Subjects

Your browser does not support JavaScript, or its support is disabled. Some features may not be available.

Basic and advanced methods of optical microscopy in medicine and biology - CCOCA0098

Title:	Základní a pokročilé metody optické mikroskopie v medicíně a biologii
Guaranteed by:	Department of Pathophysiology 3FM CU (12-UFYP)
Faculty:	Third Faculty of Medicine
Actual:	from 2023
Semester:	winter
Points:	2
E-Credits:	2
Examination process:	winter s.:
Hours per week, examination:	winter s.:0/30, C [HS]
Capacity:	unknown / unknown (20)
Min. number of students:	4
4EU+:	no
Virtual mobility / capacity:	no
Key competences:
State of the course:	not taught
Language:	English, Czech
Teaching methods:	full-time
Teaching methods:	full-time
Level:
Note:	course can be enrolled in outside the study plan enabled for web enrollment

Guarantor:	RNDr. Jan Pala, Ph.D.
Comes under:	AVSEOB-PVK-3 (ZÁPIS) VSEOB-PVK-3 (ZÁPIS)
Pre-requisite :	CVSE1M0001

Examination dates Schedule

Annotation - Czech

Last update: Bc. Kateřina Maternová (15.09.2017)

Kurz navazuje na část předmětu CCOCA0091 Advanced methods in microscopy (Základy mikroskopických metod a digitální zobrazování) a zaměřuje se na metody optické mikroskopie, které se v současné době používají v medicíně a biologii. Obsahem kurzu jsou metody widefield fluorescence, spektrálně a časově rozlišené konfokální mikroskopie, deep tissue imaging, subdifrakční zobrazování a nanoskopie pro fixované i živé vzorky. Z pokročilých metod budou probrány ligh-sheet, FRAP, FRET, SHG, THG, FLIM, FCS, 4Pi, GSD, STED, PALM, SIM, CARS a mnoho dalších v závislosti na aktuálním pokroku ve výzkumu a vývoji. Součástí kurzu bude i praxe na konfokalním laserovém skenovacím mikroskopu Leica TCS SP5 ve wide-field i konfokálním režimu

Course completion requirements -

Last update: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)

Credit test using lectures, practical work on a microscope and output in the form of images with the descriptions ready for publication.

Syllabus -

Last update: Bc. Kateřina Maternová (15.09.2017)

1 Introduction to optical microscopy and historical overview
2 Microscopic methods in bright field
3 Fluorescence microscopy
4 Spinning disc
5 Confocal laser scanning microscopy
6 Live Cells Imaging in widefield, confocal and light sheet
7 FRAP, FRET, FLIM and FCS
8 Nonlinear microscopy - 2P, SHG, CARS
9 Subdiffraction imaging methods - SIM, AiryScan
10 Nanoscopy 1 - STORM, PALM, GSD
11 Nanoscopy 2 - STED
12 Practical part - WF imaging with Leica TCS SP5
13 Practical part - confocal imaging with Leica TCS SP5

Course completion requirements -

Last update: RNDr. Jan Pala, Ph.D. (26.09.2022)

Credit test using lectures, practical work on a microscope and output in the form of images with the descriptions ready for publication.