Subjects

Your browser does not support JavaScript, or its support is disabled. Some features may not be available.

Detection of an infectious agent in biological materials using molecular-genetic analysis - CCOC5942

Title:	Průkaz infekčního původce ve vyšetřovaném biologickém materiálu pomocí molekulárně-genetických analýz
Guaranteed by:	Department of Microbiology 3 FM CU, FHKV and NIPH (12-MIK)
Faculty:	Third Faculty of Medicine
Actual:	from 2017
Semester:	both
Points:	1
E-Credits:	1
Examination process:
Hours per week, examination:	0/15, C [HS]
Extent per academic year:	15 [hours]
Capacity:	winter:unknown / unknown (6) summer:unknown / unknown (6)
Min. number of students:	unlimited
4EU+:	no
Virtual mobility / capacity:	no
Key competences:
State of the course:	not taught
Language:	Czech
Teaching methods:	full-time
Teaching methods:	full-time
Level:
Note:	you can enroll for the course in winter and in summer semester

Guarantor:	doc. MUDr. Marek Bednář, CSc.

Examination dates Schedule

Annotation -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC

Aim of the course -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC

Literature -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC

Teaching methods -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC

Last update: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc. (14.07.2011)

Ústav lékařské mikrobiologie.

Povinně volitelný kurz.

Název kurzu:
Průkaz infekčního původce ve vyšetřovaném biologickém materiálu pomocí molekulárně genetických analýz

Číslo kurzu: 5942, 6942

PVK proběhne v lékařské diagnostické laboratoři afilovaného pracoviště 3. lékařské fakulty UK Vidia Diagnostika pod dohledem pana RNDr Jaroslava Kőniga. Kurz proběhne ve dvou dnech (některý víkend).
Dostupnost: konečná stanice metra B-Černý Most. Pěšky, asi 200m zpět po tubusu metra, výstup prvním schodištěm. Autobusové linky: 141, 386, stanice Poliklinika Cerný Most. Vchod do poliliniky z druhé strany budovy, v sobotu a neděli po ohlášení ve vrátnici, event. na tel č.:605318720, 737852023, vrátnice:728190346. Nutný vlastní pracovní plášť (dodá Ústav lékařské mikrobiologie).

Před vlastním kurzem si studenti osvojí příslušnou část výukového CD (... průkaz přímý>průkaz genetický).

Během kurzu budou studenti po krátkém teoretickém úvodu prakticky seznámeni s metodami:
1) extrakce a purifikace nukleových kyselin z výchozího materiálu (sérum, plasma, moč, stěry) pomocí separačních kolonek nebo paramagneticých částic.
2) reverzní transkripce pro přípravu copy DNA a následnou amplifikaci DNA metodou PCR (endpoint PCR)
3) real time PCR s přímou vizuální detekcí amplifik. produktu změnou hladiny fluorescence, včetně možnosti následného stanovení genotypu z hodnoty MP po kontinuální tep.denaturaci
4) klasické elektroforetické detekce PCR produktu v agarosovém gelu
5) přímé sekvenační analýzy genomu pro určení genotypu pomocí sekvenačního analyzátoru

V druhé části kurzu proběhne závěrečné vyhodnocení a interpretace výsledků.

Během kurzu budou studentům odprezentovány teoretické aspekty prováděných analýz.

Z přístrojů budou použity: Mastercycler (Eppendorf), real time analyzátor Light Cyler 2 (Roche), jedno-kapilárový sekvenátor ABI 310.

Bezpečnost práce s infekčním materiálem bude zajištěna použitím boxů biohazard, pracovním oděvem (plášě dodá Ústav lékařské mikrobiologie) a pracovními rukavicemi (dodáme).

Requirements to the exam -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC

Syllabus -

Last update: Mgr. Alena Vlasáková, DiS. (24.11.2008)

COC