Biochemie - NBCM012

• Anglický název: Biochemistry
• Zajišťuje: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Fakulta: Matematicko-fyzikální fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: Mgr. Dita Strachotová, Ph.D.; RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D.
• Kategorizace předmětu: Fyzika > Biofyzika a chemická fyzika
• Prerekvizity : NBCM010
• Je neslučitelnost pro: NBCX012
• Je prerekvizitou pro: NBCM318, NBCM008
• Je záměnnost pro: NBCX012

Anotace

čeština

Poslední úprava: prof. RNDr. Marek Procházka, Ph.D. (30.04.2019)

Základní metabolismy (biologická oxidace, metabolismus cukrů, tuků, bílkovin, fotosyntéza, cyklus kyseliny citronové, regulace metabolických pochodů).

angličtina

Poslední úprava: prof. RNDr. Marek Procházka, Ph.D. (30.04.2019)

Basic metabolic pathways (biological oxidation, metabolism of sugars, lipids, proteins, photosynthesis, citric acid cycle, regulation of metabolic processes).

Cíl předmětu

čeština

Poslední úprava: GASKOVA/MFF.CUNI.CZ (14.05.2008)

Úvod do biochemie

angličtina

Poslední úprava: GASKOVA/MFF.CUNI.CZ (14.05.2008)

Introduction in Biochemistry

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (31.10.2019)

Ústní zkouška, požadavky ke zkoušce - v rozsahu sylabu.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (30.10.2019)

Oral exam, exam requirements - in the extent of the syllabus.

Literatura

čeština

Poslední úprava: RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. (14.12.2023)

D.Voet, J.G.Voetová: Biochemie, Victoria publ., Praha, 1995.

Z.Vodrážka: Biochemie, Academia, Praha, 2002.

R.K.Murray, D.A.Bender, K.M.Botham, P.J.Kennelly, V.W.Rodwell, P.A.Weil: Harperova ilustrovaná biochemie, Galén, 2013.

M.Kodíček, O.Valentová, R.Hynek: Biochemie: chemický pohled na biologický svět, 2. vydání, VŠCHT Praha, 2018.

P.Karlson: Základy biochemie, Academia, Praha, 1981.

J.Musil, O.Nováková: Biochemie v obrazech a schematech, Avicenum, Praha, 1990.

Z.Šípal, P.Anzenbacher, P.Pěč, J.Pospíšil, J. Růžička: Biochemie, SPN, Praha, 1992.

P.Klouda: Základy biochemie, Pavel Klouda, Ostrava, 2000.

D.Voet, J.G.Voet: Fundamentals of Biochemistry Life at the molecular LeveL, 5th, Wiley, 2016.

D.L.Nelson, M.M.Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 8th, Macmillan Learning, 2021.

H.R.Horton, L.A.Moran, K.G.Scrimgeour, M.D. Perry, J.D. Rawn: Principles of Biochemistry, 5th, Pearson Education, Inc., 2011.

J.L.Tymoczko, J.M.Berg, L.Stryer: Biochemistry, 9th, W. H. Freeman, 2019.

T.M.Devlin: Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 7th, John Wiley & Sons, 2010.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. (14.12.2023)

D.Voet, J.G.Voet: Fundamentals of Biochemistry Life at the molecular LeveL, 5th, Wiley, 2016.

D.L.Nelson, M.M.Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 8th, Macmillan Learning, 2021.

H.R.Horton, L.A.Moran, K.G.Scrimgeour, M.D. Perry, J.D. Rawn: Principles of Biochemistry, 5th, Pearson Education, Inc., 2011.

J.L.Tymoczko, J.M.Berg, L.Stryer: Biochemistry, 9th, W. H. Freeman, 2019.

T.M.Devlin: Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 7th, John Wiley & Sons, 2010.

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: GASKOVA/MFF.CUNI.CZ (14.05.2008)

kurzovní přednáška

angličtina

Poslední úprava: GASKOVA/MFF.CUNI.CZ (14.05.2008)

basic course

Požadavky ke zkoušce

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (31.10.2019)

Požadavky ústní zkoušky jsou v rozsahu zveřejněného sylabu přednášky.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (31.10.2019)

Oral exam requirements are within the scope of the lecture syllabus.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: T_FUUK (24.05.2004)

Historický vývoj biochemie. Úvod do metabolismu: Termodynamika života, Metabolické dráhy, Experimentální přístup ke studiu metabolismu, Termodynamika fosfátových sloučenin, Oxidačně-redukční reakce.

Metabolismus cukrů. Glykolýza: Glykolytická dráha, Glykolytické reakce, Fermentace ? anaerobní odbourávání pyruvátu, Regulace metabolického toku, Metabolismus dalších hexos.

Další metabolické dráhy sacharidů. Glukoneogeneze, Glyoxalátová dráha, Biosyntéza oligosacharidů a glykoproteinů, Pentosový cyklus.

Citrátový cyklus. Přehled cyklu, Metabolické zdroje acetylkoenzymu A, Enzymy citrátového cyklu, Regulace citrátového cyklu, Amfibolická povaha citrátového cyklu.

Membránový transport. Termodynamika transportu, Kinetika a mechanismy transportu, Primární aktivní transport, Sekundární aktivní transport.

Transport elektronů a oxidační fosforylace. Mitochondrie, Transport elektronů, Oxidační fosforylace, Regulace tvorby ATP.

Fotosyntéza. Chloroplasty, Reakce závislé na světle, Reakce probíhající bez přímé účasti světla.

Exprese a přenos genetické informace. Replikace: DNA ? nositel genetické informace,

Replikace DNA: základní přehled, Replikační enzymy. Transkripce: Úloha RNA při syntéze proteinů, RNA-polymerasa, Regulace transkripce, Posttranskripční úpravy. Translace: Genetický kód, Transferová RNA, Ribosomy, Regulace translace, Posttranslační modifikace.

angličtina

Poslední úprava: T_FUUK (24.05.2004)

History of biochemistry. Introduction to metabolism: thermodynamics of living systems, metabolic pathways, experimental approaches to metabolic studies, thermodynamics of phosphate compounds, oxidation-reduction reactions.

Saccharide metabolism. Glycolysis:The glycolytic pathway, Glycolytic reactions, Fermentation ? anaerobic pyruvate degradation, Regulation of metabolic flux, Metabolism of other hexoses.

Other pathways of saccharide metabolism. Gluconeogenesis, Glyoxylate pathway, Biosynthesis of oligosaccharides and glycoproteins, Pentose cycle.

Citrate cycle. Overview, Metabolic sources of acetyl-coenzyme A, Citrate cycle enzymes, Citrate cycle regulation, Amphibolic nature of the citrate cycle.

Membrane transport.Transport thermodynamics, Transport kinetics and mechanisms, Primary active transport, Secondary active transport.

Electron transport and oxidative phosphorylation. Mitochondria, Electron transport, Oxidative phosphorylation, Regulation of ATP production.

Photosynthesis. Chloroplasts, Light-dependent reactions, Reactions taking place without direct participation of light.

Expression and transfer of genetic information. Replication: DNA ? the carrier of genetic information, DNA replication: an overview, Replication enzymes. Transcription: Role of RNA in protein synthesis, RNA polymerase, Transcription regulation, Post-transcription modifications. Translation: Genetic code, Transfer RNA, Ribosomes, Translation regulation, Post-translation modifications.