IIA - Mikrobiologie - CTBSMB13

• Anglický název: IIA - Microbiology
• Zajišťuje: Ústav mikrobiologie 3. LF UK, FNKV a SZÚ (12-MIK)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2016
• Semestr: zimní
• Body: 3
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:27/45, Jiné [HS]
• Rozsah za akademický rok: 72 [hodiny]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Další informace: http://old.lf3.cuni.cz/mikrobiologie/index.htm
• Garant: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc.
• Kategorizace předmětu: Lékařství > Teoretické předměty
• Atributy: Modul IIA

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

Dílčí kurz modulu IIA. Cílem oboru je seznámit studenty se základními vlastnostmi patogenních bakterií, virů a mykoorganismů, parazitárních prvoků a dalších parazitů. Zabývá se jejich biologickými vlastnostmi se zaměřením na mechanismy přenosu a patogenního působení těchto organismů, mechanismy jejich rezistence k antimikrobním látkám, metodami laboratorního průkazu miroorganismů, stanovením jejich citlivosti k antimikrobním látkám, odběrem infekčního materiálu od pacienta, interpretací výsledku laboratorního vyšetření. Zabývá se i běžnou slizniční flórou a jejím významem. Informace pro studnety jsou na http://old.lf3.cuni.cz/mikrobiologie/index.htm .

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

Component of module IIA. Medical microbiology deals with microorganisms and their effects on human health. The informations for students are available on http://old.lf3.cuni.cz/ustavy/mikrobiologie/engl/index.html

Cíl předmětu

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

Cílem je získaní vědomostí o jednotlivých významných původcích exogenních i endogenních infekcí, o způsobech odběru a zpracování infekčních vzorků, o způsobech diagnostiky, léčby a prevence infekčních stavů z hlediska mikrobiologa.

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

The focus of the education is shifted to the microbial pathogenesis and immunology

Literatura

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (29.09.2008)

Učebnice Bednář M. a spol., Lékařská mikrobiologie, Marvil Praha.

Skripta Votava M, Ondrvčík P. Vybrané kapitoly z klinické mikrobiologie. LFMU Brno 2002.

Doplňkové materiály jsou na www stránce ústavu.

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

Murray P, Rosenthal KS, Pfaller MA. Medical Microbiology, fifth ed., Elsevier Mosby 2005, ISBN 0-123-03303-2

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

Přednášky, laboratorní cvičení, www stránky, e-learning. Průběžné ověřovací testy.

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

The education includes lectures and laboratory practicals. Individual learning is also essential. The students demonstrate their knowledge at 3 written multiple choice tests during the semester. The students should take part in the weekly laboratory practicals with a good background knowledge of the topics involved. Students must attend the practicals in accordance with the guidelines of the faculty. Students with excess absence and/or students who have not improved on their bad test results are not permitted to sit for the module IIA exam. The students should prepare notes on their work and results at the laboratory practicals.

Požadavky ke zkoušce

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (28.09.2010)

Výuka mikrobiologie v modulu IIA se skládá z přednášek a praktických laboratorních cvičení.

Účast na výuce v rozsahu daném aktuální vyhláškou děkana je podmínkou k připuštění ke zkoušce z modulu.

Na praktických cvičeních se vyžaduje aktivní účast založená na přípravě.

Základním studijním materiálem jsou učebnice Bednář a spol., Lékařská mikrobiologie, Marvil Praha a skripta Votava, Ondrovčík, Vybrané kapitoly z klinické mikrobiologie, MU - Lékařská fakulta Brno, 2002

Přednášky se vztahují k obsahu učebnic, jsou koncipovány jako jejich doplněk.

Zápočet z mikrobiologie dostane student, který se aktivně zúčastní obecně vyžadovaného laboratorních cvičení z mikrobiologie a který úspěšně absolvuje tři průběžné písemné ověřovací testy z obsahu učebnice mikrobiologie a z přednesené látky. Neúspěch v testu je řešen ústním přezkoušením z příslušné látky jednotlivých testů nebo opakovaným testem.

Studenti Přírodovědecké fakulty, kteří mají zapsán obor Lékařská mikrobiologie, absolvují identické ověřovací testy, které nahradí zkoušku a z nichž bude (s přihlédnutím k výsledku pohovoru o náplni praktických cvičení a o obsahu skript Votava, Ondrovčík: Základy klinické mikrobiologie) stanovena jejich celková známka. Studenti Přírodovědecké fakulty praktikují společně s mediky pouze v potřebném rozsahu dle jejich stávajících vědomostí (účast pro ně není povinná).

Praktická cvičení nelze nahradit z jiných, než z doložených a obecně uznávaných důvodů (nemoc, vážná rodinná událost, zkouška, reprezentace fakulty apod.). Studentům, kteří se nestačili zapsat, se doporučuje praktikovat s jejich původními studijními skupinami i bez zápisu.

Hrubé nedostatky v průběžné přípravě na laboratorní cvičení mohou být důvodem neuznání přítomnosti studenta. Nahrazování nepřítomnosti na laboratorním cvičení (odůvodněné pouze nemocí, vážnými rodinnými důvody, zkouškou nebo oficiální reprezentací fakulty či univerzity) je možné pouze v den, kdy probíhá shodné téma.

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (28.09.2010)

The course includes lectures and laboratory practicals. Individual learning is also essential. The students demonstrate their knowledge at 3 written multiple choice tests during the semester. The students should take part in the weekly laboratory practicals with a good background knowledge of the topics involved. Students must attend the practicals in accordance with the guidelines of the faculty. Students with excess absence and/or students who have not improved on their bad test results are not permitted to sit for the module IIA exam. The students should prepare notes on their work and results at the laboratory practicals.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

ÚVOD DO LÉKAŘSKÉ MIKROBIOLOGIE

0BECNÁ BAKTERIOLOGIE

Cytologie bakterií

Metabolismus bakterií

Růst a množení bakterií

Genetika bakterií

Infekční proces

ANTIINFEKČNÍ IMUNITA

Obecná charakteristika imunitního systému

Genetika imunitních reakcí

Antigeny

Nespecifické obranné reakce

Specifická imunita

Autoimunitní reakce při infekčnich chorobách

Alergické reakce při infekčních chorobách

SPIROCHETY

Treponema

Borrelia

Leptospira

GRAMNEGATIVNÍ FAKULTATIVNĚ - ANAEROBNÍ TYČINKY

Enterobacteriaceae

Vibrionaceae

Aeromonas

Plesiomonas

Pasteurella

Haemophilus

Actinobacillus

GRAMNEGATIVNÍ AEROBNÍ A MIKROAEROFILNÍ TYČINKY

Pseudomonas

Burkholderia

Stenotrophomonas

Acinetobacter

Brucella

Bordetella

Francisella

Legionella

Campylobacter

Helicobacter

GRAMNEGATIVNÍ ANAEROBNÍ TYČINKY

Bacteroides

Prevotella

Porphyromonas

Fusobacterium

Leptotrichia

GRAMNEGATIVNÍ KOKY

Neisseria

Moraxella

Veil1onella

GRAMPOZITIVNÍ KOKY

Staphylococcus

Peptococcus

Streptococcus

Peptostreptococcus

Enterococcus

GRAMPOZITIVNÍ NESPORULUJÍCÍ TYČINKY

Listeria

Erysipelothrix

Rothia

Lactobacillus, Bifidobacterium, Eubacterium

GRAMPOZITIVNÍ SPORULUJÍCÍ TYČINKY

Bacil1us (aerobní)

Clostridium (anaerobní)

AEROBNÍ NEPRAVIDELNÉ A ACIDOREZISTENTNÍ TYČINKY

Corynebacterium

Propionibacterium

Arcanobacterium

Gardnerella

Rhodococcus

Mycobacterium

Actinomyces

Nocardia

RICKETTSIE A PŘÍBUZNÉ MIKROORGANISMY

Rickettsia

Ehrlichia

Bartonella

Coxiella

CHLAMYDIE

MYKOPLAZMY A L -FORMY BAKTERÍ

ANTIBIOTIKA

Mechanismus účinku antibiotik

Rezistence na antibiotika

Vedlejší účinky antibiotik

VIROLOGIE

Obecná virologie

Chemoterapie virových infekcí

Taxonomie virů

DNA VIRY

Poxviry

Herpesviry

Adenoviry

Papovaviry

Parvoviry

RNA VIRY

Picornaviry

Orthomyxoviry

Paramyxoviry

Togaviry

Coronaviry

Arenaviry

Viry hepatitidy

Rhabdoviry

HIV viry

Priony

IMUNIZACE PROTI INFEKČNÍM CHOROBÁM

MYKOLOGIE

Obecná charakteristika

Onemocnění vyvolávaná houbami

Terapie houbových infekcí

PARAZITOLOGIE

Protozoologie

Helmintologie

Entomologie

MIKROBIALNÍ OSÍDLENÍ LIDsKÉHo TĚLA

MIKROBIOLOGIE DUTINY ÚSTNÍ

Sylabus praktických cvičení z lékařské mikrobiologie

1) zásady práce

buněčná morfologie

růst na pevných půdách

fenotypové znaky

2) růst v tekuté půdě

počítání živých mikrobů

konjugace

transformace

3) serologické vyšetřovací metody

4) vyšetření citlivosti na ATB

stanovení MIK

5) vyšetření hladiny ATB v séru

toxiny

6) Enterobacteriaceae I

biochemická identifikace

gramnegativní nefermentující tyčky

7) Enterobacteriaceae II

numerická identifikace

8) stafylokoky

streptokoky

9) Neisseria,

Moraxella,

Haemophilus,

korynebakterie,

listerie,

Bacillus

10) mykobakterie,

Legionella,

Helicobacter,

Borrelia

11) anaerobní bakterie

fungi

12) parazitologie

13) virologie

14) typizace bakterií

15) speciální diagnostické metody

angličtina

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (17.09.2008)

1. Introduction

Basic Principles of Medical Microbiology

2. Bacterial Classification

3. Bacterial Morphology and Cell Wall Structure and Synthesis

4. Bacterial Metabolism and Growth

5. Bacterial Genetics

6. Viral Classification, Structure, and Replication

7. Fungal Classification, Structure, and Replication

8. Parasitic Classification, Structure, and Replication

9. Commensal and Pathogenic Microbial Flora in Humans

10. Sterilization, Disinfection, and Antisepsis

Basic Concepts in the Immune Response

11. Elements of Host Protective Responses

12. The Humoral Immune Response

13. Cellular Immune Responses

14. Immune Responses to Infectious Agents

15. Antimicrobial Vaccines

General Principles of Laboratory Diagnosis

16. Microscopic Principles and Applications

17. Molecular Diagnosis

18. Serologic Diagnosis

Bacteriology

19. Mechanisms of Bacterial Pathogenesis

20. Antibacterial Agents

2l. Laboratory Diagnosis of Bacterial Diseases

22. Staphylococcus and Related Organisms

23. Streptococcus

24. Enterococcus and Other Gram-Positive Cocci

25. Bacillus

26. Listeria and Erysipelothrix

27. Corynebacterium and Other Gram-Positive Bacilli

28. Nocardia and Related Organisms

29. Mycobacterium

30. Neisseria and Related Organisms

31. Enterobacteriaceae

32. Vibrio and Aeromonas

33. Campylobacter, and Helicobacter

34. Pseudomonas and Related Organisms

35. Haemophilus and Related Bacteria

36. Bordetella

37. Francisella and Brucella

38. Legionella

39. Miscellaneous Gram-Negative Rods

40. Anaerobic, Spore-Forming Gram-Positive Bacteria

41. Anaerobic, Non-Spore-Forming Gram-Positive Bacteria

42. Anaerobic Gram-Negative Bacteria

43. Treponema, Borrelia, and Leptospira

44. Mycoplasma, and Ureaplasma

45. Rickettsia and Orientia

46. Ehrlichia, Anaplasma, and Coxiella

47. Chlamydiaceae

48. Role of Bacteria in Disease (jump to chapter 69)

Virology

49. Mechanisms of Viral Pathogenesis

50. Antiviral Agents

51. Laboratory Diagnosis of Viral Diseases

52. Papillomaviruses, and Polyomaviruses

53. Adenoviruses

54. Human Herpesviruses

55. Poxviruses

56. Parvoviruses

57. Picornaviruses

58. Coronaviruses, and Noraviruses

59. Paramyxoviruses

60. Orthomyxoviruses

61. Rhabdoviruses Filoviruses, and Bornaviruses

62. Reoviruses

63. Togaviruses and Flaviviruses

64. Bunyaviruses and Arenaviruses

65. Retroviruses

66. Hepatitis viruses

67. Unconvential Slow viruses: Prions

68. Role of viruses in Disease (jump to chapter 79)

Mycology

69. Pathogenesis of Fungal Pathogenesis

70. Antifungal Agents

71. Laboratory Diagnosis of Fungal Diseases

72. Superficial and Cutaneous Mycoses

73. Subcutaneous Mycoses

74. Systemic Mycoses Caused by Endemic Dimorphic Fungal Pathogens

75. Opportunistic Mycoses

76. Fungal and Fungal-like Infections of Unusual and Uncertain

Etiology

77. Mycotoxicoses

78. Role of Fungi in Disease

Parasitology

79. Pathogenesis of Parasitic Disease

80. Antiparasitic Agents

81. Laboratory Diagnosis of Parasitic Disease

82. Intestinal and Urogenital Protozoa

83. Blood and Tissue Protozoa

84. Nematodes

85. Trematodes

86. Cestodes

87. Arthropod

88. Role of Parasites in Disease