Předmět je zaměřen na základní znalosti z oboru interakcí membrán a proteinů na zhrubené úrovni. Přednášky
zahrnují také popis vývoje modelů (membrán a proteinů), včetně jejich aproximací a omezení. Na závěr je shrnuto
několik pokročilých metod Monte Carlo, které se často používají v simulacích.
Poslední úprava: T_KCHFO (15.04.2013)
The course is focused on basic knowledge of interactions of proteins and membranes at coarse-grained level. It
covers also development of appropriate soft matter models, their approximations and limitations. At the end, few
advanced methods of Monte Carlo simulations that are often used in this field are described.
Literatura -
Poslední úprava: T_KCHFO (15.04.2013)
Intermolecular and Surface Forces 3rd edition by Jacob N. Israelachvili; Academic Press 2010
Giant Molecules: Here, There, and Everywhere 2nd edition by Alexander Y. Grosberg et al.; World Scientific Press 2010
Soft Condensed Matter Physics in Molecular and Cell Biology by W.C.K. Poon and D. Andelman; Taylor & Francis 2006
Poslední úprava: T_KCHFO (15.04.2013)
Intermolecular and Surface Forces 3rd edition by Jacob N. Israelachvili; Academic Press 2010
Giant Molecules: Here, There, and Everywhere 2nd edition by Alexander Y. Grosberg et al.; World Scientific Press 2010
Soft Condensed Matter Physics in Molecular and Cell Biology by W.C.K. Poon and D. Andelman; Taylor & Francis 2006
Sylabus -
Poslední úprava: T_KCHFO (15.04.2013)
1. Úvod do oblasti "soft matter"
2. Idealní řetězec
3. Idealní tenká membrána
4. Interakce nenabitých membrán a proteinů
5. Interakce nabitých membrán a proteinů
6. Realistické interakce membrán a proteinů
7. Termodynamické principy samouspořádaných systémů
8. Langmuirova adsorpce
9. Transport
10. Pokročilé metody Monte Carlo
Poslední úprava: T_KCHFO (15.04.2013)
1. Introduction to soft matter
2. Ideal chain approximation
3. Ideal thin membrane
4. Interaction of uncharged membranes and proteins
5. Interaction of charged membranes and proteins
6. Towards realistic interactions of membranes and proteins
