Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Kurz Lékařská chemie a biochemie je vyučován v zimním semestru 1. ročníku jako součást Modulu IB - Biologie buňky a genetika. Úvod výuky je věnován obecné chemii, převážná většina kurzu je však zaměřena na základy biochemie - probírána je struktura, vlastnosti a metabolismus látek vyskytujících se v lidském těle. Kurz je zakončen shrnutím regulací biochemických procesů probíhajících na úrovni buňky.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
The course Medical chemistry and biochemistry is taught as a part of the subject Module IB - Cell biology and genetics, it is scheduled during 1st semester only. The course opens with a general chemistry, but moust of the teaching is focused on fundamentals of biochemistry - structures, properties and metabolism of coumpounds found in the human body. The course is finished by the summary of regulation of biochemical processes on the cellular level.
Cíl předmětu -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Cílem tohoto kurzu je poskytnou studentovi základy chemie a biochemie pro pochopení procesů probíhajích v lidském těle. Hlavní pozornost je věnována chemickému složení buňky a principům průběhu chemických reakcí. Tyto znalosti poskytují nezbytný základ i pro studium dalších kurzů, které jsou součástí Modulu IB. Znalosti lékařské chemie a biochemie studenti dále využijí i ve vyšších ročnících, např. v kurzu biochemie, který je součástí Modulu IA - Struktura a funkce lidského těla, nebo v kurzech farmakologie, klinické biochemie a řadě dalších.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
The aim of this course is to provide medical students with basic knowledge of chemistry and biochemistry necessary for an understanding of processes taking place in the human body. The main focus is on the chemical composition of cells and principles of chemical reactions. This course provides essential background knowledge for other courses in Module IB. You will also build on facts and skills acquired in this course in later course such as the biochemistry course in Module IA, in pharmacology, clinical biochemistry, etc.
Literatura -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
LÉKAŘSKÁ CHEMIE * Jiří Urban: Lékařská chemie (skripta 3.LF UK 1995) ISBN 80-85121-04-2 * Chemické názvosloví (Karolinum, 1999 nebo později) / D. Hiršová (včetně latinského názvosloví) * Názvosloví organické chemie (Rubico, Olomouc, 2. vyd. 2002, ISBN 80-7346-017-3) / J. Fikr, J. Kahovec (novelizované názvosloví organické chemie) * Praktikum z lékařské chemie a toxikologie (skripta UK, 1994) / Z. Bardoděj, E. Samcová, J. Urban (výpočty, teorie analytických metod) * Chemické principy metod klinické biochemie (Karolinum, 1998) / J. Prokeš, K. Vulterin, B. Černý
BIOCHEMIE - česky * František Duška, Jan Trnka: Biochemie v souvislostech - Díl I - Základy energetického metabolizmu (Karolinum 2006) ISBN 80-246-1116-3 * Miroslav Ledvina, Alena Stoklasová, Jaroslav Cerman: Biochemie pro studující medicíny I. a II. díl (Karolinum 2004) ISBN 80-246-0851-0 * Robert K. Murray a kol.: Harperova biochemie (1998) ISBN 80-85787-38-5 * Zdeněk Vodrážka: Biochemie - 2. přepracované vydání (Academia 1999) ISBN 80-200-0600-1 * Jan Musil, Olga Nováková: Biochemie v obrazech a schématech (Avicenum 1989), bez ISBN * Milan Kodíček: Biochemické pojmy výkladový slovník (VŠCHT Praha 2004) ISBN 80-7080-551-X volně na http://vydavatelstvi.vscht.cz/knihy/uid_es-002_v1/ * Jaroslav Masopust: Patobiochemie buňky, viz. https://www.zdravcentra.cz/cps/rde/xchg/zc/xsl/3141_1387.html
BIOCHEMIE - anglicky * Pamela C. Champe, Richard A. Harvey: Lippincott´s Illustrated Reviews - Biochemistry, ISBN 0-397-51091-8 * Jan Koolman, Klaus-Heinrich Röhm: Color Atlas of Biochemistry, Thieme, Stuttgard, 1996, ISBN 3-13-100371-5 * J.G.Salway: Metabolism at a Glance, 2nd ed., Blackwell Science Ltd, 1999, ISBN 0-632-05274-0 * Thomas M. Devlin et al.: Textbook of Biochemistry With Clinical Correlations, 4th ed., ISBN 0-471-15451-2
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
CHEMISTRY * any secondary school textbook of Chemistry containing both inorganic and organic chemistry
BIOCHEMISTRY * Murray, Robert K.: Harper´s biochemistry,24th ed. (or later), 1996, ISBN 0838563115 * Pamela C. Champe, Richard A. Harvey: Lippincott´s Illustrated Reviews - Biochemistry, ISBN 0-397-51091-8 * Jan Koolman, Klaus-Heinrich Röhm: Color Atlas of Biochemistry, Thieme, Stuttgard, 1996, ISBN 3-13-100371-5 * J.G.Salway: Metabolism at a Glance, 2nd ed., Blackwell Science Ltd, 1999, ISBN 0-632-05274-0 * Thomas M. Devlin et al.: Textbook of Biochemistry With Clinical Correlations, 4th ed., ISBN 0-471-15451-2
Metody výuky -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Přednášky (24 x 2 hod.), semináře (11 x 3 hod.), praktická cvičení (4 x 3 hod.), celkem 93 hodin výuky v 15 výukových týdnech.
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
Lectures (24 x 2 hours), seminars (11 x 3 hours), practicals (4 x 3 hours), altogether 93 hours of teaching during 15 study weeks.
Požadavky ke zkoušce -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (28.04.2011)
Tento kurz je ukončen v zimním semestru udělením subzápočtu (kolokvia), který je nezbytný k získání celkového zápočtu z předmětu Modul IB - Biologie buňky a genetika. Zkouška z Modulu IB se koná až na konci 1. ročníku, v letním semestru však kurz Lékařská chemie a biochemie již vyučován není.
UPOZORNĚNÍ: Na zkoušku z Modulu IB se mohou studenti zapisovat (tj. vybrat si vyhovující termín!) až když mají v indexu zapsány zápočty z Modulu IB za zimní i letní semestr. Z tohoto důvodu doporučujeme splnit požadavky na udělení subzápočtu z lékařské chemie a biochemie již v zimním semestru.
PRAKTIKA Praktika jsou zařazena do rozvrhu od 7. do 10. týdne semestru, řádně vypracované protokoly musí být odevzdány nejpozději do vánočních prázdnin. Podmínkou absolvování praktik je předchozí příprava na každou laboratorní úlohu - studenti jsou během praktika přezkoušeni kroužkovým asistentem. V případě neabsolvování praktika v řádném termínu (dle rozvrhu) je možné praktikum absolvovat v náhradním termínu, který je vypisován ve zkouškovém období, a to pouze v zimním semestru.
TESTY Povolené pomůcky jsou pouze kalkulačka (jen na test 1) a psací pero. V termínech ve zkouškovém období se student prokazuje průkazem totožnosti obsahujícím fotografii (studentský průkaz, občanka, pas, index).
Zápočtový test 1 (chemické výpočty a názvosloví) - píše se v 6. týdnu semestru, termín je uveden v rozvrhu, čas k dispozici: 90 min.; k úspěšnému absolvování testu je nutno získat 70% bodů, forma testu: volná tvorba odpovědi
Zápočtový test 2 (lékařská chemie a biochemie) - píše se ve zkouškovém období, termíny jsou uvedeny v rozvrhu, čas k dispozici: 60 min.; k úspěšnému absolvování testu je nutno získat 60% bodů, forma testu: mnohočetný výběr (multiple-choice)
POČET TERMÍNŮ NA TESTY Každý test je možno psát maximálně 3x, na termíny ve zkouškovém období je nutno přihlásit se předem (studenti se na testy zapisují na nástěnce chemie ve 4. patře). Termíny na testy ve zkouškovém období jsou vypisovány celkem 3 v zimním semestru a 2 v letním semestru - student si z termínů může libovolně vybrat. V jednom dni je možno psát i oba testy (celkový čas k dispozici: 150 min.) Mimo zkouškové období termíny na testy vypisovány nejsou. Pokud někdo neuspěje v testu ani na třetí pokus, dostane ještě jednu příležitost - tento dodatečný termín je však vypisován až po prázdninách (začátkem září).
ZAPISOVÁNÍ SUBZÁPOČTŮ DO INDEXŮ Subzápočet z kurzu IB -Lékařská chemie a biochemie zapisují do indexu pouze asistenti, nikoli lektoři. O termínech zapisování subzápočtů budou ve zkouškovém období studenti informováni na nástěnce chemie (ve 4. patře fakulty). Přiřazení kruhů k jednotlivým asistentům je následující:
Hana Logerová (pracovna 617): kruhy 1,11,2,12,4,14
Jana Matějčková (pracovna 617): kruhy 3,13
Petr Tůma (pracovna 534): kruhy 6,16
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (28.04.2011)
This course ends in the end of the winter semester with a sub-credit (colloquium), which is necessary to get credit for the whole Module IB. The exam in Module IB takes place at the end of the first year but there are no more classes in the course Medical Chemistry and Biochemistry in the summer semester.
NOTE: Students can sign up for the Module IB exam only after they have received credit in Module IB both for the winter and summer semester and have it confirmed in the "Index" book. For this reason we strongly recommend that you fulfill the requirements for the sub-credit in the winter semester.
PRACTICALS Practicals take place from the 7th till the 10th week of the winter semester. Complete reports from practicals must be handed in before the Christmas break at the latest. Adequate theoretical preparation for practicals is required for attending the practical - students are tested before starting their assignment. If you cannot attend a practical an additional opportunity will be scheduled at the end of the winter semester.
TESTS When siting a test you are only allowed a pen and for test 1 a calculator. You will be asked for a photo ID before sitting a test.
Credit test 1 (chemical calculations and nomenclature) - sat in the 6th week of the winter semester as scheduled, time available: 90 min.; pass mark is 70 %; type of test: short answers
Credit test 2 (medical chemistry and biochemistry) - sat in the examination period as scheduled, time available: 60 min; pass mark is 60%; type of test: multiple-choice questions
HOW MANY TIMES YOU CAN SIT A TEST You can sit each test three times at the most. You must sign up beforehand for tests in the exam period: see the chemistry notice board (4th floor). There are three opportunities to sit the tests in the winter semester and two in the summer semester - you can choose any of them. You can sit both tests at the same time (available time 150 min). Those who fail three times will be given a last chance after the summer break (beginning of September).
SIGNING SUB-CREDITS INTO CREDIT BOOKS (INDEX) Dates for signing Module IB subcredit for the Medical chemistry and biochemistry course in the Index will be posted on the chemistry notice board on level 4. The following teachers are responsible for signing the Index for the following groups:
Vladimíra Kvasnicová (room 411): group 3
Hana Logerová (room 617): groups 1 and 4
Jan Trnka (room 410): group 2
Sylabus -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
PŘEDNÁŠKY 1) Struktura atomů a molekul 2) Skupenské stavy látek 3) Termodynamika a chemická kinetika 4) Chemické rovnováhy 5) Struktura a reakce organických látek 6) Struktura a vlastnosti proteinů 7) Enzymy 8) Dýchací řetězec, makroergní fosfáty 9) Citrátový cyklus 10) Struktura a vlastnosti sacharidů 11) Metabolismus sacharidů I 12) Metabolismus sacharidů II 13) Extracelulární matrix 14) Biochemie svalové buňky 15) Struktura a vlastnosti lipidů 16) Struktura a funkce membrán 17) Metabolismus lipidů I 18) Metabolismus lipidů II 19) Metabolismus steroidů 20) Heterocyklické sloučeniny, struktura nukleotidů 21) Metabolismus purinových a pyrimidinových bází 22) Metabolismus aminokyselin 23) Metabolismus tetrapyrolů 24) Regulace biochemických procesů na buněčné úrovni
SEMINÁŘE 1) Od periodické tabulky prvků k chemickému složení buňky 2) Chemické výpočty I (způsoby vyjadřování koncentrace, přepočty koncentrací, osmolarita, ředění) 3) Chemické výpočty II (pH slabých i silných kyselin a zásad, pH pufrů) 4) Základní pojmy lékařské chemie. Významné reakce organických sloučenin, enzymy. 5) Analytické metody (spektrofotometrie, chromatografie, odměrná analýza, potenciometrie) 6) Příprava na praktika, pravidla bezpečnosti práce v laboratoři, práce s laboratorními pomůckami 7) Kompartmentace biochemických procesů v buňce. Regulace aktivity enzymů. 8) Mitochondrie 9) Struktura a metabolismus sacharidů, klinické korelace 10) Struktura a metabolismus lipidů, klinické korelace 11) Metabolismus dusíkatých látek, klinické korelace
PRAKTIKA 1) Spektrofotometrie - Stanovení koncentrace kreatininu v moči 2) Chromatografické metody - TLC, HPLC, GC 3) Odměrná analýza - Stanovení acidity žaludeční šťávy 4) Potenciometrie - Měření pH fosfátového pufru
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
LECTURES 1) Introduction to medical biochemistry 2) Structure of atoms and molecules 3) Thermodynamics and chemical kinetics 4) Chemical equilibriums 5) Structure and reactions of organic compounds 6) Structure and properties of proteins 7) Enzymes 8) Respiratory chain, macroergic phosphates 9) Citric acid cycle 10) Structure and properties of saccharides 11) Metabolism of saccharides I 12) Metabolism of saccharides II 13) Extracellular matrix 14) Biochemistry of muscle cells 15) Structure and properties of lipids 16) Structure and function of membranes 17) Metabolism of lipids I 18) Metabolism of lipids II 19) Metabolism of steroids 20) Heterocyclic compounds, structure of nucleotides 21) Metabolism of purine and pyrimidine bases 22) Metabolism of amino acids 23) Metabolism of tetrapyrrols 24) Regulation of biochemical processes in the cell
SEMINARS 1) From periodic table to chemical composition of cells 2) Chemical calculations I (expression of concentration, conversion of concentrations, osmolarity, dilution) 3) Chemical calculations II (pH of both weak and strong acids and bases, pH of buffers) 4) Basic terms of medical chemistry. Important reactions of organic compounds, enzymes. 5) Analytical methods (spectrophotometry, chromatography, volumetric analysis, potentiometry) 6) Preparation to practical trainings, laboratory safety regulations, laboratory tools 7) Compartmentalization of biochemical processes in cells. Regulation of enzyme activity. 8) Mitochondria 9) Structure and metabolism of saccharides, clinical correlations 10) Structure and metabolism of lipids, clinical correlations 11) Metabolism of nitrogen containing compounds, clinical correlations
PRACTICALS 1) Spectrophotometry - Determination of urine creatinine 2) Chromatography - TLC, HPLC, GC 3) Volumetric analysis - Determination of gastric juice acidity 4) Potentiometry - Measuring of phosphate buffer pH
Vstupní požadavky -
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (30.09.2010)
Znalost středoškolské chemie vyučované na gymnáziu, viz. např.
Jiří Vacík: Přehled středoškolské chemie (SPN 1999, ISBN 80-7235-108-7
Květoslava Růžičková, Bohumír Kotlík: chemie v kostce, přepracované vydání (Fragment 2009), ISBN 80-253-0599-7
Poslední úprava: Mgr. Vladimíra Kvasnicová (03.10.2010)
