|
|
|
||
|
Poslední úprava: ()
|
|
||
|
Poslední úprava: RNDr. Ivan Barvík, Ph.D. (23.05.2014)
Seznámit studenty se základními algoritmy počítačové fyziky, hardwarovými a softwarovými prostředky superpočítačového MetaCentra, které mohou využít při řešení bakalářských či diplomových prací a zajímavými aplikacemi (viz. anotace a sylabus). |
|
||
|
Poslední úprava: doc. RNDr. Jiří Pavlů, Ph.D. (14.06.2019)
Podmínkou zápočtu je pravidelná a aktivní účast na seminář a prezentace vybraného tématu. |
|
||
|
Poslední úprava: RNDr. Ivan Barvík, Ph.D. (23.05.2014)
Přednášky a praktická cvičení v počítačové laboratoří. Nejsou potřeba žádné předběžné znalosti či dovednosti. |
|
||
|
Poslední úprava: RNDr. Ivan Barvík, Ph.D. (28.05.2014)
1. Pocitacova fyzika - velke projekty soucasnosti: http://www.worldcommunitygrid.org/ http://www.jamstec.go.jp/esc/index.en.html http://www.illustris-project.org/
2. Simulace mnohočásticových systémů - metoda molekulární dynamiky. 3. Simulace proudění tekutin - numerické řešení Navier-Stokesových rovnic. 4. Metoda Monte Carlo. 5. Algoritmus pro fyzikálně korektní fotorealistické vykreslení 3D scény.
6. Vývoj hardwarových prostředků pro náročné numerické výpočty (www.top500.org) 7. Superpočítačové MetaCentrum (https://metavo.metacentrum.cz/) - přihlášení, dostupné softwarové balíky, spouštění úloh. 8. OpenMP - jak lze prostřednictvím 2-3 řádků vsunutých do programu 80x urychlit numerický výpočet na výpočetním uzlu klastru Zewura. 9. MPI - jak přimět počítače na opačných koncích republiky provést výpočet společně. 10. CUDA - demonstrace enormního výpočetního výkonu poskytovaného současnými grafickýcmi kartami.
11. Molekulárně dynamické simulace biomolekul. 12. Jak počítač vymýšlí strukturu potenciálního léku (http://autogrow.ucsd.edu/). 13. "Alchymistické" výpočty volné energie vazby potenciálního léku k cílové biomolekule.
|