R a Python v geovědách - MZ330P132

• Anglický název: R and Python in Geosciences
• Český název: R a Python v geovědách
• Zajišťuje: Katedra fyzické geografie a geoekologie (31-330)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/2, Z [HT]
• Počet míst: 20
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština, angličtina
• Vysvětlení: do 2022/23 název Aplikace R a Python ve fyzické geografii
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D.
• Vyučující: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D.; doc. Mgr. Jan Kropáček, Ph.D.; Mgr. Ondřej Ledvinka, Ph.D.; RNDr. Jan Tumajer, Ph.D.

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.02.2024)

Kurz si klade za cíl seznámit posluchače se základy použití programovacích jazyků R a Python v geovědách. Na vytipovaných příkladech si studenti procvičí hlavní možnosti a způsoby zpracování dat, které jsou pro geovědy typické. Jedná se hlavně o načítání velkých objemů dat (např. časových řad, prostorových dat), jejich základní statistické zpracování (korelace, regrese, trendy v časových řadách, interpolace, jednoduché a smíšené lineární modely) a vizualizaci.
Hlavními tématy jsou 1) zpracování a statistická analýza časových řad v hydrologii a klimatologii, 2) modelování vybraných hydrologických procesů, 3) úvod do jednoduchých a smíšených lineárních modelů, 4) hodnocení míry prostorové autokorelace v datech, 5) analýza hlavních komponent, 6) použití jazyka Python v DPZ. Součástí cvičení bude i “coding club”, na kterém mohu studenti s vyučujícími konzultovat možnosti zpracování svých vlastních dat (např. k diplomové práci).
Kurz je určen především studentům navazujících magisterských oborů Fyzická geografie a geoekologie, Hydrologie a hydrogeologie, ale také bakalářských oborů Fyzická geografie a geoinformatika a Geografie a kartografie.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.02.2024)

The objective of the course is to provide students with basic principles of using R and Python programming languages in geosciences. Students will learn and practise the most common principles of data assessment typical for geoscience applications based on selected exercises, such as working with large data sets (time series, spatial data), its basic statistical evaluation (correlation, regression, trends in time series, interpolation) and visualisation.
The course is focused on 1) assessment and statistical analysis of hydrological and climatological data, 2) modelling selected hydrological processes, 3) linear models, 4) methods of quantification of spatial autocorrelation, 5) principal component analysis, and 5) using of Python in remote sensing. A part of the course will also be a “coding club”, which enables students to discuss with lecturers their data and codes used for their final theses.
The course is intended mainly for master students of Physical geography and geoecology, Hydrology and hydrogeology, as well as for bachelor students of Physical geography and geoinformatics and Geography and Cartography.

Literatura

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.05.2021)

• https://www.r-project.org/about.html
• Slater, L. J., Thirel, G., Harrigan, S., Delaigue, O., Hurley, A., Khouakhi, A., Prosdocimi, I., Vitolo, C., and Smith, K.: Using R in hydrology: a review of recent developments and future directions, Hydrol. Earth Syst. Sci., 23, 2939-2963, doi: 10.5194/hess-23-2939-2019, 2019.
• https://www.python.org/
• https://stackoverflow.com/

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (30.01.2023)

• https://www.r-project.org/about.html
• Slater, L. J., Thirel, G., Harrigan, S., Delaigue, O., Hurley, A., Khouakhi, A., Prosdocimi, I., Vitolo, C., and Smith, K.: Using R in hydrology: a review of recent developments and future directions, Hydrol. Earth Syst. Sci., 23, 2939-2963, doi: 10.5194/hess-23-2939-2019, 2019.
• https://www.python.org/
• https://stackoverflow.com/

Požadavky ke zkoušce

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.02.2022)

• Aktivní účast na cvičeních
• Odevzdání dokončených, funkčních (a komentovaných) skriptů a jejich výsledků (např. vizualizací).

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (30.01.2023)

• active attendance on lectures
• finishing homework assignments (scripts and their potential results, such as visualisations)

Sylabus

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.02.2024)

• Nejdůležitější informace a sylabus najdete na: https://docs.google.com/document/d/1YdLzcs8L-_NV9nyGq-9VulAS_uojRAnMN37l7JSDRN8/ (nutné přihlášení do fakultního účtu).

• Primární platformou pro běžnou komunikaci s posluchači a pro odevzdávání a hodnocení úkolů bude Google Classroom. V něm také budou uložený případné studijní materiály.

• V LS 2024 bude kurz vyučován v angličtině

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Michal Jeníček, Ph.D. (07.02.2024)

• Basic course information and syllabus at: https://docs.google.com/document/d/1YdLzcs8L-_NV9nyGq-9VulAS_uojRAnMN37l7JSDRN8/ (faculty account needed)

• The primary form of common communication is Google Classroom. This virtual platform will be used for sharing the course materials and homework assignments.