Last update: RNDr. Jiří Liberda, Ph.D. (16.12.2009)
The course discuss proteolysis as an important mechanism of biological regulation. The topics covered involve e.g. proteasomes and non-specific degradation of intracellular proteins, apoptosis and the regulation of cell cycle, role of proteases in neurodegeneration, proteases of viruses and other human pathogens and design of protease inhibitors as novel drugs for the treatment of cancer, Alzheimer disease and AIDS. Intended for advanced students in the master course and for the PhD students of biochemistry and biology.
Lectures - in Czech -
Last update: SIMONAT (30.04.2002)
Přednáška se zabývá proteolysou jako významným mechanismem regulace biologických dějů. Témata přednášek zahrnují např. proteasomy a nespecifickou degradaci nitrobuněčných proteinů, apoptosu a regulaci buněčného cyklu, roli proteas v neurodegeneraci, virové proteasy a návrh inhibitorů proteas jako nových prostředků pro léčení rakoviny, Alzheimerovy choroby nebo AIDS. Kurs je určen pro pokročilé studenty magisterského kursu a pro postdoktorální studenty biochemie a biologie.
Literature - Czech
Last update: prof. RNDr. Jan Konvalinka, CSc. (06.11.2011)
Literatura:
Handbook of proteolytic enzymes (A.J. Barett, N. D. Rawlings and F.J. Woessner, eds.) Academic Press, New York, 1998
aktuální přehledné časopisecké články budou doporučovány nebo v elektronické formě předávány studentům během přednášek
Requirements to the exam - Czech
Last update: prof. RNDr. Jan Konvalinka, CSc. (06.11.2011)
Zkouška se koná ústní formou, student si vylosuje 3 otázky z různých témat podle syllabu z důrazem na onjasnění regulační role proteolysy.
Syllabus -
Last update: SIMONAT (29.04.2002)
Mechanism of proteolysis. Classes and families of proteases.
Non-specific degradation of proteins: N-end rule, ubiquitin pathway, proteasomes and antigen presentation by MHC I molecules. Lysosomes, cathepsins B,H, D, S and L and their inhibitors. Lysosomal degradation and the MHC II system. Cathepsins in inflammation; muscular dystrophy; tumors and metastasis.
Proteases in cellular regulation: caspases and apoptosis, cyclins, their degradation and the regulation of the cell cycle. Interleukin and ICE. Prohormones and proenzymes, signal peptidases and intercellular targetting.
Proteases in homeostasis: renin-angiotensin system., blood coagulation cascade. Proteases of human pathogens: processing of viral polyproteins in picornaviruses, flaviviruses and retroviruses. Specificity, activity and inhibition of the HIV protease. Proteases of human parasites and their inhibitors: plasmepsins, proteinases from Schistosoma and Trypanosoma. Endogenous proteinase inhibitors as regulators of proteolysis.
3-D structure of proteases and their inhibitors; rational, structure-assisted drug design, combinatorial chemistry, examples of protease inhibitors as succesful drugs.
References:
Handbook of proteolytic enzymes (A.J. Barett, N. D. Rawlings and F.J. Woessner, eds.) Academic Press, New York, 1998
Last update: SIMONAT (30.04.2002)
Mechanismus proteolysy, klany a rodiny proteas.
Nespecifická degradace proteinů: N-koncové pravidlo, ubikvitinová cesta, proteasomy. Lysosomy, katepsiny B,H,D, S a L a jejich inhibitory. Degradace proteinů v lysosomech a hlavní histokompatibilní systém II. Katepsiny v zánětlivých procesech, muskulární dystrofii a rakovinném bujení.
Proteasy v buněčné regulaci: kaspasy a apoptosa, cykliny a jejich degradace, regulace buněčného cyklu. Interleukin a ICE. Prohormony a proenzymy, signální peptidasy a jejich štěpení.
Proteasy a udržování homeostase: systém renin-angiotensin, kaskáda krevního srážení.
Proteasy pathogenů: processing virových polyproteinů v puikornavirech, flavivirech a retrovirech. Specifita, aktivita a inhibice proteasy z viru HIV. Proteasy lidských parasitů a jejich inhibitory: plasmepsiny, proteasy ze Schistosoma a Trypanosoma.
Endogenní inhibitory proteas jake regulátory proteolysy. 3-D struktura proteas a jejich inhibitorů: racionální design léčiv, kombinatoriální chemie, příklady inhibitorů proteas jako úspěšných léčiv.
