Modelování v epidemiologii - CEM015P2

• Anglický název: Modelling in epidemiology
• Zajišťuje: Ústav hygieny 3. LF UK (12-HYG)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2022
• Semestr: letní
• Body: 3
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:1/1, Z+Zk [HT]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: doc. Ing. Luděk Berec, Dr.

Anotace

Úvod do matematického modelování epidemií, ilustrace aplikace modelů v praxi, včetně nácviku praktických dovedností, porozumění metodám přípravy stochastického a deterministického modelu, popis faktorů ovlivňujících šíření infekční choroby a jejich inkorporace do modelu, kritické čtení literatury obsahující infekční modely.

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)

Cíl předmětu

Porozumění existujícím matematickým modelům v epidemiologii, poznání cesty od formulace vědecké otázky až po interpretaci modelových výstupů, včetně praktické dovednosti, schopnost kriticky zhodnotit předpoklady a výstupy modelů, schopnost komunikovat jak s modeláři, tak těmi, jimž jsou výsledky modelů určeny, znalost spektra existujících modelů různých typů infekcí.

 

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)

Podmínky zakončení předmětu

Předmět je ukončen zkouškou.

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)

Literatura

Vynnycky E., White R. G. (2010) An introduction to infectious disease modelling. Oxford University Press.

Anderson R. M., May R. M. (1991) Infectious diseases of humans: dynamics and control. Oxford University Press.

Vybrané vědecké články k jednotlivým tématům.

Výukové materiály.

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)

Metody výuky

Přednášky, semináře, cvičení.

Celkový rozsah praktické výuky v rámci předmětu bude 15 hodin.

Poslední úprava: Dlouhý Pavel, doc. MUDr., Ph.D. (14.09.2022)

Požadavky ke zkoušce

Zápočtový test z probraného učiva. Ústní zkouška z teoretického obsahu předmětu včetně návrhů praktického řešení předložených příkladů.

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)

Sylabus

·        Význam a cíle matematického modelování (nejen) v epidemiologii

·        S(E)IR: základní matematický model epidemie

·        Základní a efektivní reprodukční číslo a metody jejich odhadu

·        Anatomie přenosu: faktory ovlivňující šíření infekcí a jejich zahrnutí do modelů

·        Kontrola šíření infekcí: NPIs, vakcinace, treatment a jejich zahrnutí do modelů

·        Náhoda a variabilita: stochastické modely a práce s nimi + praktická část

·        Praktický nácvik vývoje modelů na základě verbálního popisu epidemie

·        Ilustrace epidemických modelů z literatury pro významné infekční choroby

·        Kalibrace modelů na pozorovaná data + praktická část

·        Další typy modelů: endemické infekce, pohlavně přenosné infekce, infekce přenášené vektory, makroparazitární infekce + ilustrace pro specifické choroby

·        Práce s nejistotou a interpretace modelových výstupů

·        Komunikace modelů a jejich výstupů směrem k veřejnosti, médiím, lékařům a politikům

·        Průběžně: kritické čtení literatury obsahující epidemické modely

 

Poslední úprava: Rödlová Sylva, RNDr., Ph.D. (29.06.2022)