Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Subject Selected chapters in Microbiology is integral part of biological disciplines that provides knowledge about biology, morphology, metabolism, genetics and pathogenicity of microorganisms. Emphasis is put on essential aspects of relationships among microorganism, host and environment as well as influencing of this relationship by antimicrobial compounds. This knowledge is alongside extended with structure-activity relationship aspect. The aim of this subject is to widen students´ basic knowledge gained during pregradual study and to complement them with knowledge required for postgradual study.
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Předmět Vybrané kapitoly z mikrobiologie je nedílnou součástí biologických disciplín, poskytující poznatky o biologii, morfologii, metabolismu, genetice a patogenitě mikroorganismů. Důraz je kladen na podstatné aspekty vztahu mikroorganismus - hostitel - prostředí a ovlivnění tohoto vztahu antimikrobními látkami. Zároveň je tento soubor rozšířen i o vztah struktura sloučenin vs. biologická aktivita. Cílem předmětu je rozšířit základní znalosti studentů získané v průběhu pregraduálního studia a doplnit o poznatky potřebné pro doktorské studium.
Course completion requirements -
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Successfully passed oral exam
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Úspěšné složení ústní zkoušky
Literature -
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Obligatory:
. . In Goering, Richard V. Zuckerman, Mark A. Dockrell, Hazel M. Chiodini, Peter L.. Medical microbiology and immunology . Edinburgh: Elsevier, 2019, s. -. ISBN 978-0-7020-7154-6..
. . In Hanlon, Geoffrey Hodges, Norman. Essential microbiology for pharmacy and pharmaceutical students . Chichester, West Sussex, UK: John Wiley & Sons, 2013, s. -. ISBN 978-0-470-66534-3..
. . In Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S. Pfaller, Michael A.. Medical microbiology . : , 2021, s. -. ISBN 978-0-323-67450-8..
Recommended:
. . In Schwalbe, Richard Steele-Moore, Lynn Goodwin, Avery C. (eds.). Antimicrobial susceptibility testing protocols . : , 2007, s. -. ISBN ..
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Povinná:
. . In Murray, Patrick R., Rosenthal, Ken S. Pfaller, Michael A.. Medical microbiology . : , 2021, s. -. ISBN 978-0-323-67450-8..
. . In Goering, Richard V. Zuckerman, Mark A. Dockrell, Hazel M. Chiodini, Peter L.. Medical microbiology and immunology . Edinburgh: Elsevier, 2019, s. -. ISBN 978-0-7020-7154-6..
. . In Hanlon, Geoffrey Hodges, Norman. Essential microbiology for pharmacy and pharmaceutical students . Chichester, West Sussex, UK: John Wiley & Sons, 2013, s. -. ISBN 978-0-470-66534-3..
Doporučená:
. . In Schwalbe, Richard Steele-Moore, Lynn Goodwin, Avery C. (eds.). Antimicrobial susceptibility testing protocols . : , 2007, s. -. ISBN ..
Syllabus -
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Introduction to microbiology. Human and microbes.
Host versus pathogen.
General bacteriology, genetics of bacteria.
Medically important cocci.
Other medically important bacterial genera.
Mycobacteria and other filamenous bacteria.
General virology – structure and replication of viruses. Classification of viruses.
Mycotic infections.
Parasitic protozoans nad helmints.
Review of antimicrobial compounds.
Resistance to antibiotics.
Disinfection, preservation and sterilization in pharmacy.
Pharmaceutical microbiology.
Practical organization in microbiological laboratory – safety in microbiological laboratory.
Disinfection, sterilisation – disinfection of hands, equipment of microbiological laboratory, biosafety levels in laboratory, types of biological samples for microbiological examinations, specimen collection, transport of clinical specimen, request form, microbiology of environment – smear from subject surfaces, …
Microscopy – native and stained mounts (principles, pros and cons, usage).
Cultivation – types, conditions, types of cultivation media and their usage.
Laboratory screening of susceptibility to antimicrobial agents – disc diffusion test, E-test, determination of MIC.
Last update: PharmDr. Ondřej Janďourek, Ph.D. (18.09.2023)
Úvod do mikrobiologie. Člověk a mikroby.
Hostitel versus patogen.
Bakterie – obecná charakteristika. Bakteriální genetika.
Lékařsky významné koky.
Další lékařsky významné bakteriální rody (Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, ...).
Mykobakterie a další vláknité bakterie.
Obecná virologie - struktura a množení virů. Klasifikace virů.
Mykotické infekce.
Parazitičtí prvoci a helminti.
Přehled antimikrobních látek.
Rezistence k antibiotikům.
Dezinfekce, konzervace a sterilizace ve farmacii.
Farmaceutická mikrobiologie.
Organizace práce v mikrobiologické laboratoři – bezpečnost práce v laboratoři.
Dezinfekce, sterilizace – hygienické mytí rukou, vybavení mikrobiologické a farmaceutické laboratoře, typy BSL, typy biologického materiálu, odběry, transport, žádanka, mikrobiologie čistoty prostředí - stěr z povrchu předmětů, spad.
Mikroskopie – nativní a barvený preparát (principy, výhody, nevýhody, použití).
Kultivace – druhy, podmínky, typy kultivačních půd a jejich použití.
Laboratorní testování citlivosti k ATB – diskový test, E-test, MIC.
