Praktický kurs fluorescenční spektroskopie: biofyzikální aplikace - NBCM314

• Anglický název: Practical Course in Fluorescence Spectroscopy: Biophysical Applications
• Zajišťuje: Fyzikální ústav UK (32-FUUK)
• Fakulta: Matematicko-fyzikální fakulta
• Platnost: od 2020
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/2, KZ [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: 2
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán; povolen pro zápis po webu
• Garant: prof. RNDr. Petr Heřman, CSc.
• Kategorizace předmětu: Chemie > Biochemie, Fyzikální chemie; Fyzika > Fyzika, Astronomie a astrofyzika, Biofyzika a chemická fyzika, Ekologie a životní prostředí, Předměty širšího základu, Předměty obecného základu, Geofyzika, Matematika pro fyziky, Meterologie a klimatologie, Matematické a počítačové modelování ve fyzice, Jaderná a subjaderná fyzika, Optika a optoelektronika, Fyzika pevných látek, Fyzika povrchů a ionisovaných prostředí, Učitelství fyziky, Teoretická a matematická fyzika, Biofyzika a chemická fyzika

Anotace

čeština

Praktické procvičení základních i pokročilých metod fluorescenční spektroskopie spolu s moderními metodami analýzy dat. Důraz je kladen na metody časově rozlišené fluorescence v časové a frekvenční doméně. Mikroskopické implementace (FLIM, FCCS, FAIM, vícefotonová excitace, apod.) Studenti si volí 4 prakticky zaměřené úlohy z nabídnutého seznamu. Kurz je vhodný pro studenty magisterského i doktorského studia. Turnusově 1 týden.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (19.02.2018)

angličtina

Practical training of basic and advanced experimental methods of fluorescence spectroscopy including data analysis. Time resolved methods in both time and frequency domains, FLIM FCCS, FAIM, multiphoton microscopy, etc. Students choose 4 problems from the offered list. The course is recommended for master and doctoral students.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (19.02.2018)

Cíl předmětu

čeština

Studenti se naučí prakticky používat pokročilé fluorescenční techniky.

Poslední úprava: T_FUUK (07.04.2016)

angličtina

Students will learn practical applications of advanced fluorescence methods.

Poslední úprava: T_FUUK (07.05.2008)

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Zápočet je udělován na základě aktivní účasti.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (06.10.2017)

angličtina

Active presence.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (30.10.2019)

Literatura

čeština

Večeř J., Heřman P. Kurs fluorescenční spektroskopie, učební texty, MFF UK, Praha 2006. Další litertura dle doporučení.

Poslední úprava: Macharová Dana, JUDr. (20.02.2006)

angličtina

Večeř J., Heřman P. Kurs fluorescenční spektroskopie, learning texts, MFF UK, Praha 2006.

Poslední úprava: T_FUUK (28.04.2008)

Metody výuky

čeština

praktický kurz - 1týden

Poslední úprava: T_FUUK (12.05.2008)

angličtina

One week practical training

Poslední úprava: T_FUUK (12.05.2008)

Požadavky ke zkoušce

čeština

Vypracování 4 volitelných úloh.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (30.10.2019)

angličtina

Completion of 4 experiments from the list.

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (30.10.2019)

Sylabus

čeština

Seznam volitelných úloh:

1) Měření dob života fluorescence ve frekvenční doméně

2) Měření dohasínání fluorescence a fluorescenční anizotropie v časové doméně: studium globulárních proteinů v roztoku

3) FLIM

4) Spektrální FLIM

5) FAIM

6) Dvoufotonově buzený FLIM/FAIM

7) Základy FCS

8) Aplikace metody zhášení fluorescence při sledování vlastností proteinů

9) Modelování a analýza křivek fluorescenční odezvy ve frekvenční doméně

10) Modelování a analýza dohasínání fluorescence v časové doméně

11) Analýza křivek časového dohasínání intenzity fluorescence metodou maximální entropie

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (19.02.2018)

angličtina

List of optional experiments:
1) Measurements of fluorescence lifetimes in the frequency domain

2) Measurements of fluorescence lifetimes and fluorescence anisotropies in the time domain

3) FLIM

4) Spectral FLIM

5) FAIM

6) Two photon FLIM/FAIM

7) Basics of FCS

8) FLuorescence quenching

9) Parametric data analysis in the time domain

10) Parametric data analysis in the frequency domain

11) Data analysis by MEM

Poslední úprava: Heřman Petr, prof. RNDr., CSc. (30.10.2019)