Biostatistika II - MB120P102
|
|
Soubory | Komentář | Kdo přidal | |
Biostat2-rozpis-prednasek.xls | Rozpis jednotlivych prednasek a cviceni | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
bistorta.zip | Data o změnách druhového složení luční vegetace v závislosti na managementu (sekání a hnojení): data Sylvie Pecháčkové | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
Cerinka.xls | Data o sukcesi vegetace ve vápencovém lomu. | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
Cotopaxi.zip | Data Zdeňka Soldána z lávových proudů Cotopaxi. | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
dalsineprime_PetrPetrik.zip | Další techniky nepřímé ordinace a klasifikace dat o druhovém složení: vegetace pasek Petra Petříka | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
houby.zip | Data Evy Požárové o mykofloristickém složení odkališť. | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
magda.R | Jednoducha PCA pro soubor Magda. Skript na analýzu pro kontrolu (nestahujte dřív, než budete mít vlastní skript hotov!) | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
magda1.zip | Data o chemickém složení půdy na loukách: zkoumání vlivu mravenců na půdu (data Magdy Březnové) | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
mravenci.zip | Data Pavla Kováře z geobotanické exkurse o vegetaci mravenišť a okolní louky na třech transektech. | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
neprime_analyzy_PetrPetrik.zip | Nepřímé ordinace dat o druhovém složení: vegetace pasek Petra Petříka | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
osypy.zip | data o osypech | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
pastvaHM-reseni.ZIP | exportovane soubory a skript na analýzu pro kontrolu (nestahujte nic z toho dřív, než budete mít vlastní skripty a exporty hotovy!) | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
PastvaHM.zip | Data o vlivu pastvy na vegetaci skalní stepi v průběhu 10 let | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
PCA.pptx | Presentace bez komentářů | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
PCA-Spergula.zip | Úvod do mnohorozměrných analýz na příkladu PCA: data o Spergula morisonii | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
prime_analyzy_kovariaty_PetrPetrik.zip | Přímé ordinace dat o druhovém složení: analýza s kovariátami (vegetace pasek Petra Petříka) | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
prime_analyzy_PetrPetrik.zip | Přímé ordinace dat o druhovém složení: vegetace pasek Petra Petříka | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
prime_analyzy_slozitejsi designy.zip | Složitější designy pro statistické testy: data Magdy Březnové o mraveništích | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
Přímé_analýzy1.pptx | Komentovaná presentace | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
rhedl.zip | Data R. Hédla o změnách vegetace bučin | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
rokle.zip | Data o druhovém složení v pískovcových roklích ve vztahu k hloubce pískového náplavu | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
semvegZM.zip | Data o složení vegetace a semenné banky suchých trávníků | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
skopky.R | skopky - skript na analýzu pro kontrolu (nestahujte dřív, než budete mít vlastní skript hotov!) | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
skopky.zip | Data o druhovém složení experimentálních společenstev suchých trávníků | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
syllabus.doc | syllabus kursu | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
Testy-složitější.pptx | Komentovaná presentace | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
uvod_R+vegan.zip | Úvod do zacházení s balíčkem vegan | prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. | |
vypalZM.zip | Data o vlivu vypalování a seče na stepní vegetaci. | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. | |
ziviny.zip | Data o vlivu různých typů hnojení na vegetaci horské louky | prof. RNDr. Zuzana Münzbergová, Ph.D. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. (15.11.2023)
statistiky, s důrazem na zpracování ekologických dat. Přednáška předpokládá znalost základů jednorozměrné statistiky, zejména práce s lineárními modely. Přednáška poběží turnusově. Ve školním roce 23/24 poběží v době zimního zkouškového období, ve dnech 8. a 9.1. a 15. a 16.1. v poslucharne BB (seminarium v B2). Dopoledne budou přednášky a odpoledne praktika. Začínáme v 9,00. Počítáme s přestávkou na oběd (tak hodinu) a odpoledním blokem praktik tak ca. do 4 hodin. Na odpoledni praktickou cast je nezbytne, abyste meli vlastni pocitac a na nem nainstalovane R-ko (stahnout z www.r-project.org). Po instalaci R-ka si nainstalujte balicek vegan takto: Otevrit R -> Packages -> Install.packages, v objevivsim se menu vybrat server, z nejz chcete stahovat (neco blizko, typu Nemecko nebo Rakousko), a v dalsim menu vybrat vegan. Je samozrejme mozne pracovat i v prostredi RStudio. Stručný syllabus kursu: *********************** Úvod: typy problémů, typická datová struktura Princip mnohorozměrných technik na příkladu analýzy hlavních komponent (PCA) Předpoklady PCA, Standardisace dat používané v PCA Metody pro data s nelineární strukturou: metody využívající vážených průměrů (korespondenční analýza) Nepřímé a přímé gradientové techniky: v kterém okamžiku použít nezávislou informaci o prostředí Kanonické techniky: RDA a CCA Princip Monte Carlo testů Analýza s kovariátami: jak odstranit vlivy nezávislých proměnných (typicky proměnných prostředí), které nejsou předmětem studia Korelativní a manipulativní data v mnohorozměrné situaci Použití kanonických mnohorozměrných technik pro vyhodnocení dat z manipulativních pokusů (analogie ANOVA) Speciální případy v randomisačních testech (blokové uspořádání pokusu, "split-plot design", opakovaná měření a další) Ordinační techniky postavené na matici vzdáleností: mnohorozměrné škálování Základní klasifikační techniky |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. (02.12.2015)
Analýza dat z vlastní práce a její prezentace. (V případě potřeby dodáme vhodná data pro analýzu.) Doplňovací test. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Tomáš Herben, CSc. (01.02.2021)
Aktuální sylabus kurzu je v souboru Syllabus.doc.
Rozpis jednotlivých přednášek je v Excelovém souboru Biostat2-rozpis-prednasek.xls.
|