Biochemie II - MB150P04B

• Anglický název: Biochemistry II
• Český název: Biochemie II
• Zajišťuje: Katedra buněčné biologie (31-151)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2024 do 2024
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 4
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:kombinovaná
• Rozsah, examinace: zimní s.:3/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. RNDr. Petr Folk, CSc.
• Vyučující: prof. RNDr. Jan Brábek, Ph.D.; doc. RNDr. Petr Folk, CSc.; doc. RNDr. Martin Kalous, CSc.
• Korekvizity : MB150P04A
• Neslučitelnost : MB150P34U
• Je neslučitelnost pro: MB150P34U, MB150P34
• Ve slož. prerekvizitě: MB140P33
• Ve slož. korekvizitě pro: MB150C04

Anotace

Přednáška poskytuje přehled o základních typech biomolekul a hlavních segmentech buněčného metabolismu se zřetelem na energetiku heterotrofní buňky. Přednáška je zamýšlena pro studenty 2. a vyšších semestrů bakalářského studia biologie a je doporučována zejména všem těm, kteří zamýšlejí studovat "experimentální" biologické obory (vědy o životě, Life Sciences). První část má za cíl představit jednotlivé skupiny biologicky důležitých molekul, jejichž znalost je potřebná pro studium buněčného metabolismu. Druhá část je zaměřena na proteinové struktury a jejich funkce s důrazem na enzymologii. Ve třetí části jsou představeny klíčové dráhy katabolismu a anabolismu buňky s důrazem na buňku živočišnou. Metabolismus je probírán zároveň se svými regulačními obvody. Přednáška navazuje na informace, získané v Biologii buňky, které dále rozvíjí. Absolutorium přednášky je předpokladem pro podrobnější studium metabolismu - zejména rostlin (Fyziologie rostlin, Vybrané kapitoly z biochemie rostlin), parazitických organismů (Biochemie parazitů) a mikroorganismů (Fyziologie bakterií, Mikrobiologie). Vděčnou oblastí studia je i srovnávací biochemie - jak živočichů, tak dalších říší, která nabízí i řadu příležitostí k pokračování na diplomových projektech na většině kateder. Doporučuje se absolvovat jako prerekvizity přednášku z obecné chemie/ základů fyzikální chemie a z organické chemie. Absolvování zkoušky bez těchto základů vyžaduje delší čas na přípravu. Informace o přednášce a studijní pomůcky je možno nalézt na stránce "Biochemie pro biology - Virtuální studovna biochemie", kde je také seznam literatury.

Poslední úprava: Půta František, doc. RNDr., CSc. (16.09.2014)

Literatura

Murray M.K. et al., Harperova ilustrovaná biochemie, Galén, ISBN: 978-80-7262-907-7, 2012

Voet D., Principles of Biochemistry, John Wiley & Sons Inc, ISBN13 (EAN): 9781119451662, 2018

Voet D., Voet J.G., Pratt, Ch.W., Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level 5th Edition, John Wiley & Sons Inc, ISBN-10: 1118918401, 2016

Nelson D., Cox, M.M., Lehninger Principles of Biochemistry, W. H. Freeman; 7th ed. edition, ISBN-10: 9781464126116, 2017

Berg J.M., Stryer L., Tymoczko J.L.,  Gatto G.J., Biochemistry, WH Freeman; 9th ed., ISBN-10: 1319114652, 2019

Mathews K.Ch., Biochemistry,  Pearson; 4th Revised ed. Edition, ISBN-10: 0138004641, 2012

Lippincott Illustrated Reviews: Biochemistry, Lippincott Williams and Wilkins; 7th International edition, ISBN-10: 149636354X, 2017

Vodrážka Z., Biochemie, Academia, 2.opr. vydání, ISBN: 978-80-200-0600-4, 2007

Zapsaní studenti mají možnost využívat materiály na stránkách studovny v rámci Moodle (dl2.cuni.cz).

Poslední úprava: Folk Petr, doc. RNDr., CSc. (05.04.2019)

Požadavky ke zkoušce

Zkouška má formu písemného testu v 1. a 1. opravném termínu. Pro 2. opravný termín a při termínech po druhém zápisu předmětu je forma ústní.

Písemný test se skládá z 30 otázek, které testují znalosti v rozsahu syllabu přednášky. Otázky jsou typu a) výběru jedné správné odpovědi ze čtyř možností a b) "multiple choice" - výběru správných odpovědí, které mohou být v libovolném počtu (0 až 4).

Poslední úprava: Folk Petr, doc. RNDr., CSc. (11.09.2023)

Sylabus

GLUKONEOGENEZE A DALŠÍ METABOLICKÉ DRÁHY SACHARIDŮ
Glukoneogeneze, Coriho cyklus, Glyoxylátová dráha, Biosyntéza oligosacharidů a glykoproteinů, Pentosafosfátová dráha

KOMPLEX PYRUVÁTDEHYDROGENASY, katalýza a regulace
CITRÁTOVÝ CYKLUS
Historie objevu, Metabolické zdroje acetylkoenzymu A, Enzymy citrátového cyklu, Regulace citrátového cyklu, Amfibolická povaha citrátového cyklu

TRANSPORT ELEKTRONŮ A OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE
Mitochondrie, Transport elektronů, Struktura a funkce komplexů I až IV, Oxidativní fosforylace, fotosyntéza, fotofosforylace a fotorespirace
Struktura a funkce FoF1-ATPasy, Regulace tvorby ATP

LIPIDY A MEMBRÁNY
Mastné kyseliny a lipidy, Biomembrány, Lipoproteiny
METABOLISMUS LIPIDŮ první část
Trávení lipidů, absorpce a transport, Oxidace mastných kyselin, Ketonové látky

METABOLISMUS LIPIDŮ druhá část
Biosyntéza mastných kyselin, Regulace metabolismu mastných kyselin, Metabolismus cholesterolu, Metabolismus arachidonátu, Metabolismus fosfolipidů a glykolipidů

METABOLISMUS AMINOKYSELIN
Deaminace aminokyselin, Močovinový cyklus a jeho regulace, Metabolická degradace jednotlivých aminokyselin, Aminokyseliny v roli biosyntetických prekursorů, Biosyntéza aminokyselin

METABOLISMUS NUKLEOTIDŮ
Chemická struktura nukleotidů, nukleosidů a bází, Syntéza purinových nukleotidů, Regulace biosyntézy purinových nukleotidů, Znovuvyužití purinů, Syntéza pyrimidinových ribonukleotidů, Regulace biosyntézy pyrimidinových nukleotidů, Tvorba deoxyribonukleotidů, Katabolismus purinů, Katabolismus pyrimidinů, HGPRT a selekce hybridomů

průběžně
INTEGRACE METABOLISMU A ORGÁNOVÉ SPECIALIZACE
Strategie energetického metabolismu, Orgánové specializace, Metabolické adaptace, hladovění, cukrovka.

Poslední úprava: Folk Petr, doc. RNDr., CSc. (30.08.2023)