Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
A lecture in plant molecular genetics for advanced students. The actual content of the lecture is on the course website. The lecture is focused on the description of the structure, function and evolution of plant genomes (nuclear, plastid and mitochondrial), parasitic genetic elements in plants (transposons, viruses and viroids), plant epigenetics (RNA interference, DNA methylation, histone modification), methods of direct and reverse genetics, plant transgenesis. The course focuses primarily on understanding mechanisms and relationships! Secondary goals of the course are to teach students to ask the right biological questions, to read critically and interpret data (their own and others') correctly, and to think about the functioning of organisms in an evolutionary context.
For those interested, lectures on the basic principles of high-throughput methods for analyzing the flow of information in organisms (genomics, transcriptomics, proteomics) may be included beyond the knowledge required for the exam.
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
Přednáška z molekulární genetiky rostlin pro pokročilé studenty. Aktuální obsah přednášky je na webových stránkách předmětu. Přednáška je věnuje popisu struktury, funkce a evoluce rostlinných genomů (jaderný, plastidový a mitochondriální), parazitickým genetickým elementům v rostlinách (transpozóny, viry a viroidy), rostlinné epigenetice (RNA interference, metylace DNA, modifikace histonů), metodám přímé a reverzní genetiky, transgenozi rostlin. V kurzu je kladen důraz především na pochopení mechanismů a souvislostí. Vedlejšími cíly výuky předmětu je naučit studenty klást si správné biologické otázky, kriticky číst a správně interpretovat data (vlastní i cizí) a přemýšlet o fungování organismů v evolučním kontextu.
Pro zájemce lze nad rámec znalostí požadovaných ke zkoušce zařadit přednášky o základních principech high-throughput metod pro analýzy toku informací v organismech (genomika, transkriptomika, proteomika).
Literature -
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=201
Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P.: Molecular Biology of the Cell. Darnell, J., Lodish, H., Baltimore, D.: Molecular Cell Biology, 2d ed.. Scientific American Books, Inc. Buchanan, B.B., Gruissem, W., Jones, R.L.: Biochemistry and Molecular Biology of Plants. American Society of Plant Physiologists.
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=201
Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P.:Základy buněčné biologie, Úvod do molekulární biologie buňky. Espero publishing, Ústí n./L. Darnell, J., Lodish, H., Baltimore, D.: Molecular Cell Biology, 2d ed.. Scientific American Books, Inc. Buchanan, B.B., Gruissem, W., Jones, R.L.: Biochemistry and Molecular Biology of Plants. American Society of Plant Physiologists.
Requirements to the exam - Czech
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
Zkouška probíhá ústní formou, pro splnění je potřeba především prokázat pochopení souvislostí a mechanismů probíraných procesů.
Syllabus -
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
The plant nuclear genome - structure and function
Regulation of expression - epigenetics, RNA interference
Genome of plastids and mitochondria
Transposons, viruses and viroids
Transgenesis and reverse genetics
Direct genetics and genetic mapping
Last update: RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D. (06.10.2023)
