Last update: doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. (11.01.2023)
The lecture course will focus primarily on viruses, which cause diseases in humans and animals and which are diagnosed as
a part of routine medical practice. Our main emphasis will be on diagnostic principles and epidemiological aspects.
At the beginning of the course, we will outline basic definitions used in epidemiology and molecular epidemiology. We will
characterize regulations for evaluating diagnostic methods and commercial tests, describe methods and rules of work in a
virological laboratory as well as define principles of good laboratory practice.
In subsequent lectures we will focus on groups of viruses that cause diseases with similar clinical manifestation (e.g.
respiratory viruses or viruses causing hepatitis) and specify their mode of transmission, incubation period, type of infection,
clinical symptoms, diagnostics, prevention and prophylaxis.
Lectures concerning viruses with veterinary importance will be focused on zoonotic viruses or viruses with zoonotic
potential, viruses with high economical importance and viruses with interesting or unknown pathogenesis of the disease.
Last update: doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. (11.01.2023)
V LS 2020/21: Přednášky budou , pravidelně ve středu od 9 hodin, začátek 15.2., pouze v případě služební cesty či nemoci přednášejícího budou probíhat online na platformě GoogleMeet.
Podmínky zkoušení jsou stejné jako v minulých letech.
Prezentace budou k dispozici na Google disku garantky předmětu.
Více informací dostanete na 1. přednášce.
Přednáška bude zaměřena především na viry, které vyvolávají častá onemocnění u lidí a zvířat a jejichž diagnostika se
provádí v rutinní praxi. Hlavní důraz bude na diagnostické principy a epidemiologické aspekty.
V úvodu budou vymezeny některé základní pojmy epidemiologie a molekulární epidemiologie, principy hodnocení
diagnostických metod a komerčních testů, způsob a principy práce ve virologické laboratoři, zásady správné laboratorní
praxe, primární prevenci - očkování.
Další přednášky budou zaměřené na skupiny virů vyvolávajících onemocnění s podobnou klinickou manifestací např.
respirační viry, viry vyvolávající hepatitidy apod. Pro každou skupinu bude probrán způsob přenosu, inkubační doba, typy
infekce, klinické projevy, diagnostika, prevence a profylaxe.
Přednášky zaměřené na zvířecí viry budou rozděleny na viry vyvolávající zoonózy nebo mající zoonotický potenciál, dále
na viry s mimořádným ekonomickým významem a konečně na viry s pozoruhodnou nebo dosud neobjasněnou patogenezí
onemocnění.
Předpokládá se absolvování základní přednášky virologie.
Literature
Last update: doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. (25.10.2019)
Literature:
The molecular epidemiology of human viruses: ed. Thomas Leitner, 2002 Veterinary Virology: Frederick A. Murphy, E. Paul J. Gibbs, Marian C. Horzinek, Michael J. Studdert, Third Edition, Epidemiologic methods in studying chronic diseases: Jedrychowski W. a Maugeri U., 2000 Cancer epidemiology: principles and methods: IARC 1999 Encyclopedia of Virology: Granoff and Webster ed., 2nd edition, 1999 Medical Virology: White and Fenner, 4th edition, 1994 Medical Microbiology: Murray, Rosenthal, Kobayashi, Pfaller, 4th edition, 2002 Fields Virology: Fields, Knipe and Howley, 3rd edition, 1996 Viruses and Human Disease: Strauss and Strauss, 2nd edition, 2007
Requirements to the exam
Last update: doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. (25.10.2019)
Students must past written and oral part of the exam.
Written exam:
Maximum 5 points per question. Altogether 210 points.
To be able to continue to oral exam the minimum of > 105 points (50%) has to be reached, but the best mark will be than 3 without the possibility to improve it during the oral examination.
126 – 147 bodů 3
148 – 168 bodů 2
169 – 210 bodu 1
105 50%
126 60%
147 70%
168 80%
189 90%
Syllabus -
Last update: doc. RNDr. Ruth Tachezy, Ph.D. (25.10.2019)
Basic principles of epidemiology and molecular epidemiology of viruses. Types of epidemiological studies, terms prevalence, incidence, mortality, morbidity, principals of utilization of application of molecular epidemiology in virology. How to prove aetiology of viral infection of a disease, eradication of diseases, epidemics, pandemics. Laboratory methods, focused on those used in the routine practice, sampling of patients, transport of clinical samples, pre analytic and post analytic processing of clinical samples, good laboratory practice, certification of laboratories, external control of quality. Characteristics of tests for routine viral detection.
Pathogenesis of viral infections HBV, HAV, HCV, and other viruses causing hepatitis Herpetic viruses - HSV1,2, CMV, EBV, HHV6, HHV8, VZV Influenza and other respiratory viruses HIV, papillomaviruses
Zoonosis - rhabdovirus, influenza Viruses of cats and dogs Animal retroviruses, parvoviruses, circoviruses, coronaviruses
Last update: TACHEZYR (19.03.2014)
Základní pojmy epidemiologie a molekulární epidemiologie. Typy studií, pojem prevalence, incidence, mortalita, morbidita, principy využití molekulární epidemiologie ve virologii, průkaz etiologické souvislosti virové infekce s onemocněním, eradikace onemocnění, epidemie, pandemie. Laboratorní metody. Přehled diagnostických metod používaných pro rutinní praxi a jejich principy, odběr klinických vzorků, transport, preanalytická fáze zpracování klinických materiálů, správná laboratorní praxe (např. externí hodnocení kvality, akreditace laboratoří, doporučení), citlivost, specificita, PPV, NPV, RLU křivka, analytická citlivost, klinická citlivost diagnostických testů, in vitro diagnostika a spolehlivost komerčních setů.
Patogeneze virových onemocnění HBV, HAV, HCV, a další viry vyvolávající hepatitidy Herpetické viry - HSV1,2, CMV, EBV, HHV6, HHV8, VZV Chřipka a další respirační viry HIV, HPV Virové gastroenteritidy - rotaviry, noroviry, astroviry Rubeolla, příušnice, spalničky
Zoonózy - virus vztekliny, virus chřipky savců a ptáků, paramyxoviry, anelloviry Hospodářsky významné virové infekce zvířat - pestiviry, virus slintavky a kulhavky, virus Newcastelské choroby ptáků, herpesviry zvířat Retroviry zvířat, circoviry, parvoviry, coronaviry
