|
|
|
||
Poslední úprava: SIMONAT (29.04.2002)
Základy strukturní analýzy biopolymerů, metody popisu, srovnávání a predikce. Proteiny a polypeptidy, sbalování a stabilita, evoluce, strukturní třídy. Nukleové kyseliny, nomenklatura. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany. Lignin. Supramolekulární struktury, viriony, priony. Podpůrné struktury. Přeměna chemické energie v mechanickou. |
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (30.11.2020)
Voet G, Voetová JG: Biochemie, Victoria Publishing, Praha 1995 Nelson DL, Cox MM: Lehninger Principles of Biochemistry, WH Freeman and Co, N.Y. 2008, 7th Edition, 2017, Schulz GE, Schirmer RH: Principles of Protein Structure, Springer Verlag, N.Y. 1982, Saenger W: Principles of Nucleic Acid Structure, Springer Verlag, N.Y. 1984, Brandén C, Tooze J: Introduction to Protein Structure, Garland N.Y., 1991, 2nd Edition Garland 1999 Creighton TE: Proteins: Structures and Molecular Properties. WH Freeman 1993 (2nd Ed.) Kyte J: Structure in Protein Chemistry, Garland 1995 Harding SE, et al.. An Introduction to Polysaccharide Biotechnology, 2nd Ed., Kindle Ed. CRC Press, 2017, Liljas L et al. Textbook of Structural Biology, 2009, 2nd Ed. 2016, World Scientific, Cantor Cr, Schimmel PR: Biophysical Chemistry, Vol. I (Conformation of Biological Macromolecules), Vol III (Behavior of Biological Macromolecules) WH Freeman 1980.
|
|
||
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (04.01.2010)
Zkouška: ústní. Okruhy otázek - viz sylabus. |
|
||
Poslední úprava: SIMONAT (30.04.2002)
1. Peptidy a globulární proteiny. Základní strukturní pojmy a charakteristiky. Metody popisu a znázornění struktury - vnitřní souřadnice, diedrální úhly, disanční a direkční matice. Hierarchizace struktury - primární, sekundární, terciární, kvartérní, pojetí komise IUB/IUPAC, klasické pojetí. Supersekundární struktura, strukturní motivy a domény. Strukturní klasifikace proteinů. Predikce a modelování struktury proteinů - základní metodické přístupy, limity a monnosti. Porovnávání sekvencí a struktur. Dynamika a sbalování nativní struktury, denaturace. Proteiny v extrémních podmínkách.Membránové proteiny.
2. Nukleové kyseliny. Základní pojmy, metody popisu. Vzájemné vztahy vnitřních souřadnic, metody přibližného popisu prostorové struktury. DNA, RNA - strukturní typy, párování bazí, strukturní charakteristiky dvoušroubovice, Z-DNA a trojšroubovice.
3. Polysacharidy. Základní popis, strukturní typy. Škrob, celulosa, heparin, pektiny.
4. Podpůrné struktury. Obecné principy struktury biologických stavebních prvků. Vláknité bílkoviny - fibriny, kolageny, keratiny, fibroin. Proteoglykany. Lignin.
5. Přeměna chemické energie na mechanickou. Svalové bílkoviny. Bičíky a řasinky. |