Základy praktické bioinformatiky - GDXP09

• Anglický název: Introduction to applied bioinformatics
• Zajišťuje: Katedra biochemických věd (16-16160)
• Fakulta: Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
• Platnost: od 2019
• Semestr: oba
• Body: 0
• E-Kredity: 0
• Způsob provedení zkoušky: ústní
• Rozsah, examinace: 0/0, Zk [HT]
• Počet míst: zimní:neurčen / neurčen (neurčen); letní:neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je určen pouze pro doktorandy; předmět lze zapsat v ZS i LS
• Garant: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.
• Záměnnost : GDPX09
• Je záměnnost pro: GDPX09

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Bioinformatika je mezioborová disciplína zabývající se ukládáním, tříděním, analýzou a interpretací souborů biologických dat. V rámci předmětu Základy praktické bioinformatiky se studenti dozvědí o možnostech využití dostupných bioinformatických databází a programů. Prakticky se studenti naučí vyhledávat informace a sekvenční data a seznámí se s možnostmi jejich využití. Tento předmět je založen hlavně na praktické práci u počítače a samostatném vyzkoušení různých webových aplikací. Probíraná témata zahrnují: vyhledávání literatury, databáze proteinových a nukleotidových sekvencí, porovnávání sekvencí a analýza jejich vlastností, hledání podobných sekvencí, restrikční analýza, návrh primerů, specializované databáze atd.

angličtina

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Bioinformatics is an interdisciplinary field of science dealing with the storage, classification, analysis, and interpretation of biological data. In the subject Introduction to Applied Bioinformatics, students learn about possibilities of how to find and use bioinformatics databases and tools. This subject is focused mainly on practical usage and training of various web-based programs and software tools. Topics include scientific literature search, protein and nucleotide sequences databases, sequences comparison and their feature analysis, restriction analysis, primer design, specialized databases, etc.

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

"Písemná" zkouška u počítače. Praktické splnění zadaných úkolů.

angličtina

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Practical test by computer of practical knowledge of the subject with the possibility to use gained materials.

Literatura

čeština

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Doporučená:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..

angličtina

Poslední úprava: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Recommended:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..