SubjectsSubjects(version: 945)
Course, academic year 2023/2024
   Login via CAS
Modelling and simulation of physiological processes - MB130P41
Title: Modelování a simulace fyziologických procesů
Czech title: Modelování a simulace fyziologických procesů
Guaranteed by: Department of Experimental Plant Biology (31-130)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2023
Semester: summer
E-Credits: 3
Examination process: summer s.:oral
Hours per week, examination: summer s.:2/0, Ex [HT]
Capacity: unlimited
Min. number of students: 5
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Note: enabled for web enrollment
Guarantor: Ing. Klára Hoyerová, Ph.D.
Teacher(s): Ing. Klára Hoyerová, Ph.D.
Annotation - Czech
Last update: RNDr. Hana Konrádová, Ph.D. (29.04.2022)
Matematické modelování se stává stále více využívaným nástrojem pro interpretaci, kombinaci nebo náhradu
komplexních dat a experimentálních přístupů v biologii. V předmětu Modelováni a simulace fyziologických
procesů se studenti naučí orientovat v základních principech matematického modelování – pochopí, co je model,
jeho platnost, popis, stavové veličiny, parametry a jejich identifikace a jak se liší modely spojitých prostředí od
modelů operujících pouze v časové rovině. Dále získají obecnou (!) představu o využívaném matematickém
aparátu, například jak funguje metoda nejmenších čtverců nebo co jsou diferenciální rovnice, jak chápat jejich
význam a jakými způsoby se v praxi řeší. Tyto základní principy si studenti vyzkouší na příkladech konkrétních
jednoduchých modelů (difuze, růst buněčné kultury) implementovaných v běžně dostupném tabulkovém
procesoru (MS Excel, Calc atp.). Posluchači se také dozví o možnostech pokročilých výpočetních nástrojů Matlab a
Simulink spolu s možností reprezentace modelu blokovými schématy. Další modul studentům představí
pokročilejší zavedené biologické modely (vícedruhové populace, epidemiologické modely, obecný
multikompartmentový transportní model) jako příklady typických přístupů k tvorbě modelu. Závěr teoretické části
kurzu bude patřit příkladům užití matematických modelů v současném biologickém výzkumu. Kurz pak bude
uzavřen praktickou ukázkou, která studentům umožní vyzkoušet si realistickou práci s jednoduchým
matematickým modelem využitelným v praxi.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html