Last update: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (30.08.2023)
Please note, this course is tought in czech language.
Basic course covering the fundamentals of Biochemistry. The structures and properties of biomolecules are presented with the emphasis on the molecular logic of living organisms. Content in brief : Water - structure and properties; acids and bases. Amino acids and peptides. Proteins - from primary to quaternary structure, properties of fibrilar proteins. Enzymes - catalytic properties, classification, kinetics, modulation of activity. Vitamins and coenzymes. Principles of metabolism. Carbohydrates, fatty acids, lipids, amino acids and nucleotides - structure, properties, biological significance, catabolism and biosynthesis. Principles of bioenergetics. Electron transport and oxidative phosphorylation.
High-school knowledge of chemistry is expected.
Last update: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (30.08.2023)
Kurz je vhodný pro studenty kteří chtějí získat přehled o základech biochemie, zejména se zřetelem na buněčnou energetiku a metabolismus. Přednášky shrnují poznatky z biochemie pro studenty kteří se nechtějí podrobněji věnovat biomedicínskému nebo molekulárně biologickému curriculu.
Porozumění látce nevyžaduje předchozí studium organické a/ nebo fyzikální chemie, předpokládá se ale, že studenti mají základy středoškolské chemie. V případě, že jsou si studenti vědomi nedostatků v těchto základech, doporučujeme samostudium předmětu Repetitorium ze středoškolské chemie.
Literature - Czech
Last update: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (01.10.2014)
Biochemie, 1995, Voet, D, Voet, J.G., Victoria Publishing, Praha; ISBN 80-85605-44-9 Biochémia, 2000, Ferenčík, M., Škárka, B., Novák, M., Turecký,L. Slovak Academic Press, s.r.o., Bratislava; ISBN 80-88908-58-2 Biochemie, 1996, Vodrážka, Z., 2. vydání, Academia, Praha; ISBN 80-200-0600-1 Harperova Biochemie, 2002, Murray, R.K., Ganner, D.K., Mayes, P.A., Rodwell, V.W., 3. vydání, nakladatelství a vydavatelství H&H; ISBN 80-7319-013-3 Biochemie, Kolektiv autorů katedry biochemie, Karolinum, Praha, ISBN Biochemistry (An introduction), 1996, McKee, T., McKee, J.R. Wm. C. Brown Publishers, Dubuque; ISBN 0-697-21159-2 Lehninger Principles of Biochemistry, 2000, 3rd edition, Nelson, D.L., Cox, M.M. Worth Publishers, New York; ISBN 1-57259-153-6 Principles of Biochemistry, 1995, Zubay, G.L., Parson, W.W., Vance D.E. Wm.C. Brown Communications, Inc., Nelson, M. C. L. ISBN 0-697-14275-2
Zapsaní studenti mají možnost využívat materiály na stránkách studovny v rámci Moodle (dl2.cuni.cz).
Requirements to the exam - Czech
Last update: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (30.08.2023)
Zkouška má formu písemného testu v 1. a 1. opravném termínu. Pro 2. opravný termín a při termínech po druhém zápisu předmětu je forma ústní.
Písemný test se skládá z 20 otázek, které testují znalosti v rozsahu syllabu přednášky. Otázky jsou typu a) výběru jedné správné odpovědi ze čtyř možností a b) "multiple choice" - výběru správných odpovědí, které mohou být v libovolném počtu (0 až 4).
Syllabus - Czech
Last update: doc. RNDr. Petr Folk, CSc. (30.08.2023)
1 VODA A AMINOKYSELINY Biogenní prvky, Voda, Funkční skupiny a jejich vlastnosti, Základní typy molekul
2 PROTEINOVÉ STRUKTURY Kovalentní struktura proteinů, Sekundární a terciární struktury, Fibrilární proteiny, Globulární proteiny, Kvartérní struktury
3 FUNKCE PROTEINŮ Vazba ligandu, Kooperativita, Vlastnosti enzymů, Mechanismy katalýzy a kinetika, Chymotrypsin jako příklad enzymu, Koenzymy, Regulace enzymových reakcí
4 MONO- A POLYSACHARIDY Monosacharidy, oligo-, polysacharidy, jejich deriváty – výběr, jejich funkce; Glykoproteiny, proteoglykany, funkce
5 LIPIDY A MEMBRÁNY – se zřetelem k stavbě a funkčním vlastnostem biomembrán Tuky a mastné kyseliny, Vosky, Terpeny, Membránové lipidy, Glycerolipidy a sfingolipidy, Lipoproteiny, Složení a stavba biomembrán
6 ÚVOD DO METABOLISMU Oxidoredukční reakce, Makroergní sloučeniny, Základní logika metabolismu, Role ATP a NAD(P)H, Metabolická dráha - tok dráhou, Regulace dráhy
7 GLYKOLÝZA Logika dráhy, Přípravná a výkonná fáze, Jednotlivé reakce dráhy, Glykolýza jako součást fermentace, Glykolýza v anaerobním metabolismu svalu, Regulace glykolýzy
8 CITRÁTOVÝ CYKLUS Metabolické zdroje acetylkoenzymu A, Jednotlivé reakce citrátového cyklu, Regulace citrátového cyklu, Amfibolická povaha citrátového cyklu
9 TRANSPORT ELEKTRONŮ A OXIDATIVNÍ FOSFORYLACE Transport elektronů, Struktura a funkce komplexů I až IV, Oxidativní fosforylace, Regulace tvorby ATP, Struktura a funkce FoF1-ATPázy
10 FOTOSYNTÉZA Absorpce světla, Tok elektronů závislý na fotonech, Fotofosforylace a tvorba ATP, Evoluce fotosyntézy
11 PŘEHLED HLAVNÍCH BLOKŮ METABOLISMU I – se zřetelem k hlavním typům sloučenin v rámci živočišného metabolismu Odbourávání a syntéza mastných kyselin, Metabolismus tuků, Glukoneogeneze
12 PŘEHLED HLAVNÍCH BLOKŮ METABOLISMU II Metabolismus aminokyselin, Pentosafosfátová dráha, Syntéza nukleotidů.
