Seznámení studentů se striktními i potenciálně patogenními humánními mikroby, patogenezou onemocnění, která vyvolávají, diagnostickými postupy k jejich průkazu, možnostmi léčby a prevence těchto infekcí. V praktické části je kladen důraz na poznání algoritmu práce mikrobiologické laboratoře při vyšetření.
Poslední úprava: Kolářová Jana (12.02.2020)
Literatura
Povinná:
Kolářová Libuše et al.. Obecná a klinická mikrobiologie. Praha: Galen, 2020, s. ISBN ISBN 978-80-7492-477.
Goering, Richard V., Dockrell, Hazel M., Zuckerman, Mark, Roitt, Ivan M, Chiodini, Peter L. Mimsova lékařská mikrobiologie. Praha: Stanislav Juhaňák - Triton, 2016, 568 s. ISBN 978-80-7387-928-0.
Votava, Miroslav. Lékařská mikrobiologie - vyšetřovací metody. Brno: Neptun, 2010, 495 s. ISBN 978-80-86850-04-7.
Doporučená:
Zima, Tomáš. Laboratorní diagnostika. Praha: Galén, 2013, 1146 s. ISBN 978-80-7492-062-2.
Carey, Roberta B. Schuster, Mindy Gail McGowan, Karin L.. Lékařská mikrobiologie v klinických případech. Praha: Triton, 2011, 321 s. ISBN 978-80-7387-480-3.
Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S. Pfaller, Michael A.. Medical microbiology. Philadelphia: Elsevier/Saunders, 2013, 874 s. ISBN 978-0-323-08692-9.
Goering, Richard V., Dockrell, Hazel M., Zuckerman, Mark A., ROITT, Ivan M, Chiodini, Peter L. (eds.). Mims' medical microbiology. : Elsevier Health Sciences, 2013, 565 s. ISBN 978-0-8089-2440-1.
Greenwood, David, (ed.). Medical microbiology : a guide to microbial infections: pathogenesis, immunity, laboratory diagnosis and control. Edinburgh: Elsevier, 2012, 778 s. ISBN 978-0-7020-4089-4.
Hurych J., Štícha R. et al. . Lékařská mikrobiologie - Repetitorium. Praha : Stanislav Juhaňák - TRITON, 2020, 621 s. ISBN 078-80-7553-844-4.
Julák, Jaroslav. Úvod do lékařské bakteriologie. Praha: Univerzita Karlova v Praze, nakladatelství Karolinum, 2015, 404 s. ISBN 978-80-246-3210-0.
Poslední úprava: PETRICKO/NATUR.CUNI.CZ (07.09.2022)
Metody výuky
A. Přednášky
Účast se registruje pomocí čteček ISIC karet - dostatečná účast osvobodí studenta od povinnosti psát závěrečný zápočtový test (viz sekce Požadavky ke zkoušce).
B. Praktika
I. Náplň PRAKTICKÉ VÝUKY
Studenti obdrží sadu anamnéz pacientů, se kterými v průběhu týdne nacvičí základní diferenciálně-diagnostickou rozvahu, volbu vhodných postupů k identifikaci mikrobiálních původců popsaných obtíží, provedou mikrobiologická vyšetření dodaných klinických vzorků, zváží relevanci získaných výsledků z klinického pohledu a navrhnou vhodnou terapii. V průběhu týdne studenti postupují dle rutinního algoritmu mikrobiologické laboratoře s použitím kultivace, mikroskopie, základních diagnostických testů k průkazu virů, bakterií, mikromycét a parazitů, a testů na určení citlivosti mikroba k antimikrobiálním látkám.
Před začátkem praktik si zopakujte znalosti z laboratorního týdne Mikrobiologie I, jsou nezbytné pro absolvování!
II. Organizace PRAKTICKÉ VÝUKY
MÍSTO
Praktika probíhají v prostorech Ústavu lékařské mikrobiologie (Studničkova 7, 1. patro v zadní části budovy). Kvůli probíhajícím stavebním pracím v blízkosti budovy je vstup na praktika veden suterénem budovy, trasa je značena od hlavního vchodu do budovy (vstup ze společného dvora ÚLM a FÚ, ne přímo z ulice)
ČAS
Praktika probíhají blokově, 1 týden od pondělí do pátku v čase 14:30 - 18:15 h. První blok praktik probíhá ve druhém výukovém týdnu ZS, tj. od 6. 10. 2025.
Závazné rozdělení studentů do jednotlivých bloků a laboratoří je k dispozici v SIS (dokument "Praktika MIKROBIOLOGIE 2 - rozpis studentu"). Povinností studenta je zjistit a dodržet svůj přidělený termín výuky. Kapacita všech bloků je naplněna, případné přesuny k jiným blokům (jiný termín, jiná laboratoř) budou umožněny jen ze závažných a řádně doložených důvodů, zejm. zdravotních, za následujících podmínek:
Nepřítomnost na praktiku v přiděleném bloku bude s předstihem oznámena e-mailem a důvod doložen (před začátkem praktik, max. v pondělí do 14:00, praktika.mikro@lf1.cuni.cz, doloženo lékařským potvrzením, apod.).
Důvodem k neúčasti na praktiku v přiděleném bloku nejsou osobní zájmy, dobrovolné aktivity, brigády, atd.
Po individuálním posouzení důvodu a schválení přesunu bude přidělen náhradní termín praktik dle volných kapacit
Nevyužití přiděleného náhradního termínu bude posuzováno jako neabsolvování praktické části výuky
VSTUP DO LABORATOŘÍ
Pro práci v laboratoři je nutné mít vlastní laboratorní plášť a obuv, které po dobu trvání praktik nesmí být bez dekontaminace používány v jiných prostorech. K uskladnění osobních věcí jsou k dispozici šatní skřínky v suterénu budovy, uzamykatelné vlastním visacím zámkem. Do prostoru laboratoří praktik je zakázané vnášet předměty nesouvisející s výukou (tašky, penály, šály, svetry, jídlo a pití). Je doporučeno nevnášet tablety, telefony - jejich používání je na vlastní riziko (kontaminace, ztráta, ev. i poškození při případné snaze očistit přístroj dezinfekčním prostředkem).
Poslední úprava: Chanová Marta, Mgr., Ph.D. (30.09.2025)
Požadavky ke zkoušce
POŽADAVKY PRO ZÁPOČET
1. Úspěšné absolvování zápočtového testu nebo splnění podmínek pro odpuštění zápočtového testu
Zápočtový test bude obsahovat pouze témata probíraná na přednáškách (PC místnost, Moodle prostředí, 30 otázek "single best", 30 minut, 60 % nutno pro splnění, možné jsou 3 pokusy, primárně v zápočtovém týdnu).
Pokud se zúčastníte alespoň 5 přednášek ze 7 v období 1.10.25 - 14.11.25 a dalších 5 v období 17.11.25 - 23.1.26, nemusíte psát závěrečný zápočtový test.
2. Úspěšné absolvování praktik
Aktivní účast na praktiku
Vypracování protokolů - zaznamenejte si postup práce a výsledky při zpracování klinických vzorků. Protokoly budou průběžně kontrolovány vyučujícím. V závěru týdne budete na základě nich ústně reportovat, jaké klinické případy jste řešili, jak jste postupovali při identifikaci patogenních agens a k jakým závěrům jste došli.
Domácí příprava na zadaná témata
Absenci v jednom výukovém dni z týdenního bloku praktik může ze závažných a doložených důvodů vyučující omluvit. Omluvení absence je podmíněno prověřením, že si student doplnil znalosti z vynechaného dne. V žádném případě se nejedná o "univerzální možnost vynechat jeden den praktik". Posouzení splnění podmínek k udělení zápočtu je plně v kompetenci vyučujícího. Při neomluvené absenci nebo nesplnění podmínekstudent absolvuje celé praktikum v závazně přiděleném náhradním termínu. Nevyužití přiděleného náhradního termínu bude posuzováno jako neabsolvování praktické části výuky.
ZKOUŠKAz mikrobiologie se skládá po absolvování Integrovaného bloku mikrobiologie a patologie. Ověřuje znalosti posluchačů získané absolvováním předmětů Mikrobiologie 1 a Mikrobiologie 2.
Požadavky ke zkoušce: student se může přihlásit ke zkoušce pokud má zapsaný předmět Mikrobiologie 2, absolvoval praktická cvičení, má zápočet a splnil korekvizity.
Korekvizity: předměty, které musí být v době konání zkoušky splněny: Biologie a genetika 2, Základy imunologie.
Místo a organizace zkoušky: posluchači se hlásí v Ústavu imunologie a mikrobiologie, Studničkova 7, Praha 2, zadní vchod, v kanceláři praktik, před vchodem na sektor praktických cvičení. Zde po kontrole zápočtů a korekvizit obdrží kartu a budou posláni k jednotlivým examinátorům. Výběr konkrétního zkoušejícího posluchačem není možný.
Náplň zkoušky: skládá se z praktické (1 otázka) a teoretické části (3 otázky)
OTÁZKY Z MIKROBIOLOGIE - od akademického roku 202526
Obsahuje následující okruhy témat z praktické výuky diagnostiky infekčních onemocnění:
1. Kultivace bakterií, mikromycetů a parazitů – Základní kultivační média, selektivní a selektivně-diagnostická média a jejich použití v identifikaci. Chromogenní média - princip a příklady aplikace. Kultivace vzorků moči. Hemokultura. Anaerobní kultivace.
2. Mikroskopie bakterií, mikromycetů a parazitů – Principy a zásady. Nejčastěji používané vzorky pro přímou mikroskopickou detekci agens. Základní barvicí techniky v mikrobiologii, mykologii a parazitologii. Typické příklady aplikace - mikrobní obraz poševní.
A1. Stavba bakteriální buňky: Buněčná stěna, vnější struktury, spory.
A2. Růst a množení bakteriální populace. Typy bakteriálního metabolismu a jeho produkty.
A3. Přirozená mikrobiota člověka a její regulace. Biofilm.
A4. Patogenita a faktory virulence bakterií. Bakteriální toxiny a superantigeny.
A5. Genetická informace u bakterií a její přenos.
A6. Mechanismy přirozené i získané rezistence na antibiotika u klinicky významných bakterií.
A7. Testy citlivosti k antibiotikům, interpretace výsledků. Základní farmakokinetické a farmakodynamické parametry antibiotik (MIC, MBC, AUC/MIC, T nad MIC…).
A8. Struktura virů a virových částic.
A9. Genetická informace virů a jejich klasifikace.
A10. Průběh virové infekce hostitelské buňky a její cytopatické efekty.
A11. Virus a hostitelský organismus: Patogeneze virových infekcí, interferony.
A12. Stavba buněk mikromycetů.
A13. Lékařsky významné mikromycety: Charakteristika, přenos, mykotoxikózy.
A14. Lékařsky významní prvoci: Charakteristika a jejich přenos.
A15. Lékařsky významní helminté: Charakteristika a jejich přenos.
A16. Zásady odběru klinických materiálů.
A17. Principy a mechanizmy specifické a nespecifické imunity.
A18. Přenos nákaz: způsoby a mechanismy šíření infekčních agens.
A19. Kultivace bakterií a diagnostika bakteriálních infekcí, jejich limitace a příklady využití. Průkaz toxinů.
A20. Diagnostika virových infekcí.
A21. Diagnostika mykotických infekcí.
A22. Diagnostika parazitárních infekcí.
A23. Sérologické vyšetření klinických materiálů: Principy základních metod, jejich výhody a limity.
A24. Metody přímého průkazu agens v diagnostice infekčních onemocnění.
A25. Beta-laktamová antibiotika: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A26. Makrolidy, linkosamidy, tetracykliny, chloramfenikol: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A27. Chinolony: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A28. Aminoglykosidy: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A29. Glykopeptidová antibiotika: Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
A30. Antivirotika. Klasifikace, mechanismy účinku a rezistence.
