Předměty

Váš prohlížeč nepodporuje JavaScript nebo je jeho podpora vypnutá. Některé funkce nemusejí být dostupné.

Průkaz infekčního původce ve vyšetřovaném biologickém materiálu pomocí molekulárně-genetických analýz - CCOC5942

Anglický název:	Detection of an infectious agent in biological materials using molecular-genetic analysis
Zajišťuje:	Ústav mikrobiologie 3. LF UK, FNKV a SZÚ (12-MIK)
Fakulta:	3. lékařská fakulta
Platnost:	od 2017
Semestr:	oba
Body:	1
E-Kredity:	1
Způsob provedení zkoušky:
Rozsah, examinace:	0/15, Z [HS]
Rozsah za akademický rok:	15 [hodiny]
Počet míst:	zimní:neurčen / neurčen (6) letní:neurčen / neurčen (6)
Minimální obsazenost:	neomezen
4EU+:	ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu:	ne
Kompetence:
Stav předmětu:	nevyučován
Jazyk výuky:	čeština
Způsob výuky:	prezenční
Způsob výuky:	prezenční
Úroveň:
Poznámka:	předmět lze zapsat v ZS i LS

Garant:	doc. MUDr. Marek Bednář, CSc.

Termíny zkoušek Rozvrh

Anotace -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (10.10.2010)

Během kurzu budou studenti seznámeni s metodami užívanými při průkazu a typizaci původce metodou PCR.

Cíl předmětu -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (14.07.2011)

Během kurzu budou studenti po krátkém teoretickém úvodu prakticky seznámeni s metodami ppoužívanými k detekci specifického úseku genomu původce přítomného v infekčním vzorku.

Literatura -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (10.10.2010)

Před vlastním kurzem si studenti osvojí příslušnou část výukového CD (... průkaz přímý>průkaz genetický).

Metody výuky -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (14.07.2011)

Ústav lékařské mikrobiologie.

Povinně volitelný kurz.

Název kurzu:
Průkaz infekčního původce ve vyšetřovaném biologickém materiálu pomocí molekulárně genetických analýz

Číslo kurzu: 5942, 6942

PVK proběhne v lékařské diagnostické laboratoři afilovaného pracoviště 3. lékařské fakulty UK Vidia Diagnostika pod dohledem pana RNDr Jaroslava Kőniga. Kurz proběhne ve dvou dnech (některý víkend).
Dostupnost: konečná stanice metra B-Černý Most. Pěšky, asi 200m zpět po tubusu metra, výstup prvním schodištěm. Autobusové linky: 141, 386, stanice Poliklinika Cerný Most. Vchod do poliliniky z druhé strany budovy, v sobotu a neděli po ohlášení ve vrátnici, event. na tel č.:605318720, 737852023, vrátnice:728190346. Nutný vlastní pracovní plášť (dodá Ústav lékařské mikrobiologie).

Před vlastním kurzem si studenti osvojí příslušnou část výukového CD (... průkaz přímý>průkaz genetický).

Během kurzu budou studenti po krátkém teoretickém úvodu prakticky seznámeni s metodami:
1) extrakce a purifikace nukleových kyselin z výchozího materiálu (sérum, plasma, moč, stěry) pomocí separačních kolonek nebo paramagneticých částic.
2) reverzní transkripce pro přípravu copy DNA a následnou amplifikaci DNA metodou PCR (endpoint PCR)
3) real time PCR s přímou vizuální detekcí amplifik. produktu změnou hladiny fluorescence, včetně možnosti následného stanovení genotypu z hodnoty MP po kontinuální tep.denaturaci
4) klasické elektroforetické detekce PCR produktu v agarosovém gelu
5) přímé sekvenační analýzy genomu pro určení genotypu pomocí sekvenačního analyzátoru

V druhé části kurzu proběhne závěrečné vyhodnocení a interpretace výsledků.

Během kurzu budou studentům odprezentovány teoretické aspekty prováděných analýz.

Z přístrojů budou použity: Mastercycler (Eppendorf), real time analyzátor Light Cyler 2 (Roche), jedno-kapilárový sekvenátor ABI 310.

Bezpečnost práce s infekčním materiálem bude zajištěna použitím boxů biohazard, pracovním oděvem (plášě dodá Ústav lékařské mikrobiologie) a pracovními rukavicemi (dodáme).

Požadavky ke zkoušce -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (10.10.2010)

Aktivní účast na PVK dle směrnic fakulty.

Sylabus -

Poslední úprava: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (14.07.2011)