Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (04.10.2022)
please see Czech anotation.
Lectures - in Czech -
Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (09.10.2023)
Přednáška navazuje na předchozí kurzy biochemie a je zaměřena na zopakování základních znalostí na jejich osvojení a získání nadhledu a souvislostí o biochemických procesech v prokaryotických a eukaryotických buňkách. Tento kurz je určen pro studenty navazujícího magisterského studia chemických oborů a především biochemikům, s doporučeným zápisem ve 2. ročníku NMgr. studia nejen jako příprava před SZZk. Tematicky jsou eukaryotické buňky presentovány v jejich heterogenitě, jejich kompartmentaci z hlediska struktury a funkce. Detailně jsou studenti seznámeni se stavbou a funkcí biologické membrány buněk, buněčných organel a metabolických či jinak funkčních/strukturních celků, např. cytoskeletu či cytosolu, a také se zabývá ději na hranicích mezi těmito funkčními/strukturními celky, např. transport molekul či částic přes membránu, přenos signálu. Separátně jsou probírány buněčné organely s dvojitou membránou (jádro, mitochrondrie a případně chloroplasty) a jejich funkce je vysvětlována z hlediska vztahu struktury a funkce (např. včetně biosynthesy DNA a RNA). Velký důraz bude při přednáškách kladen na seznámení se s mitochondriemi, jejich strukturou a metabolickými procesy, které v této strukturované organele probíhají (dýchací řetězec, synthesa ATP, citrátový cyklus, β-oxidace mastných kyselin). Zvláštní zřetel bude brán na informace o endoplasmatickém retikulu a Golgiho aparátu vzhledem k jejich funkci v proteosynthese na polyribosomech vázaných na endopasmatické retikulum, v postranslační modifikaci proteinů, metabolismu lipidů a hydrofobních látek obecně. Informace o lysosomech a peroxisomech budou podány z hlediska jejich variability ve struktuře a funkcích. Samozřejmostí bude výuka metabolických dějů, které nejsou vázány na buněčné struktury a jsou lokalizovány v cytoplasmě buněk (metabolismus sacharidů, lipidů a aminokyselin). V závěrečné fázi budou probrány základy srovnávací biochemie a biochemie "tkání" či "orgánů".
Literature - Czech
Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (05.10.2022)
Literatura
Předpokládaná znalost:
- skripta Biochemie - Základní kurz, D. Sofrová a kolektiv autorů, 2009, Nakladatelství Karolinum
- znalosti základního kurzu Biochemie I (MC250P03)
Učebnice a příručky v českém jazyce
Kodíček M. a kol.: Biochemie: chemický pohled na biologický svět, VŠCHT, 2015.
Voet D., J. Voetová: Biochemie, Victoria Publishing, 1995.
Alberts B. a kol.: Základy buněčné biologie, Espero Publishing, 1998.
Učebnice v anglickém jazyce
Koolman J, K. H. Roehm: Color Atlas of Biochemistry, 3. vydání, Thieme, Stuttgart, New York 2013. (či pozdější vydání)
Nelson D.L., M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 5. vydání, W. H. Freeman and Company, New York 2008. (či pozdější vydání)
Alberts B. et al.: Molecular Biology of THE CELL, , 4. vydání, Garland Science, New York 2002. (či pozdější vydání)
Berg, Timoczko, Stryer – Biochemistry, 7. vydání, W.H.Freeman and Company, New York 2011 (či pozdější vydání)
Requirements to the exam - Czech
Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (09.10.2023)
Ústní nebo kombinovaná zkouška v rozsahu přednášené látky (dle výsledku hlasování na zažátku kurzu). V případě ústní zkoušky budou položeny dvě otázky s písemnou přípravou, přičemž jedna otázka je "souhrnná" - přibližně pokrývající jeden probíraný okruh, druhá otázka detailnější - pokrývající jednen konkrétní proces.
Dle výsledku hlasování na první přednášce, dne 4.10.2023 bude zkouška probíhat ústní formou.
Syllabus -
Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (04.10.2020)
please see Czech sylabus. Lectures - in Czech -
Last update: doc. RNDr. Miroslav Šulc, Ph.D. (09.10.2023)
Výuka začíná v 1. týdnu semestru, 4.10.2023
Absolventi kurzu budou buď presentovat krátkou přednášku (10 minut "short talk") na poslední hodině nebo do na poslední hodiny připraví a zašlou text (esej na tema minimálně 5-6 stránek A4 plného prostého textu v řádkování 1.5, předpokládá se použití a uvedení literárních zdrojů většinově z odborných časopisů a ne učebnic). Vybrané téma na základě upřesnění s garantem předmětu by nemělo korespondovat s tématem řešeného diplomového projektu. Termín pro výběr temat a formy je do 16.11.2023 ("first come first serve").
Dle výsledku hlasování na první přednášce, dne 4.10.2023 nebudou probíhat presentace studentů a všichni studenti si zpracují vybrané tema formou eseje. Vybrané téma na základě upřesnění s garantem předmětu by nemělo korespondovat s tématem řešeného diplomového projektu. Termín pro výběr a upřesnění temat je od 16.11. do 29.11. 2023 zasláním emailem ("first come first serve").
1. Úvod, intermediální metabolismus, srovnání prokaryotické a eukaryotické buňky (komplexní stavba eukaryotických buněk). Signalizace a regulace. Metodiky a techniky výzkumu.
2. Buněčný cytoskelet - struktura a funkce (např. buněčný cyklus)
3. Organelové a buněčné membrány, charakterizace, složení, funkce (např. transport přes membránu), lipidy a jejich role v buňce.
- Organely s dvojitou membránou - jádro, mitochondrie, chloroplasty
4. Jádro - stavba a funkce. Biosynthesa DNA a RNA
5. Mitochondrie - složení a vlastnosti vnitřní a vnější mitochondriální membrány, matrix, metabolické procesy v mitochondiálních kompartmentech (dýchací řetězec, synthesa ATP, citrátový cyklus, β-oxidace mastných kyselin)
6. Endoplasmatické retikulum, stavba a funkce. Membránově vázané ribosomy, proteosynthesa, posttranslační modifikace proteinů v lumen endoplasmatického retikula, metabolismus lipidů a hydrofobních látek
7. Golgiho aparát - stavba a funkce, lysosomy - jejich tvorba, složení a funkce, peroxisom - jejich heterogenita a diferencované funkce
8. Metabolické procesy v cytoplasmě (metabolismus sacharidů - glykolýza, pentosový cyklus, proteosynthesa na volných ribosomech, metabolismus lipidů a aminokyselin)
9.Ostatní organely (peroxisomy, lysosomy, ....)
10. Energetický metabolismus v kostce (shrnutí, souvislosti a regulace)
11. Tkáně a orgány (specifika, propojení, regulace dějů, ...)
