chinolony - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 69. Ansamyciny/rifamyciny - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady, rezistence. · 70. Nitrofurany - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 71. Sulfonamidy - cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady. · 72. Antituberkulotika – cíl působení, mechanismus účinku, příklady: pyrazinamid, isoniazid, rifampicin, ethambutol, streptomycin. · 73. Antivirotika – dělení dle mechanismu účinku, příklady: acyklovir, ganciklovir, amantadin, zidovudin, stavudin, sanquinavir, tenofovir, adefovir, ribavirin, interferony. · 74. Antimykotika – cíl působení, mechanismus účinku, spektrum účinku, příklady: polyenová – amfotericin B, nystatin; azolová – ketokonazol, flukonazol, itrakonazol, vorikonazol; echinokandiny – kaspofungin, mikafungin; alylaminy – terbinafin. · 75. Sterilita, sterilizace - definice pojmu, sterilizační přístupy – fyzikální (suché, vlhké teplo, filtrace), chemická cesta, záření, test sterility. · 76. Hlavní zdroje kontaminace surovin a farmaceutických produktů. Kritéria mikrobiologické nezávadnosti léků, jejich testování. Mikrobiální degradace farmaceutických přípravků. · 77. Sterilní farmaceutické produkty. Kontrola sterility a kvality farmaceutických výrobků. · 78. Aseptická příprava léků, boxy s laminárním prouděním, hygienická opatření a kontrola prostředí (správná laboratorní praxe). · · Metodické přístupy v mikrobiologické laboratoři · - dezinfekce, předsterilizační příprava, sterilizace, stěrové metody · - mikroskopické techniky, nativní a barvený preparát · - kultivace, podmínky kultivace, typy kultivačních půd, využití kultivačních půd · - testování citlivosti mikroorganismů vůči antimikrobním látkám · - laboratorní diagnostika gram-pozitivních, gram-negativních bakterií · - laboratorní diagnostika mykotických agens · - laboratorní diagnostika parazitárních agens · - metody identifikace mikrobiálních původců Knowledge of discipline defined in sylabus of the subject. Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
Úvod do mikrobiologie, historické milníky, vztah člověka vs. mikrobi Mikrobiální fyziologie, morfologie a metabolismus prokaryot Základní rozdělení antimikrobních látek Antibiotika Rezistence k antibiotikům Mikrobiální genetika Mikrobiální fyziologie, morfologie a metabolismus prokaryot Úvod do farmaceutické mikrobiologie Lékařsky významné grampozitivní bakterie Lékařsky významné gramnegativní bakterie Lékařsky významné acidorezistentní bakterie Sexuálně přenosné onemocnění Parazitologie- parazitičtí prvoci a červi Úvod do mykologie a virologie Úvod do vyšetřovacích metod v mikrobiologické laboratoři - dezinfekce, předsterilizační příprava, sterilizace, stěrové metody - mikroskopické techniky, nativní a barvený preparát - kultivace, podmínky kultivace, typy kultivačních půd, využití kultivačních půd - testování citlivosti mikroorganismů vůči antimikrobním látkám - laboratorní diagnostika gram-pozitivních, gram-negativních bakterií - laboratorní diagnostika mykotických agens - laboratorní diagnostika parazitárních agens - metody identifikace mikrobiálních původců Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|
|
||
Studijní materiály | Intranet FAF (cuni.cz) Katedra biologických a lékařských věd | Intranet FAF (cuni.cz) Katedra biologických a lékařských věd | Intranet FAF (cuni.cz) Poslední úprava: Konečná Klára, RNDr., Ph.D. (14.02.2025)
|