|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D. (03.01.2024)
prokaryotní taxony. V evoluční části přednášky je kladen důraz na fenomény spojené s evolucí charakteristických životních stylů prokaryot (nutriční symbionti, patogeni). Zvláštní pozornost je dále věnována zdrojům evoluční variability a evoluci obrany před selekčními tlaky biologické povahy (sobecké genetické elementy, antibiotika, imunitní systém hostitele). Předmět je vhodný především pro magisterské a doktorské studenty mikrobiologie, vítáni jsou zájemci z jiných oborů. Pro porozumění probíraným tématům se doporučuje předchozí absolvování přednášek Mikrobiologie a Základy evoluční biologie. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D. (03.01.2024)
Knihy: Madigan M.T. et al.: Brock Biology of Microorganisms (15th Edition). Pearson, 2018 Brown J.W.: Principles of Microbial Diversity. ASM Press, 2015 Rosenberg E. et al. (Eds.): The Prokaryotes (4th Edition). Springer, 2014 Whitman W.B (Ed.).: Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. Wiley, 2015
vybrané přehledové články
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D. (03.01.2024)
Studenti budou hodnoceni na základě ústní zkoušky. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Jaroslav Nunvář, Ph.D. (06.03.2019)
Molekulární taxonomie, prokaryotní druh prokaryotní x eukaryotní druh, fylogenetické markery a jejich citlivost, jednogenové x vícegenové x celogenomové přístupy Raná evoluce prokaryot a hlavní členění hlavní členění prokaryot a jeho objev, LUCA a jeho predikované vlastnosti, prokaryota jako hybatelé rané evoluce planetárního ekosystému, vznik eukaryot z archeí Systematika I Terrabacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky Systematika II Hydrobacteria: nejdůležitější taxony, jejich evoluce a znaky Zdroje a mechanismy evoluční variability bodové mutace, posuvové mutace (contingency loci), repetitivní sekvence, IS elementy, hypermutabilita (mutační rychlost, evoluce evolvability), horizontální genový přenos a mobilní genetické elementy (taxonomická specificita) Evoluce patogenicity evoluční trajektorie od volně žijící bakterie k patogenovi, adaptace na imunitní systém, intracelularita, obligátní asociace s hostitelem, geneticky monomorfní patogeny Evoluce obrany obrana prokaryot před sobeckými genetickými elementy (CRISPR, restrikčně – modifikační systémy), obranné mechanismy sobeckých elementů před obrannými mechanismy hostitele, evoluce rezistence k antibiotikům Evoluce kooperace nutriční symbiózy (mízosavý hmyz, hydrotermální vývěry, hlízkové bakterie), bioluminiscentní symbiózy |