Evoluce a systematika prokaryot - MB140P14
Anglický název: Evolution and systematics of prokaryotes
Český název: Evoluce a systematika prokaryot
Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2024
Semestr: letní
E-Kredity: 3
Způsob provedení zkoušky: letní s.:ústní
Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
Počet míst: neomezen
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: čeština
Úroveň: specializační
Další informace: https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=2399
Poznámka: povolen pro zápis po webu
Garant: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
Vyučující: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D.
Výsledky anket   Termíny zkoušek    Elearningový kurz
Anotace -
Přednáška poskytuje globální přehled aktuálních znalostí o evoluci prokaryot a jejich taxonomii. V části zaměřené na systematickou mikrobiologii pojednává o taxonomických přístupech a charakterizuje nejvýznamnější prokaryotní taxony. V evoluční části přednášky je kladen důraz na fenomény spojené s evolucí charakteristických životních stylů prokaryot (nutriční symbionti, patogeni). Zvláštní pozornost je dále věnována zdrojům evoluční variability a evoluci obrany před selekčními tlaky biologické povahy (sobecké genetické elementy, antibiotika, imunitní systém hostitele).
Předmět je vhodný především pro magisterské a doktorské studenty mikrobiologie, vítáni jsou zájemci z jiných oborů. Pro porozumění probíraným tématům se doporučuje předchozí absolvování přednášek Mikrobiologie a Základy evoluční biologie.
Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (10.09.2024)
Literatura -

Knihy:

Madigan M.T. et al.: Brock Biology of Microorganisms (15th Edition). Pearson, 2018

Brown J.W.: Principles of Microbial Diversity. ASM Press, 2015

Rosenberg E. et al. (Eds.): The Prokaryotes (4th Edition). Springer, 2014

Whitman W.B (Ed.).: Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. Wiley, 2015

 

vybrané přehledové články

 

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (03.01.2024)
Požadavky ke zkoušce -

Zkouška je ústní, formou diskuze nad vylosovanými tématy.

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (10.09.2024)
Sylabus -

Molekulární taxonomie, prokaryotní druh

prokaryotní x eukaryotní druh, fylogenetické markery a jejich citlivost, jednogenové x vícegenové x celogenomové přístupy

Raná evoluce prokaryot a hlavní členění

hlavní členění prokaryot a jeho objev, LUCA a jeho predikované vlastnosti, prokaryota jako hybatelé rané evoluce planetárního ekosystému, vznik eukaryot z archeí

Systematika I

Terrabacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky

Systematika II

Hydrobacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky

Zdroje a mechanismy evoluční variability

bodové mutace, posuvové mutace (contingency loci), repetitivní sekvence, IS elementy, hypermutabilita (mutační rychlost, evoluce evolvability), horizontální genový přenos a mobilní genetické elementy (taxonomická specificita)

Evoluce patogenicity

evoluční trajektorie od volně žijící bakterie k  patogenovi, adaptace na imunitní systém, intracelularita, obligátní asociace s hostitelem, geneticky monomorfní patogeny

Evoluce obrany

obrana prokaryot před sobeckými genetickými elementy (CRISPR, restrikčně – modifikační systémy), obranné mechanismy sobeckých elementů před obrannými mechanismy hostitele, evoluce rezistence k antibiotikům

Evoluce kooperace

nutriční symbiózy (mízosavý hmyz, hydrotermální vývěry, hlízkové bakterie), bioluminiscentní symbiózy

Poslední úprava: Nunvář Jaroslav, RNDr., Ph.D. (06.03.2019)