Biostatistika - C2VL001

• Anglický název: Biostatistics
• Zajišťuje: Ústav epidemiologie a biostatistiky 3. LF UK (12-EPID)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2024
• Semestr: zimní
• Body: 1
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:8/12, Z [HS]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština, angličtina
• Způsob výuky: prezenční
• Garant: RNDr. Alena Fialová, Ph.D.; RNDr. Václav Čapek, Ph.D.

Anotace

čeština

Předmět zahrnuje úvod do biostatistiky, principy statistického uvažování, testování a interpretace analýz.

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (10.12.2019)

angličtina

The subject covers introduction to biostatistics, principles of statistical reasoning, testing, and interpretation of the analyses.

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (10.12.2019)

Cíl předmětu

čeština

Předmět je zaměřen na seznámení studentů s principy použití matematicko-statistických metod v medicíně. Vysvětluje principy statistické indukce, základní statistické metody a interpretaci výsledků statistických analýz běžně používaných v lékařské literatuře. Tyto znalosti jsou základem pro správné pochopení principů medicíny založené na důkazech.

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (27.09.2017)

angličtina

The aim of the subject is to familiarize students with the principles of using mathematical and statistical methods in medicine. It explains principles of statistical induction, basic statistical methods and interpretation of results of statistical analyzes commonly used in medical literature. This knowledge is the basis for a correct understanding of the principles of evidence-based medicine.

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (27.09.2017)

Podmínky zakončení předmětu

čeština

Účast na cvičeních - student se zúčastní alespoň čtyř z pěti praktických cvičení.

Zápočtový online test s uzavřenými otázkami. Test bude zahrnovat teoretické otázky a praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů. Je požadováno alespoň 65% správných odpovědí.

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (09.11.2022)

angličtina

Participation in practicals and test. Participation - the student will attend at least four of the five practical exercises. The multiple-choice test will include theoretical questions and practical interpretation of the results of statistical calculations. At least 65 % of the correct answers are required.

Poslední úprava: Čapek Václav, RNDr., Ph.D. (25.10.2024)

Literatura

čeština

Hendl, J. Přehled statistických metod. Analýza a metaanalýza dat. 4. vyd. Portál, Praha, 2015

Procházka, B. Biostatistika pro lékaře. Principy základních metod a jejich interpretace s využitím statistického systému R. Karolinum, Praha, 2016

Procházka, B. Stručná biostatistika pro lékaře. Karolinum, Praha, 2015

Poslední úprava: Michenka Petr, MUDr., Ph.D. (23.12.2019)

angličtina

KIRKWOOD, B.R. (1992). Essentials of Medical Statistics. Blackwell Scientific Publications, Oxford.

ROSNER, B.A. (1995). Fundamentals of Biostatistics. Duxbury Press, Belmont.

dos SANTOS SILVA, I. (1999). Cancer Epidemiology: Principles and Methods. International Agency for Research on Cancer, Lyon

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (10.12.2019)

Metody výuky

čeština

Přednášky, praktika.

Poslední úprava: Michenka Petr, MUDr., Ph.D. (23.12.2019)

angličtina

Lectures, practicals

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (03.12.2019)

Sylabus

čeština

PŘEDNÁŠKY

1. Statistické pojmy, statistická indukce a testování

Statistika v lékařských vědách

Logika statistického uvažování (pozorování vs. hypotézy)

Důležité kroky při aplikaci statistiky

Typy proměnných

Popisná statistika (charakteristiky polohy a variability)

Pravděpodobnost, rozdělení

Populace - výběr, techniky pořizování výběru

Reprezentativnost výběru

Bodový a intervalový odhad, střední chyba průměru

Interval spolehlivosti

Principy statistického testování

Statistická hypotéza a hladina významnosti

Jednostranné a oboustranné hypotézy

Jednovýběrové, dvouvýběrové a párové testy

Parametrické a neparametrické testy

Testování hypotéz o poloze (t-test, Wilcoxonův test, analýza rozptylu)

Interpretace výsledků statistických analýz

 

2. Statistické metody v medicíně

Kontingenční tabulky (čtyřpolní tabulky), metody pro srovnávání poměrů

Chí-kvadrát test, Fisherův a McNemarův test

Základní typy studií používaných v epidemiologii a odpovídající statistické modely pro jejich hodnocení

Demografické statistiky, míry a poměry

Relativní riziko, poměr šancí, atributivní riziko

Zkreslení, vychýlení, přesnost

Vztah dvou proměnných: korelace, regrese

Pokročilé statistické metody v epidemiologii (logistická regrese, cenzorovaná data, analýza přežití)

Matematické nástroje pro plánování průzkumů a experimentů, určení velikosti výběru

 

PRAKTICKÁ CVIČENÍ

 

1. Základy popisné statistiky: typy proměnných, rozdělení pravděpodobnosti (binomické, Poissonovo, normální), populace a výběr, metody pořizování výběru

Charakteristiky polohy a variability, střední chyba průměru, histogram, bodový a intervalový odhad, interval spolehlivosti

Statistické testy: testování statistických hypotéz, p-hodnota, hladina významnosti

 

2. Statistické testy pro spojité proměnné: parametrické a neparametrické testy, t-test a Wilcoxonův test (jednovýběrový, dvouvýběrový, párový), analýza rozptylu (ANOVA), F-test

Statistický software

 

3. Statistické testy kategoriálních proměnných: kontingenční tabulka, chí-kvadrát test, McNemarův test

Statistické metody v epidemiologii: epidemiologické míry rizika a odpovídající intervaly spolehlivosti, zkreslení, interpretace

 

4. Statistické metody v epidemiologii: vyhodnocení údajů ze surveillance a registrů, diagnostické a screeningové testy

Plánování průzkumů: síla statistického testu, stanovení velikosti výběru, chyby I. a II. druhu

 

5. Regresní analýza: korelace, lineární regrese, mnohonásobná regrese, logistická regrese, test trendu

Analýza přežití: klinické studie, Kaplanova-Meierova křivka, log-rank test, Coxův model proporcionálního rizika

Praktické využití statistiky: statistika v publikovaných článcích s lékařskou tématikou, diskuse o statistických metodách, výběr statistického testu

Závěrečný test

Poslední úprava: Fialová Alena, RNDr., Ph.D. (09.11.2022)

angličtina

LECTURES

1. Statistical concepts, statistical induction and testing
Statistics in Medical Sciences
Logic of statistical reasoning (observations vs. hypotheses)
Important steps in applying statistics
Types of variables
Descriptive statistics (location and variability characteristics)
Probability, distribution
Population - selection, sampling techniques
Representativeness of the selection
Point and interval estimation, mean error of the mean
Confidence interval
Principles of statistical testing
Statistical hypothesis and level of significance
One-sided and two-sided hypotheses
Single-choice, double-choice and paired tests
Parametric and non-parametric tests
Position hypothesis testing (t-test, Wilcoxon test, analysis of variance)
Interpretation of statistical analysis results

2. Statistical methods in medicine
Contingency tables (four-field tables), methods for comparing ratios
Chi-square test, Fisher's and McNemar's test
Basic types of studies used in epidemiology and corresponding statistical models for their evaluation
Demographic statistics, rates and ratios
Relative risk, odds ratio
Bias, Accuracy
Relationship between two variables: correlation, regression
Advanced statistical methods in epidemiology (logistic regression, censored data, survival analysis)
Mathematical tools for planning surveys and experiments, determining sample size

PRACTICAL EXERCISES

1. Basics of descriptive statistics: types of variables, probability distribution (binomial, Poisson, normal), population and sampling, sampling methods
Location and variability characteristics, mean error of the mean, histogram, point and interval estimation, confidence interval
Statistical tests: statistical hypothesis testing, p-value, level of significance

2. Statistical tests for continuous variables: parametric and non-parametric tests, t-test and Wilcoxon test (one-sample, two-sample, paired), analysis of variance (ANOVA), F-test
Statistical software

3. Statistical tests of categorical variables: contingency table, chi-square test, McNemar's test
Statistical methods in epidemiology: epidemiological risk measures and corresponding confidence intervals, bias, interpretation

4. Statistical methods in epidemiology: evaluation of data from surveillance and registers, diagnostic and screening tests
Planning surveys: statistical test power, sample size determination, I and II errors

5. Regression analysis: correlation, linear regression, multiple regression, logistic regression, trend test
Survival analysis: clinical trials, Kaplan-Meier curve, log-rank test, Cox proportional hazard model
Practical use of statistics: statistics in published medical articles, discussion of statistical methods, selection of a statistical test

Final test

Poslední úprava: Čapek Václav, RNDr., Ph.D. (24.10.2024)