Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (20.08.2014)
The laboratory course consists of the spectrum of basic and advanced methods used in physiology of bacteria to
characterize bacterial growth, metabolic variability and regulation of gene expression in response to the environmental
condition. The course is held in Czech.
Last update: doc. RNDr. Radovan Fišer, Ph.D. (08.10.2020)
Pokud to bude možné, v roce 2020/2021 proběhne cvičení prezenční formou. V případě změny na on-line verzi budou zapsaní studenti včas informováni.
Kurz je volitelným rozšířením předmětu Fyziologie bakterií. Cílem praktika je seznámit se se spektrem metod základních i pokročilých, umožňujících sledovat profilové fyziologické vlastnosti bakterií, tj. růst, rozmanitost energetického metabolizmu a regulaci genové exprese v závislosti na podmínkách vnějšího prostředí. Kurz je veden v českém jazyce.
Literature -
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (03.10.2012)
Mikrobiologické praktikum, František Kaprálek, 1999, Karolinum
Practical course manuals (updated version will be available in advance, before the course start). (in Czech language)
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (20.08.2014)
Mikrobiologické praktikum, František Kaprálek, 1999, Karolinum Návody k úlohám (aktuální verze, v elektronické podobě, budou k dispozici v předstihu před zahájením praktika).
Requirements to the exam -
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (05.04.2012)
To obtain credits for this course, the requirements are following: 100% presence during the course run, correctly elaborated protocols (electronic version, handover in the last day of the course run).
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (03.10.2012)
Zápočet bude udělen v případě 100% docházky do praktika a odevzdání správně vypracovaných protokolů (výhradně v předepsané elektronické verzi). Protokoly se odevzdávají v poslední den kurzu.
Syllabus -
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (18.05.2015)
Within the one week course four experiments will be performed: 1. Growth yield and metabolic rate measurement in growing bacterial culture; effect of energy metabolism type on growth rate, growth yield and metabolic rate of bacterial culture. 2. Induction of enzyme synthesis in growing bacteria and catabolic repression. 3. Measurement of protein and RNA level in a bacterial cell
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (18.05.2015)
V programu týdenního praktika budou provedeny čtyři úlohy: 1. Růstový výtěžek a metabolická rychlost u rostoucí kultury bakterií; vliv typu energetického metabolizmu na růstovou rychlost, růstový výtěžek a metabolickou rychlost bakterií. 2. Indukce syntézy enzymu u rostoucích bakterií a katabolická represe. 3. Stanovení obsahu proteinů a RNA v bakteriální buňce
Entry requirements - Czech
Last update: RNDr. Jana Beranová, Ph.D. (20.08.2014)
Kurz je rozšířením předmětu Fyziologie bakterií (MB140P34; korekvizita), nicméně není k této přednášce povinný. Je určen pro studenty se zájmem o mikrobiologii. Podmínkou je dřívejší absolvování předmětu Mikrobiologie MB140P33I! Kapacita předmětu je 20 osob a nemůže být z technických důvodů navýšena.
Pro účast v praktiku je podmínkou složení vstupního testu - termín bude s předstihem oznámen.
Protokoly se odevzdávají v elektronické podobě ve formátech *.doc, *.odt nebo *rtf. Předpokládá se tedy nejméně slušná uživatelská znalost příslušného textového editoru. Rovněž je nutná znalost tvorby grafů (MS Excel, OpenOffice). Některými daty se prokládá přímka pomocí funkce lineární regrese. K tomu lze použít následující programy: MS Excel, Gnumeric, Origin, Qtiplot, Fityk, Gnuplot nebo R (OpenOffice nemusí vyhovět). Odkazy na dostupný software: http://projects.gnome.org/gnumeric/, http://soft.proindependent.com/qtiplot.html, http://fityk.nieto.pl/, http://www.gnuplot.info/, http://www.r-project.org/
Během praktika lze s výhodou používat vlastní notebook pro průběžné zpracování dat. (Vlastní notebook není podmínkou. Studenti bez vlastní výpočetní techniky mohou protokoly zpracovávat v počítačových účebnách PřF.)
