This is an introductory course of computational quantum chemistry, taken from the practical point of view of a chemist, who would like to apply it. Theoretical methods are not treated in depth, but the emphasis is on a view of the subject from a broader perspective and practical performing of calculations on a computer.
Last update: ZUSKOVA (10.02.2003)
Tato přednáška je úvodním kurzem výpočetní kvantové chemie, zaměřeným z praktického pohledu chemika, který ji chce aplikovat. Teoretické metody nejsou probírány do hloubky, spíše je kladen důraz na širší přehled problematiky a provádění výpočtů na počítači.
Literature - Czech
Last update: ZUSKOVA (10.02.2003)
A. Szabo, N. Ostlund: Modern quantum chemistry, McGraw-Hill, New York (1982).
R. G. Parr, W.Yang: Density Functional Theory of Atoms and Molecules, Oxford university press, New York (1989).
M. P. Allen, D. J. Tildesley: Computer simulation of liquids, Clarendon Press, Oxford (1987).
Requirements to the exam - Czech
Last update: doc. Dr. rer. nat. Jiří Pittner, DSc. (16.12.2011)
Zkouška probíhá ústní formou s písemnou přípravou, v rozsahu dle syllabu.
Předpokladem pro účast na zkoušce je vypracování úloh zadaných v rámci cvičení.
Syllabus - Czech
Last update: prof. RNDr. Jan Kotek, Ph.D. (20.03.2018)
Počítač jako nástroj teoretické chemie: Úvod do systému Linux, soubory, procesy, příkazová řádka Základy programování v jazyce C
Základní koncepty teoretické chemie: Časově nezávislá Schrödingerova rovnice Bornova-Oppenheimerova aproximace Plochy potenciální energie; minima, sedlové body, konické intersekce Optimalizace geometrie, výpočet harmonických vibračních frekvencí a dalších vlastností
Empirické a semiempirické výpočty, molekulová mechanika: Párový potenciál, force fields, molekulová mechanika Kombinace QM/MM, metoda onion
Neempirické výpočty: Metoda HF Post-HF metody, korelační energie Metoda DFT
Molekulová dynamika a metody Monte Carlo: Přehled MD metod Klasické trajektorie, Verletův algoritmus Výpočet termodynamických vlastností z MD trajektorií Monte Carlo výpočty
