Practical course essentials in molecular biology I - MB140C71

• Title: Základní praktikum z molekulární biologie
• Czech title: Základní praktikum z molekulární biologie
• Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2019 to 2023
• Semester: summer
• E-Credits: 1
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:0/1, C [DS]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: 18
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Level: basic
• Explanation: jednodenní turnusové prakrtikum
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.
• Teacher(s): Mgr. Kamila Horáčková; Mgr. Martin Kubů; Mgr. Kristýna Ľalíková; RNDr. Tomáš Mašek, Ph.D.; Mgr. Kristina Roučová; Khushboo Sharma, M.Sc.; Mgr. Václav Vopálenský, Ph.D.
• Class: Ultracentrifuga a 3 rotory; Gradientový PCR cycler
• Incompatibility : MB140C72
• Is incompatible with: MB140C72

Annotation

Last update: RNA_CLUB/NATUR.CUNI.CZ (13.01.2011)

Cvičení sestává z teoretické, demonstrační a praktické části. Před cvičením je doporučeno absolvovat alespoň jednu z následujících přednášek: Základy molekulární biologie, Molekulární biologie, Biologie buňky, Biochemie, Genetika ale není to podmínkou.

Literature

Last update: RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D. (05.04.2012)

K tomuto praktiku není doporučená literatura. Studenti obdrží protokoly s dalšími informacemi v průběhu praktika.

Requirements to the exam

Last update: RNDr. Martin Pospíšek, Ph.D. (05.04.2012)

Studenti ukončí praktikum vypracováním protokolů a složením zápočtového testu. Více informací, texty, protokoly a presentace jsou pro studenty zapsané do kurzu k dispozici na http://web.natur.cuni.cz/~pospisek

Syllabus

Last update: Mgr. Václav Vopálenský, Ph.D. (24.08.2017)

1) V teoretické části budou stručně diskutovány základní techniky genového inženýrství s důrazem na ty, které budou použity v praktické části:

PCR, sekvenování, analytická elektroforetická separace proteinů a nukleových kyselin, DNA vektory, genomové a cDNA knihovny. Základní molekulárně biologické databáze (NCBI-NIH atd). Krátce i využití těchto metod a databází v lékařské, soudní a biotechnologické praxi. Před detailním popisem metod bude dávána přednost jejich aktualizaci v souladu se současnými znalostmi publikovanými v odborných i laických médiích širokého dosahu. Předpokládá se možnost aktuálních změn v reakci na dotazy a potřeby zúčastněných studentů.

 

2) V demonstrační části budou ukazovány některé náročnější metody diskutované v teoretické části dle aktuálních možností (např. pozorování exprese cizorodých bílkovin v kultuře E.coli - proteinová elektroforéza, sledování fluorescence zeleného fluorescenčního proteinu in vivo).

 

3) V praktické části si každý student vyzkouší mapování DNA restrikčními endonuklázami, polymerasovou řetězovou reakci (PCR), detekci nukleových kyselin pomocí agarosové elektroforézy, srážení nukleových kyselin pomocí alkoholu a solí.

 

Studenti si vyzkouší volně dostupné počítačové programy pro navrhování DNA primerů pro PCR a programy pro klonování in silico a další teoretické úlohy s využitím veřejných mol.biol. databází.

 

Studenti ukončí praktikum vypracováním protokolů a složením zápočtového testu. Více informací, texty, protokoly a presentace jsou pro studenty zapsané do kurzu k dispozici na http://web.natur.cuni.cz/~pospisek