Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology - CPGS006

• Title: Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology
• Guaranteed by: Department of Pathophysiology 3FM CU (12-UFYP)
• Faculty: Third Faculty of Medicine
• Actual: from 2023
• Semester: winter
• Points: 0
• E-Credits: 0
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:0/30, other [HS]
• Capacity: unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Note: course is intended for doctoral students only
• Guarantor: RNDr. Jan Pala, Ph.D.

Annotation

Last update: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky. Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM, CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji. Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i konfokálním režimu

Course completion requirements

Last update: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

účast alespoň 50 % a test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury

Syllabus

Last update: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

1 Introduction to optical microscopy and historical overview

2 Microscopic methods in bright field

3 Fluorescence microscopy

4 Spinning disc

5 Confocal laser scanning microscopy

6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet

7 FRAP, FRET, FLIM and FCS

8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS

9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan

10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD

11 Nanoscopy 2 - STED

12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5

13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5

Course completion requirements

Last update: Bc. Kateřina Maternová (25.01.2019)

účast alespoň 50 % a test s využitím přednášek a doporučené studijní literatury