Biostatistika - C2VL001

• Anglický název: Biostatistics
• Zajišťuje: Ústav epidemiologie a biostatistiky 3. LF UK (12-EPID)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2022
• Semestr: zimní
• Body: 1
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:8/12, Z [HS]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština, angličtina
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: RNDr. Alena Fialová, Ph.D.; Mgr. Tereza Hrnčiarová, M.Sc., Ph.D.

Anotace

čeština

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (10.12.2019)

Předmět zahrnuje úvod do biostatistiky, principy statistického uvažování, testování a interpretace analýz.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (10.12.2019)

The subject covers introduction to biostatistics, principles of statistical reasoning, testing, and interpretation of the analyses.

Cíl předmětu

čeština

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (27.09.2017)

Předmět je zaměřen na seznámení studentů s principy použití matematicko-statistických metod v medicíně. Vysvětluje principy statistické indukce, základní statistické metody a interpretaci výsledků statistických analýz běžně používaných v lékařské literatuře. Tyto znalosti jsou základem pro správné pochopení principů medicíny založené na důkazech.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (27.09.2017)

The aim of the subject is to familiarize students with the principles of using mathematical and statistical methods in medicine. It explains principles of statistical induction, basic statistical methods and interpretation of results of statistical analyzes commonly used in medical literature. This knowledge is the basis for a correct understanding of the principles of evidence-based medicine.

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (09.11.2022)

Účast na cvičeních - student se zúčastní alespoň čtyř z pěti praktických cvičení.

Zápočtový online test s uzavřenými otázkami. Test bude zahrnovat teoretické otázky a praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů. Je požadováno alespoň 65% správných odpovědí.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (09.11.2022)

Participation in practicals and test. Participation - the student will attend at least four of the five practical exercises. The multiple-choice test will include theoretical questions and practical interpretation of the results of statistical calculations. More than 60 % of the correct answers are required.

Literatura

čeština

Poslední úprava: MUDr. Petr Michenka (23.12.2019)

Hendl, J. Přehled statistických metod. Analýza a metaanalýza dat. 4. vyd. Portál, Praha, 2015

Procházka, B. Biostatistika pro lékaře. Principy základních metod a jejich interpretace s využitím statistického systému R. Karolinum, Praha, 2016

Procházka, B. Stručná biostatistika pro lékaře. Karolinum, Praha, 2015

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (10.12.2019)

KIRKWOOD, B.R. (1992). Essentials of Medical Statistics. Blackwell Scientific Publications, Oxford.

ROSNER, B.A. (1995). Fundamentals of Biostatistics. Duxbury Press, Belmont.

dos SANTOS SILVA, I. (1999). Cancer Epidemiology: Principles and Methods. International Agency for Research on Cancer, Lyon

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: MUDr. Petr Michenka (23.12.2019)

Přednášky, praktika.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (03.12.2019)

Lectures, practicals

Sylabus

čeština

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (09.11.2022)

PŘEDNÁŠKY

1. Statistické pojmy, statistická indukce a testování

Statistika v lékařských vědách

Logika statistického uvažování (pozorování vs. hypotézy)

Důležité kroky při aplikaci statistiky

Typy proměnných

Popisná statistika (charakteristiky polohy a variability)

Pravděpodobnost, rozdělení

Populace - výběr, techniky pořizování výběru

Reprezentativnost výběru

Bodový a intervalový odhad, střední chyba průměru

Interval spolehlivosti

Principy statistického testování

Statistická hypotéza a hladina významnosti

Jednostranné a oboustranné hypotézy

Jednovýběrové, dvouvýběrové a párové testy

Parametrické a neparametrické testy

Testování hypotéz o poloze (t-test, Wilcoxonův test, analýza rozptylu)

Interpretace výsledků statistických analýz

 

2. Statistické metody v medicíně

Kontingenční tabulky (čtyřpolní tabulky), metody pro srovnávání poměrů

Chí-kvadrát test, Fisherův a McNemarův test

Základní typy studií používaných v epidemiologii a odpovídající statistické modely pro jejich hodnocení

Demografické statistiky, míry a poměry

Relativní riziko, poměr šancí, atributivní riziko

Zkreslení, vychýlení, přesnost

Vztah dvou proměnných: korelace, regrese

Pokročilé statistické metody v epidemiologii (logistická regrese, cenzorovaná data, analýza přežití)

Matematické nástroje pro plánování průzkumů a experimentů, určení velikosti výběru

 

PRAKTICKÁ CVIČENÍ

 

1. Základy popisné statistiky: typy proměnných, rozdělení pravděpodobnosti (binomické, Poissonovo, normální), populace a výběr, metody pořizování výběru

Charakteristiky polohy a variability, střední chyba průměru, histogram, bodový a intervalový odhad, interval spolehlivosti

Statistické testy: testování statistických hypotéz, p-hodnota, hladina významnosti

 

2. Statistické testy pro spojité proměnné: parametrické a neparametrické testy, t-test a Wilcoxonův test (jednovýběrový, dvouvýběrový, párový), analýza rozptylu (ANOVA), F-test

Statistický software

 

3. Statistické testy kategoriálních proměnných: kontingenční tabulka, chí-kvadrát test, McNemarův test

Statistické metody v epidemiologii: epidemiologické míry rizika a odpovídající intervaly spolehlivosti, zkreslení, interpretace

 

4. Statistické metody v epidemiologii: vyhodnocení údajů ze surveillance a registrů, diagnostické a screeningové testy

Plánování průzkumů: síla statistického testu, stanovení velikosti výběru, chyby I. a II. druhu

 

5. Regresní analýza: korelace, lineární regrese, mnohonásobná regrese, logistická regrese, test trendu

Analýza přežití: klinické studie, Kaplanova-Meierova křivka, log-rank test, Coxův model proporcionálního rizika

Praktické využití statistiky: statistika v publikovaných článcích s lékařskou tématikou, diskuse o statistických metodách, výběr statistického testu

Závěrečný test

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (03.12.2019)

LECTURES

 

1. Statistical concepts and terms, statistical inference

Statistics in medical sciences

Logic of statistical reasoning (observations vs. hypotheses)

Important steps in the application of statistics

Types of variables

Descriptive statistics (characteristics of location and variability)

Probability, distribution

Population - sample, sampling techniques

Representativity of the sample

Point and interval estimation, standard error

Confidence interval

Principles of statistical testing

Statistical hypothesis and significance level

One-sided and two-sided hypotheses

One-sample, two-sample, and paired tests

Parametric and nonparametric tests

Testing hypotheses concerning the location (t-test, Wilcoxon test, analysis of variance)

Interpretation of results of statistical procedures

 

2. Statistical  methods in medical research

Contingency and 2-by-2 tables, methods for comparison of proportions

Chi-square test, Fisher’s and McNemar’s tests

Basic types of studies used in epidemiology and related statistical models for their evaluation

Vital statistics, rates and ratios

Odds ratio, relative risk, attributable risk

Confounding, bias, precision

Association between two variables: correlation, regression

Advanced statistical methods in epidemiology (logistic regression, censored data, survival analysis)

Mathematical tools for planning surveys and experiments, sample size determination

 

 PRACTICALS

     

1. Statistical concepts: types of variables, probability distribution (binomial, Poisson, normal), population and sample, sampling methods, characteristics of location and variability, standard error, histogram, point and interval estimation, confidence interval

2. Statistical inference: testing statistical hypotheses, p-value, significance level

Statistical tests for continuous variables: parametric and nonparametric tests, t-test and Wilcoxon test (one-sample, two-sample, paired), analysis of variance (ANOVA), F-test

3. Statistical tests for categorical variables: contingency table, chi-square test, McNemar’s test

Statistical methods in epidemiology: epidemiological measures of risk and corresponding confidence intervals, confounding, interpretation, evaluation of data from surveillance and registries

4. Statistical association: correlation, linear regression, logistic regression

Survival analysis: clinical trials, Kaplan-Meier curve, log-rank test

Planning surveys: power of statistical test, sample size determination, type I and type II errors

Practical use of statistics: statistics in published medical papers

Credit test

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (09.11.2022)

Účast na cvičeních - student se zúčastní alespoň čtyř z pěti praktických cvičení.

Zápočtový online test s uzavřenými otázkami. Test bude zahrnovat teoretické otázky a praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů. Je požadováno alespoň 65% správných odpovědí.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (09.11.2022)

Participation in practicals and test. Participation - the student will attend at least four of the five practical exercises. The multiple-choice test will include theoretical questions and practical interpretation of the results of statistical calculations. More than 60 % of the correct answers are required.