Last update: RNDr. Edvard Ehler, Ph.D. (23.05.2020)
V tomto předmětu se zaměříme na obecné principy vědecké práce, zejména formování a ověřování hypotéz a plánování výzkumu; výběr metod; přístupy ke sběru dat, jejich ukládání a anotaci; využívání vědeckých/biologických databází.
Hlavní náplní praktických seminářů bude biostatistika - tedy aplikace statistických přístupů na biologická data. Za účelem rozvoje další vědecké činnosti studentů, obzvláště se zaměřením na vyprácování závěrečných prací, si představíme hlavní zásady statistického zpracování biologických dat. A to od přípravy a čištění dat, přes využití popisných statistik (průměr, medián, percentily, kvartily, rozptyl, směrodatná odchylka), rozložení dat (spojité, diskrétní, Gaussovo/normální), úvod do pravděpodonosti (zákony pravděpodobnosti, čtyřpolní tabulka, prevalence a incidence, představení Bayesiánské statistiky) až k základním parametrickým a neparametrickým testům (varianty t-testů a jejich neparametrické analogy, χ2 test), korelacím a regresní analýze (korelační koeficient, Pearsonova a Spearmanova korelace, lineární regrese). Prostor bude věnovám i správné vizualizaci dat (bodové a spojnicové grafy, boxploty, 2D a 3D grafy, stromové grafy, biologické sítě, znázornění vícerozměrných dat), a také statistickým nástrojům - zejména využití volně přístupného prostředí programovacích jazyků R a Python.
Literature - Czech
Last update: RNDr. Edvard Ehler, Ph.D. (23.05.2020)
Lepš J, Šmilauer P. Biostatistika. Nakladatelství Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích; 2016. Zvárová a kol. Biomedicínská statistika I. (2. vydání), II., III. Karolinum, 2011, 2002, 2003. Procházka B. Stručná biostatistika pro lékaře. Karolinum, 2015. Zvára K. Biostatistika (2. vydání). Karolinum, 2008 Budínová M a kol. Průvodce základními statistickými metodami. Grada, 2010. Evett I and Weir B. Interpreting DNA evidence: statistical genetics for forensic scientists. Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts, 1998. Procházka B. Biostatistika pro lékaře. Karolinum, 2015. E-learningová učebnice matematické biologie (IBA MU v Brně): http://portal.matematickabiologie.cz Le ChT. Introductory Biostatistics. Wiley-Interscience, 2003. Källén A. Understanding Biostatistics. Wiley-Interscience, 2011. van Belle G, Fisher LD, Heagerty PJ, Lumley T. Biostatistics: a methodology for the health sciences. Wiley-Interscience, 2004 Rosner B. Fundamentals of Biostatistics, 7th edition. Brooks/Cole, Cengage Learning, 2011.
Learning resources - Czech
Last update: RNDr. Edvard Ehler, Ph.D. (10.06.2020)
