Last update: RNDr. Veronika Sacherová, Ph.D. (28.05.2019)
This course will be focused on the origins and evolution of biological diversity on long temporal scales and at the
level of phylogenetic lineages. We will pay attention to both species diversity and the diversity of traits and
strategies of organisms (disparity). We will talk about major trends in the evolution of life on Earth and the
underlying processes that can be inferred from the study of genes, phylogenetic trees, and paleontological record.
Students will also learn about modern approaches to the analysis of diversity and how to ask interesting
questions.
You will have to choose a paper (or a series of related papers) on a macroevolutionary topic and present its
contents to all of us at the end of semestr (we will discuss and evaluate the presented study).
This course assumes that you know only basic undergraduate biology and thus is convenient for students
studying diverse subjects (zoology, botany, ecology, evolutionary biology etc.).
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (18.09.2019)
Přednáška se bude věnovat vzniku a vývoji biologické diverzity na dlouhých časových škálách a na úrovni celých fylogenetických linií.
Pozornost bude věnována jak diverzitě druhové, tak diverzitě vlastností a strategií organizmů
(disparita). Budou představeny základní trendy v evoluci života na Zemi a jejich zákonitosti, které se dají odvodit ze
studia genů, fylogenetických stromů a paleontologického záznamu. Seznámíte se s řadou moderních přístupů k
analýze diverzity a naučíte se klást zajímavé otázky.
V rámci předmětu si studenti zvolí jeden článek (příp. soubor článků) o makroevoluci a na konci semestru
prezentují jeho obsah ostatním (spolu s jeho zhodnocením a diskuzí).
Přednáška předpokládá pouze běžné znalosti bakalářské biologie a je tedy vhodná pro celou řadu magisterských
zaměření (zoologie, botanika, ekologie, evoluční biologie atd).
Literature -
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (08.01.2020)
This book provides good overview of the material covered in this course: Bromham, Cardillo (2019) Origins of Biodiversity. Oxford UP
This book is a modern overview of evolutionary biology, including macroevolution: Losos et al. (eds, 2017) The Princeton Guide to Evolution. Princeton UP
Following books can be recommended as supplementary reading: Baum, Smith (2012) Tree Thinking: An Introduction to Phylogenetic Biology. WH Freeman Boenigk et al. (2015) Biodiversity and Earth History. Springer Lane (2010) Life Ascending: The Ten Great Inventions of Evolution. WW Norton and Co. Maynard Smith, Szathmáry (1995) The Major Transitions in Evolution. Oxford UP Shubin (2009) Your Inner Fish: A Journey into the 3.5-Billion-Year History of the Human Body. Vintage Simpson (1944) Tempo and Mode in Evolution. Columbia UP reprint from 1984 (old but worth reading) Zimmer, Emlen (2016) Evolution: Making Sense of Life. Roberts and Co. (selected chapters, mainly no. 3, 4, 13-15, 17)
Other relevant literature (books and book chapters) can be recommended to those interested in particular topics.
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (08.01.2020)
Tato kniha poskytuje slušný přehled problematiky tohoto kurzu: Bromham, Cardillo (2019) Origins of Biodiversity. Oxford UP
Tato kniha je moderní přehled evoluční biologie, včetně makroevoluce: Losos et al. (eds, 2017) The Princeton Guide to Evolution. Princeton UP
Následující knihy stojí za pozornost a přečtení: Baum, Smith (2012) Tree Thinking: An Introduction to Phylogenetic Biology. WH Freeman Boenigk et al. (2015) Biodiversity and Earth History. Springer Lane (2011) Vývoj života - deset velkých vynálezů evoluce. Kniha Zlín Maynard Smith, Szathmáry (1995) The Major Transitions in Evolution. Oxford UP Shubin (2009) Ryba v nás: Cesta tři a půl miliardy let dlouhou historií lidského těla. Paseka Simpson (1944) Tempo and Mode in Evolution. Columbia UP reprint z roku 1984 (stará ale stojí za přečtení) Zimmer, Emlen (2016) Evolution: Making Sense of Life. Roberts and Co. (relevantní kapitoly, zejm. č. 3, 4, 13-15, 17)
Další knihy a kapitoly v knihách mohou být doporučeny zájemcům o konkrétní problematiku během přednášek.
Requirements to the exam -
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (25.11.2020)
Oral examination; presentation of the analysis of a scientific paper
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (25.11.2020)
Ústní zkouška; prezentace rozboru odborného článku
Syllabus -
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (25.11.2020)
In this course, following topics will be presented:
Introduction (What is macroevolution? Brief history of ideas) Progress and trends in evolution Major transitions in evolution Evo-devo: deep homologies, genes, and evolutionary novelties Comparative biology: Phylogenetic trees and trait evolution Species, speciation, and geography of evolution Evolutionary radiations, diversification, and extinctions Geography of evolutionary lineages and diversity Evolution of behaviour and species interactions
We will also cover historical and theoretical aspects of these topics during lectures.
Last update: prof. Mgr. Vladimír Remeš, Ph.D. (25.11.2020)
V přednášce se budeme zabývat následujícími tématy:
1) Úvod (Co je makroevoluce? Krátká historie oboru) 2) Pokrok a trendy v evoluci 3) Velké přechody (major transitions) v evoluci 4) Evo-devo: hluboké homologie, geny a evoluční novinky 5) Srovnávací biologie: Fylogenetické stromy a evoluce znaků 6) Druhy, speciace a geografie evoluce 7) Evoluční radiace, diverzifikace a vymírání 8) Geografie evolučních linií a diverzity 9) Evoluce chování a interakcí mezi organizmy
Během přednášky budeme zmiňovat historické a teoretické souvislosti probírané látky.
