Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Kurz Biochemie II je vyučován v zimním i letním semestru 2. ročníku jako součást předmětu Modul IA - Struktura a funkce lidského těla. Navazuje na kurz Biochemie I, který je součástí stejného předmětu, jehož výuka probíhá v letním semestru 1. ročníku.
V kurzu Biochemie II je probírána funkční biochemie ve čtyřech samostatných celcích: 1) Kardiovaskulární systém a 2) Endokrinní systém (v zimním semestru), 3) Nervový systém I, řízení motoriky a 4) Nervový systém II, smyslové orgány (v letním semestru). Výuka je integrována s paralelně probíhající výukou fyziologie, histologie a anatomie, týkající se stejných témat.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
Biochemistry II is taught in the winter and summer semesters of the second year as a part of Module IA. It builds on Biochemistry I, part of the same module, which is taught in the summer semester of the first year. Biochemistry II deals with functional biochemistry in four major areas: 1) Cardiovascular system and 2) Endocrine system (winter semester), 3) Nervous system I, motor control and 4) Nervous system II, sensory organs (summer semester). This course is integrated with parallel courses of physiology, histology and anatomy of the same systems.
Cíl předmětu -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Cílem kurzu Biochemie II je poskytnout studentům biochemický pohled na kardiovaskulární, endokrinní a nervový systém.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
This course aims to provide students with an understanding of the biochemistry of the cardiovascular, endocrine and nervous systems.
Literatura -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
BIOCHEMIE - česky * František Duška, Jan Trnka: Biochemie v souvislostech - Díl I - Základy energetického metabolizmu (Karolinum 2006) ISBN 80-246-1116-3 * Miroslav Ledvina, Alena Stoklasová, Jaroslav Cerman: Biochemie pro studující medicíny I. a II. díl (Karolinum 2004) ISBN 80-246-0851-0 * Robert K. Murray a kol.: Harperova biochemie (1998) ISBN 80-85787-38-5 * Zdeněk Vodrážka: Biochemie - 2. přepracované vydání (Academia 1999) ISBN 80-200-0600-1 * Jan Musil, Olga Nováková: Biochemie v obrazech a schématech (Avicenum 1989), bez ISBN * Milan Kodíček: Biochemické pojmy výkladový slovník (VŠCHT Praha 2004) ISBN 80-7080-551-X volně na http://vydavatelstvi.vscht.cz/knihy/uid_es-002_v1/
BIOCHEMIE - anglicky * Pamela C. Champe, Richard A. Harvey: Lippincott´s Illustrated Reviews - Biochemistry, ISBN 0-397-51091-8 * Jan Koolman, Klaus-Heinrich Röhm: Color Atlas of Biochemistry, Thieme, Stuttgard, 1996, ISBN 3-13-100371-5 * J.G.Salway: Metabolism at a Glance, 2nd ed., Blackwell Science Ltd, 1999, ISBN 0-632-05274-0 * Thomas M. Devlin et al.: Textbook of Biochemistry With Clinical Correlations, 4th ed., ISBN 0-471-15451-2
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
Murray, Robert K.: Harper´s biochemistry, 24th ed. (or the other),1996, ISBN 0838563115
Pamela C. Champe, Richard A. Harvey: Lippincott´s Illustrated Reviews - Biochemistry, ISBN 0-397-51091-8
Jan Koolman, Klaus-Heinrich Röhm: Color Atlas of Biochemistry, Thieme, Stuttgard, 1996, ISBN 3-13-100371-5
J.G.Salway: Metabolism at a Glance, 2nd ed., Blackwell Science Ltd, 1999, ISBN 0-632-05274-0
Thomas M. Devlin et al.: Textbook of Biochemistry With Clinical Correlations, 4th ed., ISBN 0-471-15451-2
Metody výuky -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
zimní semestr: přednášky (4 x 2 hod.), semináře (3 x 3 hod.), integrační konference (2 x 5 hod.), tj. celkem 27 hodin.
letní semestr: přednášky (4 x 2 hod.), semináře (3 x 3 hod.), integrační konference (2 x 5 hod.), tj. celkem 27 hodin.
Celkem: 54 hodin výuky za oba semestry
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
winter semester: lectures (4 x 2 hours), seminars (3 x 3 hours), integrated conferences (2 x 5 hours), altogether 27 hours.
summer semester: lectures (4 x 2 hours), seminars (3 x 3 hours), integrated conferences (2 x 5 hours), altogether 27 hours
Altogether: 54 hours / second year
Požadavky ke zkoušce -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (26.09.2011)
Tento kurz je ukončen v zimním i letním semestru udělením samostatného subzápočtu (kolokvia), který je nezbytný k získání celkového zápočtu z předmětu Modul IA - Struktura a funkce lidského těla (v obou semestrech). Zkouška z Modulu IA se koná na konci 2. ročníku.
PODMÍNKY UDĚLENÍ SUBZÁPOČTU
v zimním semestru: přezkoušení z biochemie hormonů - zkouší se veškerá látka z biochemie hormonů probraná ve 3. semestru, učivo navazuje na znalosti biochemie získané v 1. ročníku; termíny oznámí svému kruhu kroužkový asistent koncem zimního semestru - zkouší se ve zkouškovém období
v letním semestru: ústní přezkoušení z biochemie - požadována je základní znalost biochemických vztahů probíraných během výuky biochemie v 1. i 2. ročníku, seznam požadovaných znalostí je uveden níže; termíny zkoušení vypisuje kroužkový asistent během letního semestru - zkoušet se začíná od posledního březnového týdne
Každý student může být přezkoušen maximálně 3x v každém semestru, studenti jsou povinni dostavit se na zkoušení ve vypsaných termínech.
ZAPISOVÁNÍ SUBZÁPOČTŮ DO INDEXŮ Subzápočty z kurzu IA -Biochemie II zapisují do indexu pouze asistenti, nikoli lektoři. O termínech zapisování subzápočtů budou studenti informováni na nástěnce chemie (ve 4. patře fakulty), v případě ústního zkoušení je zápočet zapisován do indexu ihned po úspěšném přezkoušení. Přiřazení kruhů k jednotlivým asistentům je následující:
Hana Logerová (pracovna 617): kruhy 1,11,2,12,3,13,4,14
Aminokyseliny a proteiny (klasifikace, struktura, trávení a resorpce, funkce a obecné vlastnosti aminokyselin a proteinů, ornithin a citrulin, zdroj plazmatických proteinů)
Metabolismus aminokyselin a proteinů (proteázy, syntéza neesenciálních AMK, odbourávání všech AMK: transaminace, deaminace, dekarboxylace, biogenní aminy - monoaminy; glukogenní a ketogenní aminokyseliny, metabolismus amoniaku, močovinový cyklus)
Biochemie svalové buňky (zdroje energie, svalová kontrakce, myoglobin)
Biosyntéza a degradace hemu (lokalizace v buňce a v organismu, regulace, porfyriny, hemoproteiny, bilirubin - transport, metabolismus, exkrece)
Metabolismus erytrocytu (energetický metabolismus, transport krevních plynů, antioxidační mechanismy v erytrocytu, struktura a funkce hemoglobinu, deriváty hemoglobinu)
Oxidační stres (tvorba reaktivních forem kyslíku a dusíku, jejich význam a vlastnosti, antioxidační systémy)
Dýchání (transport O2 a CO2 v krvi, formy CO2 v organismu, význam O2 pro buňku, saturační křivka hemoglobinu, faktory ovlivňující saturaci)
Vnitřní prostředí a ABR (udržování stálého pH, iontové složení extra- a intracelulární tekutiny, pufry, úloha plic a ledvin v udržování ABR, poruchy ABR)
Složení krevní plazmy (nízko- a vysokomolekulární látky, jejich, původ, význam a osud; osmotický tlak)
Proteiny krevní plazmy (klasifikace, funkce, rozdíl mezi sérem a plazmou, elektroforéza, onkotický tlak)
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (26.09.2011)
This course ends with sub-credits (colloquia) in both the winter and summer semesters, which are required to receive credit for the whole Module IA (in both semesters). Modulu IA exam takes place at the end of the second semester.
REQUIREMENTS FOR SUB-CREDIT
winter semester: exam from biochemistry of hormones taught in the 3rd semester including relevant knowledge from the first year, dates will be announced by each group´s teacher - examined in the exam period
summer semester: exam from all of biochemistry - from both first and second years, see below for a list of required topics; dates will be organised by each group´s teacher during the summer semester - examination usually starts from the last week in March
Every student can be examined three times at the most and students must attend scheduled exams.
SIGNING SUB-CREDITS INTO CREDIT BOOK (INDEX) Dates for signing Module IA subcredit for the Biochemistry II course in the Index will be posted on the chemistry notice board on level 4. The following teachers are responsible for signing the Index for the following groups:
Pavla Balínová (room 409): groups 1 and 2
Josef Fontana (room 410): groups 3 and 4
REQUIREMENTS FOR SUB-CREDIT EXAMINATION IN THE SUMMER SEMESTER
Enzymes (classification, structure, coenzymes, cofactors, zymogens, isoenzymes, examples of enzymes, regulation of enzyme activity)
Vitamins (classification, importance in metabolism, relationship to coenzymes)
Saccharides (classification, structure, digestion and resorption, fibre, functions in organism, maintenance of glycemia)
Metabolism of saccharides (glycolysis, pentose-phosphate cycle, gluconeogenesis, metabolism of glycogen, regulation of the saccharide metabolism on the cell level)
Lipids (classification, structure, digestion and resorption, importance: fatty acids, triacylglycerols, phospholipids, glycolipids, cholesterol and steroids)
Metabolism of lipids (transport in plasma - lipoproteins, ?-oxidation, ketogenesis, fatty acids synthesis, synthesis of cholesterol, bile acids)
Amino acids and proteins (classification, structure, digestion and resorption, function and general properties of amino acids and proteins in organism, ornithine a citrulline, origin of plasmatic proteins)
Metabolism of amino acids (AAs) and proteins (proteases, synthesis of nonessential AAs, degradation of all proteinogenic AAs: transamination, deamination, decarboxylation, bioegenic amines - monoamines; glucogenic and ketogenic AAs, metabolism of ammonia, urea cycle)
Biochemistry of muscle cell (energy sources, muscle contraction, myoglobin)
Biosynthesis and degradation of heme (cellular and body localization, regulation, porphyrins, hemoproteins, bilirubin - transport, metabolism, excretion)
Biochemistry of erythrocyte (energy metabolism, transport of blood gases, antioxidative systems, hemoglobin - structure and function, derivatives)
Oxidative stress (formation of reactive oxygen and nitrogen species - their importance and properties, antioxidative systems)
Respiration (transport of O2 and CO2 in blood, forms of CO2, function of O2 in a cell, saturation curve of hemoglobin, factors effecting the affinity of hemoglobin to oxygen)
Internal environment and acid-base balance /ABB/ (maintaining stable pH, ionic composition of extra- and intracellular fluid, buffers, role of the kidney and the lungs in maintaining ABB, ABB disorders)
Composition of blood plasma (low- and high molecular mass compounds - their origin, importance and fate; osmotic pressure)
Proteins of blood plasma (classification, function, difference between serum and plasma, electrophoresis, oncotic pressure)
Metabolism of iron (absorption, transport, storage, importance)
Sylabus -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
zimní semestr
PŘEDNÁŠKY 1) Biochemie srdce a cévního systému Konference: srdce, krevní oběh 2) Metabolismus hormonů (syntéza, odbourávání) 3) Endokrinní funkce pankreatu a GIT 4) Kůže, kost a tuková tkáň Konference: endokrinní a imunitní systém
SEMINÁŘE 1) Zásahy hormonů do metabolismu 2) Biochemie zvláštních situací 3) Metabolismus matky a dítěte
letní semestr
PŘEDNÁŠKY 1) Energetický metabolismus CNS, likvor 2) Syntéza a odbourávání neurotransmiterů 3) Vliv chemických látek na chování člověka Konference: nervový systém I, řízení motoriky 4) Biochemie smyslového vnímání Konference: nervový systém II, smyslové orgány
SEMINÁŘE 1) Biochemie v medicíně, interpretace laboratorních hodnot 2) Poznámky ke zkoušce I 3) Poznámky ke zkoušce II
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
winter semester
LECTURES 1) Biochemistry of the heart and blood vessels Conference: circulatory system 2) Metabolism of hormones (synthesis and degradation) 3) Endocrine function of pancreas and GIT 4) Skin, bone, adipose tissue Conference: immunity and endocrine system
SEMINARS 1) Hormones in metabolism 2) Exceptional situations - biochemical point of view 3) Metabolism during pregnancy. Newborns.
summer semester
LECTURES 1) Energy metabolism of CNS, cerebrospinal fluid 2) Synthesis and degradation of neurotransmitters 3) Influence of chemical substances on human behaviour Conference: nervous system I, regulation of motor functions 4) Biochemistry of sensory perception Conference: nervous system II, sensory organs
SEMINARS 1) Biochemistry in the medicine 2) Guide to the Module A examination I 3) Guide to the Module A examination II
Vstupní požadavky -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Kurz IA - Biochemie II navazuje na učivo probírané v kurzech IB - Lékařská chemie a biochemie a IA - Biochemie I.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
Course IA - Biochemistry II builds on courses Medical chemistry and biochemistry in Module IB and Biochemistry I in Module IA.
