Molecular Biology and Genetics II - MC250P16N

• Title: Molekulární biologie a genetika II
• Czech title: Molekulární biologie a genetika II
• Guaranteed by: Department of Biochemistry (31-250)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2019
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:2/0, Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: prof. RNDr. Jan Konvalinka, CSc.
• Teacher(s): prof. RNDr. Jan Konvalinka, CSc.
• Incompatibility : MC250P16, MC250P16A
• Is incompatible with: MC250P16

Annotation

Last update: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D. (08.03.2019)

Jedná se o sérii přednášek o různých metodických aspektech moderní molekulární biologie. Staví na základech
přednášky Molekulární biologie I. Témata zahrnují různé metody práce s rekombinantní DNA, sekvenování DNA a
genomiku, expresi a purifikaci proteinů, transgenní zvířata a kombinatorické přístupy v moderní biologii. Etické a
společenské aspekty moderní biologie budou rovněž diskutovány. Student by měl mít širší základy znalostí
biochemie a fysikální chemie. Kurs je určen pro pokročilé studenty magisterského kursu a pro postdoktorální
studenty biochemie a biologie.

Literature

Last update: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D. (08.03.2019)

Molecular Cell Biology, 6th edition (Lodish, H., Berk, A. et al., W.H. Freeman and Co., New York 2008), s důrazem na kapitoly 4-9)

Molecular Biology of the Cell, 4th edition (Alberts, B. et al., Garland Publishers 2002), zejména kapitoly 1-9

Úvod do molekulární biologie, 4. vydání (Stanislav Rosypal, 2006)

Další odborná literatura (hlavně aktuální přehledné časopisecké články) bude studentům doporučována a předávána průběžně během přednášek.

Requirements to the exam

Last update: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D. (08.03.2019)

Zvládnutí požadovaného materiálu podle syllabu a schopnost aplikovat příslušné znalosti při řešení konkrétních problémů molekulární biologie (návrh oligonukleotidových sond pro PCR, návrh přípravy konkrétnío rekombinantního proteinu, atp.).

Zkouška se skládá z písemné a ústní části. Písemná část má 5 otázek, k připuštění k ústní části je zapotřebí získat 50% bodů.

Syllabus

Last update: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D. (08.03.2019)

Rekombinantní DNA: isolace, příprava a manipulace s DNA (restrikční enzymy, DNA polymerasy, enzymy modifikující DNA, knihovny DNA, detekce a visualisace DNA. Příprava rekombinantní DNA). Sekvenování DNA (modelové organismy, genomové projekty, sekvenování lidského genomu: co jsme se naučili?). Polymerasová řetězová reakce a její použití.

Exprese rekombinantních proteinů (bakterie, kvasinky, hmyzí a savčí buňky. Purifikace a detekce produktů). Proteinové inženýrství (náhodná a bodově specifická mutagenese. Vztah mezi strukturou a aktivitou, návrh proteinů de novo). Identifikace a interakce proteinů (monoklonální protilátky, protein-proteinové interakce, dvouhybridový systém v kvasinkách). Kombinatorika v moderní biologii (peptidové a nepeptidové knihovny, genové čipy).

Savčí buňky jako experimentální nástroj (imortalisace buněčných linií, růstové faktory, kmenové buňky).

Transgenní zvířata (genový knock-out, genově modifikované organismy, genová technologie v zemědělství a medicíně)

Společenské a etické aspekty moderní biologie a rekombinantní DNA: požehnání nebo hrozba?