|
|
|
||
|
Last update: Mgr. Marian Novotný, Ph.D. (11.07.2012)
Na podrobnější pohled na 3D strukturu významných proteinů a komplexů však nezbývá v obecných přednáškách mnoho času. Předmět Strukturní základy buněčné biologie se chce proto soustředit právě na 3D struktury makromelekul a hledat odpovědi na otázky jako: - jak velikost, tvar či povrchový náboj ovlivňují funkci proteinů? - jakou mutací lze zvýšit rychlost reakce u daného enzymu? - jak změnit substrátovou specificitu studovaného proteinu? - které aminokyseliny jsou zodpovědné za interakci s DNA? - lze na základě podobnosti vazebného místa pro ligand usuzovat na příbuznost proteinů? Na úvod se krátce seznámíme s metodami sloužícími k určení 3D struktur makromolekul, strukturními databázemi a nástroji sloužícími k hodnocení kvalit struktur. Jadrém předmětu však bude samostatná studentská práce s originální literaturou. Na každé hodině zazní dvě studentské prezentace popisující publikace- jedna bude na předem vybranou významnou práci, která ovlivnila směřování buněčné biologie a druhá prezentace bude popisovat aktuální strukturně-biologický článek, který si student sám vybral, doplněný o seznam zajímavých publikací, které vyšli v posledním čísle vybraných časopisů. O obou prezentovaných článcích budeme na závěr vézt diskuzi. Studenti tak v předmětu získají nejenom zajímavé poznatky o strukturní biologii, které rozšíří znalosti získané dříve, ale získají také možnost zdokonalit se v práci s literárními zdroji, prezentačních dovednostech a diskusi nad vědeckými problémy. |
|
||
|
Last update: Mgr. Marian Novotný, Ph.D. (11.07.2012)
Cílem předmětu je nabídnout studentům prostor rozvíjet se samostatnou prací a tréninkem důležitých "vědeckých" dovedností jako jsou práce s databázemi literárních zdrojů, příprava a prezentace vědeckého příspěvku a kritického přístupu k prezentovaným datům. V neposlední řadě je jedním z cílů i rošíření znalostí o buněčné biologii prostřednictvím dat získaných za pomoci strukturní biologie. |
|
||
|
Last update: Mgr. Marian Novotný, Ph.D. (11.07.2012)
Liljas A., Liljas L, Piskur J., Lindblom G., Nissen P. and Kjeldgaard M. Textbook Of Structural Biology. World Scientific Publishing Company; Pap/Cdr edition (February 4, 2009). ISBN-10: 9812772081 Kessel A. and Ben-Tal N. Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion. CRC Press; 1 edition (December 17, 2010).ISBN-10: 1439810710 Branden K. and Tooze J.Introduction to Protein Structure. Garland Science; 2 edition (January 3, 1999). ISBN-10: 0815323050 Lesk A. Introduction to Protein Science: Architecture, Function, and Genomics. Oxford University Press, USA; 2 edition (May 20, 2010). ISBN-10: 0199541302 |
|
||
|
Last update: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (24.10.2019)
Na úvod se krátce seznámíme s metodami sloužícími k určení 3D struktur makromolekul, strukturními databázemi a nástroji sloužícími k hodnocení kvalit struktur. Jadrém předmětu však bude samostatná studentská práce s originální literaturou. Na každé hodině zazní dvě studentské prezentace popisující publikace- jedna bude na předem vybranou významnou práci, která ovlivnila směřování buněčné biologie a druhá prezentace bude popisovat aktuální strukturně-biologický článek, který si student sám vybral, doplněný o seznam zajímavých publikací, které vyšli v posledním čísle vybraných časopisů. O obou prezentovaných článcích budeme na závěr vézt diskuzi. |
|
||
|
Last update: Mgr. Marian Novotný, Ph.D. (11.07.2012)
V případě zájmu převyšujícího kapacitu předmětu bude studentům zaslán problém, který se pokusí do 48 hodin s využitím všech dostupných zdrojů vyřešit a odpověď zašlou emailem. Na základě zaslaných odpovědí budou vybráni studenti, kteří se přředmětu zůčastní. |