Last update: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (12.12.2006)
Structure and function of the plant cytoskeleton. Methods for cytoskeleton studies. Tubulin and actin - biochemical properties, isoforms and posttranslational modifications. Associated proteins - characterization, localization, function. Changes of cytoskeleton in plant cell cycle. Motor proteins, vesicle and organelle transport. Gene for plant cytoskeleton - localization, expression and regulation. Construction, selection and utilization of genotypes with modiefied cytoskeleton. The role of cytoskeleton in the plant morphogenesis including ontogenetic and organ specifity.
Last update: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (12.12.2006)
Přednáška podává přehled o struktuře a funkci cytoskeletu rostlinné buňky. Informuje o metodách studia cytoskeletálních proteinů, o biochemických vlastnostech mikrotubulů, mikrofilament, intermediálních filament a asociovaných proteinů. Zabývá se účastí cytoskeletu v morfogenezi rostlin, zejména rolí v buněčném cyklu, syntéze buněčné stěny a transportu. Zahrnuje i reakce CS na různé typy signálů, vliv xenobiotik (zejména těžkých kovů) a faktorů vnějšího prostředí. Představuje i nejnovější poznatky o tubulinových genech, cytoskeletálních mutantách a drogách, včetně jejich využití.
Literature -
Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (29.10.2019)
Buchanan, B.B. et al.: Biochemistry and molecular biology of plants, American Society of Plant Physiologists, Rockville, Maryland , 2001. Hyams, J.S., Lloyd, C.L.: Microtubules. Wiley-Liss, New York, 1994. Sheterline, P. et al.: Actin. Oxford University Press, Oxford, 1998. Nick, P et al.: Plant Microtubules. Springer Berlin, 2001. Staiger, C. J. et al. Actin: A dynamic framework for multiple plant cell, Functions. Kluwer Academic Publ. Dordrecht, 2000.
Last update: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (12.12.2006)
Nečas, O a kol.: Cytoskelet. Academia,1991.
Alberts, B. a kol. Základy buněčné biologie. Espero Publ., Ústí nad Labem, 2001.
Buchanan, B.B. et al.: Biochemistry and molecular biology of plants, American Society of Plant Physiologists, Rockville, Maryland , 2001.
Hyams, J.S., Lloyd, C.L.: Microtubules. Wiley-Liss, New York, 1994.
Sheterline, P. et al.: Actin. Oxford University Press, Oxford, 1998.
Nick, P et al.: Plant Microtubules. Springer Berlin, 2001.
Staiger, C. J. et al. Actin: A dynamic framework for multiple plant cell, Functions. Kluwer Academic Publ. Dordrecht, 2000.
Requirements to the exam
Last update: RNDr. Sylva Zelenková, CSc. (06.11.2011)
oral exam
Syllabus -
Last update: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (12.12.2006)
1. The cytoskeletal principle of the cell organization
Characterization of the cytoskeletal components. Basic function of the cytoskeleton. Nuclear and membrane skeleton. Evolution of the cytoskeleton.
2. The basic metodical approaches to the cytoskeleton studies. I.
Immunocytological and immunohistochemical approaches. Electron and confocal microscopy. GFP techniques.
3. The basic metodical approaches to the cytoskeleton studies II
Izolation and characterization of the cytoskeletal proteins. Microinjection techniques. Simulation experiments in vitro. Cytoskeletal toxins. Genetical methods and cytoskeleton mutants.
3. Microtubules
Tubulin - structure, isoforms, posttranslation modifications. Microtubules - structure, Maps and ionts binding. Proteins associated with microtubules - characterization. localization and function. Tubulin polymerazation. Microtubule organization centres. Cell structures formed by microtubules
4. Microfilaments
Actin - structure, heterogenity, genes. The microfilament structure. Actin polymerization. Associated proteins. Myosin. Cell structures formed by the microfilaments.
5. Intermediate filaments
Proteins, structure, genes, associated proteins. Intermediate filaments network in the cell, tissue specifity.
6. The functions of cytoskeleton I.
Dynamic rearrangements of the cytoskeleton during cell cycle. Microtubule function in caryo- a cytokinesis, genetical stability of the cell. Cell cycle regulation..
7. The functions of cytoskeleton II.
Involvement in the intercellular transport, cytoplasmic streaming and organelle transport. Molecular motors. The role of actin in the intercellular transport. Plasmodesms.
8. The functions of cytoskeleton III.
Genes for cytoskeleton - lokalization, stability, expression and regulation factors. Construction, selection a application of genotypes with modificated stability of cytoskeleton. Cytoskeleton in plant morfogenesis, ontogenetic and organ specifity. Response on signals - light, mechanical a gravitation stimuli, phytohormons.
9. The functions of cytoskeleton IV.
Participation of cytoskeleton during cell wall synthesis. Interaction among microtubules, microfilaments and plasmatic membrane. Deposition of celullose microfibrils mediated by microtubules. Transport of Golgi vesicules.
10. The functions of cytoskeleton V.
Cytoskeleton in the plant growth and development - cell polarity, elongation and expansion, formation of leaves primordia, stomata, trichoms, root hairs, tubers and bulbs, stems, pollen grains and tubes, cytoskeleton changes during senescence and apoptosis.
11. The functions of cytoskeleton VI.
The influence of xenobiotics and stress factors on the structure and function of cytoskeleton. Example of cytoskeleton response on abiotic a biotic stress - extreme temperatures, heavy metals, attack of fungal and virus pathogens.
Last update: RNDr. Jana Rubešová, Ph.D. (12.12.2006)
1. Cytoskeletální princip funkční organizace buňky
Charakteristika základních komponent cytoskeletu. Základní funkce cytoskeletu. Jaderný a membránový skelet. Evoluce cytoskeletu.
2. Základní metodické přístupy studia cytoskeletu I.
Imunocytologické a imunohistochemické přístupy. Elektronová a konfokální mikroskopie. GFP techniky.
3. Základní metodické přístupy studia cytoskeletu II
Izolace a charakterizace cytoskeletálních proteinů. Mikroinjekční techniky. Simulační pokusy in vitro. Cytoskeletální toxiny. Genetické metody.
3. Mikrotubuly
Tubulin - struktura, isoformy, posttranslační modifikace. Mikrotubuly - stavba, vazba s Maps a ionty. Proteiny asociované s mikrotubuly- charakterizace, lokalizace, funkce. Polymerace tubulinu. Organizační centra mikrotubulů. Buněčné struktury tvořené mikrotubuly.
4. Mikrofilamenta
Aktin - struktura, heterogenita, geny pro aktin. Struktura mikrofilament. Polymerizace aktinu. Asociované proteiny. Myosin. Buněčné struktury tvořené mikrofilamenty.
5. Intermediální filamenta
Proteiny, struktura, geny, asociované proteiny. Síť intermediárních filament v buňce, tkáňová specifita.
6. Funkce cytoskeletu I.
Dynamika přeměn cytoskeletálního aparátu v průběhu buněčného cyklu. Funkce mikrotubulů v karyo- a cytokinesi, genetická stabilita buňky. Regulace buněčného dělení.
7. Funkce cytoskeletu II.
Účast cytoskeletu ve vnitrobuněčném transportu, proudění cytoplasmy a transportu organel. Molekulární motory. Role aktinu v mezibuněčném transportu. Plasmodesmy.
8. Funkce cytoskeletu III.
Geny pro cytoskelet - lokalizace, stabilita, exprese a regulační faktory. Konstrukce, selekce a využití genotypů s modifikovanou stabilitou cytoskeletu. Cytoskelet v morfogenezi rostlin, ontogenetická a orgánová specifita. Odpověď na signály - světlo, mechanické a gravitační stimuly, fytohormony.
9. Funkce cytoskeletu IV.
Účast cytoskeletu při tvorbě buněčné stěny. Interakce mikrotubulů, mikrofilament a plasmatické membrány. Deposice celulózových mikrofibril zprostředkovaná mikrotubuly.Transport Golgiho vesikulů.
10. Funkce cytoskeletu V.
Cytoskelet při růstu a vývoji rostlin - polarita, elongace a expanse buněk, tvorba listových primordií, průduchů, trichomů, kořenových vlásků, hlíz a cibulí, stonků, pylových zrn a pylových láček, změny cytoskeletu při stárnutí a apoptóze.
11. Funkce cytoskeletu VI.
Vliv xenobiotik a stresových faktorů na strukturu a funkci cytoskeletu. Příklad odpovědi cytoskeletu na abiotický a biotický stres - extrémní teploty, těžké kovy, napadení houbovými a virovými patogeny.
