Stereochemie organických molekul - MC270S83
Anglický název: Stereochemistry of Organic Molecules
Český název: Stereochemie organických molekul
Zajišťuje: Katedra organické chemie (31-270)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2024
Semestr: zimní
E-Kredity: 2
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:písemná
Rozsah, examinace: zimní s.:1/1, Zk [HT]
Počet míst: neomezen
Minimální obsazenost: 3
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Poznámka: povolen pro zápis po webu
při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
Garant: PharmDr. Eliška Matoušová, Ph.D.
Vyučující: PharmDr. Eliška Matoušová, Ph.D.
Neslučitelnost : MC270S82
Je neslučitelnost pro: MC270S82
Výsledky anket   Termíny zkoušek   Rozvrh ZS   
Anotace -
Student získá povědomí o vlivu prostorové struktury organických molekul na její vlastnosti a chování. V průběhu semestru budou probrány a na příkladech a modelech procvičeny následující pojmy a jevy: chiralita; prvky, operace a bodové grupy symetrie; absolutní a relativní konfigurace; pravidla posloupnosti CIP; R/S nomenklatura; topicita; prostereoizomerie; prochiralita; pseudochiralita; konformace acyklických a cyklických sloučenin; metody studia geometrie molekul; vliv prostorového uspořádání na reaktivitu; stereoselektivní a stereospecifické reakce.
Poslední úprava: Matoušová Eliška, PharmDr., Ph.D. (02.10.2024)
Literatura -

E.L. Elliel, S.H. Willen: Stereochemistry of Organic Compounds. Wiley
K.H. Hellwich, C.D. Siebert: Stereochemistry Workbook: 191 Problems and Solutions
http://goldbook.iupac.org/

Poslední úprava: Matoušová Eliška, PharmDr., Ph.D. (28.05.2019)
Požadavky ke zkoušce -

Požadavkem k připuštění studenta ke zkoušce je vypracování a odevzdání všech zadaných domácích úkolů v Moodle (i v případě neúčasti na dané hodině - prezenční či online). Na hodinách je povinná účast ze 75 %.

Zkouška bude písemná z látky probrané na přednáškách a cvičeních (maximálně tři pokusy).

Poslední úprava: Matoušová Eliška, PharmDr., Ph.D. (18.08.2022)
Sylabus

Chiralita, absolutní a relativní konfigurace, pravidla CIP, R/S nomenklatura. Vlastnosti enantiomerů.
Prvky symetrie, bodové grupy symetrie. Meso-forma. Pseudochiralita.
Rozdíly ve vlastnostech homochirální látky oproti racemátu. Enantiomerní přebytek. Metody určování absolutní a relativní konfigurace.
Prochiralita a topicita, homo-, hetero-, enantio- a diastereotopické ligandy/strany.
Chiralita sloučenin bez center chirality - axiální, helikální a planární chiralita, atropoizomerie.
Konfigurace alkenů a kumulenů, E/Z nomenklatura.
Konformace acyklických a cyklických sloučenin a vliv na reaktivitu. Gauche efekt, anomerní efekt.
Baldwinova pravidla. Thorpe-Ingoldův efekt. Curtin-Hammettův princip.
Vliv prostorového uspořádání na reaktivitu, stereoselektivní a stereospecifické reakce. Stereochemie substitučních, adičních a eliminačních reakcí, reakce enolátů.

Poslední úprava: Matoušová Eliška, PharmDr., Ph.D. (28.05.2019)
Výsledky učení

Student po absolvování kurzu:

Stereoizomery, absolutní a relativní konfigurace

    -   vysvětlí základní pojmy stereochemie (chiralita, konstituce, konfigurace, konformace, druhy stereoizomerů, racemát, reziduální stereoizomery apod.) a aplikuje je na konkrétních příkladech organických molekul

    -   rozliší mezi jednotlivými druhy stereoizomerů, správným způsobem je nakreslí v cikcak, Fischerově i Newmanově projekci

    -   vyjmenuje alespoň tři metody pro určení absolutní a relativní konfigurace molekul a popíše jejich základní princip

    -   zapíše relativní konfiguraci organické molekuly s využitím vhodných stereodeskriptorů (rel, rac, erythro/threo, syn/anti, cis/trans)

    -   aplikuje Cahn-Ingold-Prelogova pravidla k určení R/S konfigurace v komplexních molekulách (včetně např. spirocyklů či izotopů)

    -   provede překreslení molekul mezi Fischerovou, Newmanovou a cikcak projekcí a určí jejich konfiguraci

Symetrie + mesoforma

    -   identifikuje a popíše všechny prvky symetrie (Cn, σ, i, Sn) a odpovídající operace symetrie v organické molekule, na základě toho rozezná chiralitu nebo achiralitu molekul

    -   demonstruje schopnost klasifikace molekul do příslušných bodových grup symetrie podle návodného schématu, bez nutnosti memorování jednotlivých grup

    -   rozpozná mesoformu, navrhne konkrétní příklad takové organické molekuly, popíše stereochemické a fyzikálně-chemické důsledky

Vlastnosti enantiomerů, homochirální látka vs. racemát, enantiomerní přebytek

    -   navrhne alespoň tři metody (fyzikální i chemické) pro charakterizaci, rozlišení a separaci enantiomerů a posoudí jejich výhody a nevýhody

    -   vysvětlí rozdíl mezi homochirální látkou a racemátem ve vztahu k jejich fyzikálně-chemickým a biologickým vlastnostem

    -   porovná jednotlivé typy racemátů a jejich vlastnosti a zhodnotí vliv na separaci enantiomerů

    -   dokáže vysvětlit pojem enantiomerní přebytek a dokáže ho vypočítat na základě interpretace experimentálních dat

Pseudochiralita, prochiralita a topicita

    -   rozpozná pseudoasymetrické centrum a určí jeho r/s konfiguraci

    -   vysvětlí pojmy prochiralita a topicita, rozpozná jednotlivé typy ligandů/stran a na základě toho určí počet signálů organické molekuly v NMR

    -   dokáže zapsat prochiralitu pomocí vhodných stereodeskriptorů (pro-R/pro-S, Re/Si, re/si)

Axiální, helikální a planární chiralita, atropoizomerie

    -   rozliší mezi různými typy chirality, včetně axiální, helikální a planární chirality

    -   dokáže určit konfiguraci chirálních organických molekul bez center chirality a popíše ji vhodnými stereodeskriptory (Ra/Sa, Rp/Sp, P/M)

Alkeny a kumuleny

    -   určí E/Z konfiguraci u komplexních alkenů a kumulenů

    -   vysvětlí vliv struktury na rotační bariéru alkenů

Konformace

    -   pojmenuje jednotlivé konformace molekuly na základě velikosti torzního úhlu

    -   identifikuje a definuje jednotlivé druhy pnutí v organických molekulách, včetně malých a velkých cyklů

    -   nakreslí molekuly s definovanou konformací v Newmanově projekci

    -   vysvětlí vliv anomerního efektu, „gauche“ efektu a přítomnosti dvojných vazeb na stabilitu konformací, včetně A(1,2) a A(1,3) pnutí, s-cis/s-trans konformací, rotamerů

    -   nakreslí šestičlenný (hetero)cyklus v obou židličkových konformacích, jednoznačně rozliší axiální a ekvatoriální vazby, určí konformaci s nižší energií a zdůvodní, jak substituce a heteroatomy ovlivňují konformační stabilitu cyklohexanu a šestičlenných heterocyklů, včetně sacharidů

    -   překreslí sacharidy z Fischerovy projekce do židličkové konformace a naopak, určí D/L konfiguraci sacharidů a rozliší α/β anomerii

    -   nakreslí a pojmenuje konformace vícecyklických sloučenin (dekalin, bicykly, perhydrofenanthren, steroidy), včetně deskriptorů syn/anti, exo/endo, cisoid/transoid

Reaktivita

    -   zhodnotí vliv stereochemie na reaktivitu šestičlenných cyklů a bicyklických sloučenin, předpoví výsledek a relativní rychlost reakce, aplikuje Fürst-Plattnerovo pravidlo

    -   dokáže vysvětlit a předpovědět uplatnění Curtin-Hammettova principu a Thorpe-Ingoldova efektu v konkrétních reakcích

    -   pojmenuje cyklizace podle Baldwina (exo, endo, dig, trig, tet), popíše reakční trajektorie relevantní pro cyklizace, včetně Waldenova zvratu a Bürgi-Dunitzova úhlu; navrhne aplikaci Baldwinových pravidel v kontextu jejich pozdějších revizí a vysvětlí rozdíly mezi kationickými, anionickými a radikálovými cyklizacemi

    -   klasifikuje a vysvětlí stereochemické aspekty různých typů reakcí (substituce, elektrofilní adice, eliminace), aplikuje je na konkrétní reakce

    -   dokáže použít Felkin-Anhův model pro predikci stereochemie produktu nukleofilní adice, odhadne upladnění chelatace při těchto reakcích

    -   rozliší kineticky a termodynamicky řízený vznik enolátu, navrhne vznikající produkt

Poslední úprava: Matoušová Eliška, PharmDr., Ph.D. (19.08.2024)
Vstupní požadavky

Předpokladem je znalost organické chemie odpovídající úrovni absolventů bakalářského studijního programu.

Poslední úprava: Rubešová Jana, RNDr., Ph.D. (01.04.2018)