Last update: Mgr. Michal Štefánek (02.05.2022)
Please note that the course is taught in the Czech language only.
Introduction to multivariate techniques in ecology, namely using the CANOCO package. Principles of multivariate techniques, linear and unimodal techniques. Indirect ordination and canonical (direct) techniques. Testing of relationships by randomisation techniques. Uses of multivariate techniques in lieu of univariate techniques: types of problems.
Last update: Mgr. Michal Štefánek (02.05.2022)
Navazuje na přednášku Biostatistika a plánování ekologických pokusů a věnuje se tématům mnohorozměrné
statistiky, s důrazem na zpracování ekologických dat. Přednáška předpokládá znalost základů jednorozměrné
statistiky, zejména práce s lineárními modely.
Přednáška poběží turnusově. Ve školním roce 21/22 se bude konat ve dnech 17./18. ledna a 31. ledna/1. února, vždy od 9 hodin ráno. Dopoledne budou přednášky a odpoledne praktika. Počítáme s přestávkou na oběd (tak hodinu) a odpoledním blokem praktik tak ca. do 4 hodin.
Na odpoledni praktickou cast je nezbytne, abyste meli nainstalovane R-ko (stahnout z www.r-project.org). Po instalaci R-ka si nainstalujte balicek vegan takto: Otevrit R -> Packages -> Install.packages, v objevivsim se menu vybrat server, z nejz chcete stahovat (neco blizko, typu Nemecko nebo Rakousko), a v dalsim menu vybrat vegan.
Stručný syllabus kursu:
***********************
Úvod: typy problémů, typická datová struktura
Princip mnohorozměrných technik na příkladu analýzy hlavních komponent (PCA)
Předpoklady PCA, Standardisace dat používané v PCA
Metody pro data s nelineární strukturou: metody využívající vážených průměrů (korespondenční analýza)
Nepřímé a přímé gradientové techniky: v kterém okamžiku použít nezávislou informaci o prostředí
Kanonické techniky: RDA a CCA
Princip Monte Carlo testů
Analýza s kovariátami: jak odstranit vlivy nezávislých proměnných (typicky proměnných prostředí), které nejsou
předmětem studia
Korelativní a manipulativní data v mnohorozměrné situaci
Použití kanonických mnohorozměrných technik pro vyhodnocení dat z manipulativních pokusů (analogie ANOVA)
Speciální případy v randomisačních testech (blokové uspořádání pokusu, "split-plot design", opakovaná měření a
další)
Ordinační techniky postavené na matici vzdáleností: mnohorozměrné škálování
Základní klasifikační techniky
