VP - Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky - DV01056

• Anglický název: OS - Data analysis in R and selected topics in statistics
• Zajišťuje: Klinika dětské hematologie a onkologie (13-462)
• Fakulta: 2. lékařská fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: letní
• Body: 3
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/20, Z [HS]
• Počet míst: neurčen / 10 (10)
• Minimální obsazenost: 3
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán; povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. MUDr. Lucie Šrámková, Ph.D.

Anotace

Poslední úprava: Zdeněk Procházka (16.09.2021)

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své kariéry strávili vědeckou prací. Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní znalosti prostředí a jazyka R. Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2) moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a zobrazení dat. Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce, grafické modely, Simpsonův paradox a kausalita,... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Zdeněk Procházka (16.09.2021)

vyřešení alespoň 2 domácích úkolů + absolvování alespoň jednoho opakovacího semináře (aktivně, kus funkčního kódu)

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: Stanislava Palowska (14.09.2021)

žádné požadavky, předmět zakončen zápočtem

Sylabus

Poslední úprava: Iva Růžičková (27.07.2023)

Název studijního předmětu: Analýza dat v R a vybrané kapitoly ze statistiky

Název studijního předmětu - anglicky: Data analysis in R and selected topics in statistics

Předmět je určen doktorandům a všem studentům pregraduálního studia, kteří uvažují, že by část své

kariéry strávili vědeckou prací. Kurz navazuje na seminář “Uvedení do R a analýzy dat”. Tento předmět není

formální prerekvizitou a studenti si mohou kurz zapsat samostatně, předpokládají se nicméně základní

znalosti prostředí a jazyka R. Cílem kurzu je vyložit některé analytické metody často používané v moderním

biomedicínském výzkumu a naučit je prakticky aplikovat. Témata a hloubka do jaké se jim věnujeme je

volena do značné míry podle odborného zájmu posluchačů. Základní témata: 1) pravděpodobnost, 2)

moderní regresní metody (lineární a zobecněné lineární modely, analýza přežívání), 3) transformace a

zobrazení dat.

Rozšiřující témata (podle zájmu posluchačů): analýza dat v průtokové cytometrii, sekvenovaní nové

generace, expresní profilování, analýza časových řad, metody se smíšenými efekty, dimenzionální redukce,

umělé neuronové sítě, ... Po domluvě lze zařadit další témata podle zájmu.

Garant: prof.Starý

Odpovědná osoba: doc. Šrámková

Typ předmětu: volitelný

Rozsah studijního předmětu: 2 hodiny týdně, 10 týdnů

Začátek: 21.2. - 22.5.2024 každý týden ve středu (nebo dle dohody), 14:00 - 15:30

Určeno pro ročníky: PGS a 1.-6. pregraduální

Počet studentů: 3-10

Způsob zakončení: Zápočet

Místo konání: budova "nová onkologie"