Phylogeography and methods of Historical Biogeography - MB170P97

• Title: Fylogeografie a metody historické biogeografie
• Czech title: Fylogeografie a metody historické biogeografie
• Guaranteed by: Department of Zoology (31-170)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2014
• Semester: winter
• E-Credits: 5
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:2/2, C+Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: doc. RNDr. Pavel Hulva, Ph.D.
• Teacher(s): doc. RNDr. Pavel Hulva, Ph.D.

Annotation

English

Last update: Ing. Jindřiška Peterková (25.10.2019)

The course should combine comprehensive methodological information on (molecular) phylogeography techniques with analogous ones information concerning the biogeographical context of paleontological evidence and contextual methodological aspects paleoclimatic information. An essential aspect of the course would be practical exercises focused on familiarization with the relevant software.

Czech

Last update: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Předmět by měl kombinovat zevrubnou metodickou informaci o technikách (molekulární) fylogeografie s analogickými
informacemi týkajícími se biogeografických souvislostí paleontologické evidence a metodickými aspekty kontextuální
informace paleoklimatické. Zásadním aspektem kursu by byla praktická cvičení soustředěná na seznámení s příslušnými
softwarovými prostředky.

Literature

English

Last update: Ing. Jindřiška Peterková (24.10.2019)

Avise J.C. 2000. Phylogeography: The History and Formation of Species.Harvard University Press.

Bradley R.S. 1999. Palaeocliomatology. Elsevier , San Diego- NY.

Crisci J.V. et al., 2003: Historical Biogeography. Harvard University Press.

Software Analysis in Macroecology, manual.

Czech

Last update: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Avise J.C. 2000. Phylogeography: The History and Formation of Species.Harvard University Press.

Bradley R.S. 1999. Palaeocliomatology. Elsevier , San Diego- NY.

Crisci J.V. et al., 2003: Historical Biogeography. Harvard University Press.

Software Analysis in Macroecology, manual.

Syllabus

Last update: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Blok 1 - Fylogeografie: Tradiční postupy kvantitativní historické biogeografie (kladistická analýza apod.), specifika molekulárních markerů, historie výzkumu mitochondriální DNA, jaderné geny, molekulání hodiny, spojení demografie s fylogenetikou, lineage sorting, koalescenční teorie, dynamika vývoje populační velikosti, skyline ploty, nested-clade analysis, fylogeografické hypotézy, empirické studie, speciace

Blok 2 - Kvantiativní areografie fosilního záznamu. Získávání paleonvironmentální a paleobiogeografické informace, charakter dat, inference paleobiogeografické informace.

Blok 3 - Klimatická a paleoklimatická data, proměné a klasifikační systémy globální klimatologie, strukutra databasí a softwarových prostředků areálové analýzy a (S.A.M., apod.).