SubjectsSubjects(version: 945)
Course, academic year 2023/2024
   Login via CAS
Medical Informatics - B00364 (Všeobecné lékařství)
Title: Zdravotnická informatika
Guaranteed by: Institute of Biophysics and Informatics First Faculty of Medicine Charles University (11-00170)
Faculty: First Faculty of Medicine
Actual: from 2021
Semester: summer
Points: 2
E-Credits: 2
Examination process: summer s.:
Hours per week, examination: summer s.:1/1, MC [HT]
Extent per academic year: 30 [hours]
Capacity: unlimited
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Teaching methods: full-time
Explanation: cestmir.stuka@lf1.cuni.cz
Additional information: http://ubi.lf1.cuni.cz
Old code: 364
Guarantor: RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D.
Comes under: Povinné LEK20 2.r._23/24
Attributes: Lékařství
Teoretický předmět
Annotation - Czech
Last update: Jana Kolářová (10.02.2020)
Medicína stále více využívá moderní technologie a při rozhodování o léčbě vychází důsledně z medicíny založené na důkazech. Proto patří orientace v těchto oblastech k nezbytným součástem vzdělání budoucího lékaře.
Syllabus - Czech
Last update: Jana Kolářová (30.08.2023)
Předmětem výuky je:

medicína založená na důkazech, základy biomedicínské statistiky, práce se zdroji medicínských informací, informační systémy v medicíně, elektronická zdravotnická dokumentace, zpracování obrazu, využití 3D technologií a strojového učení, počítačová bezpečnost a ochrana osobních údajů.

Z praktických dovedností budou cvičeny:

Principy a postup vyhledávání důkazů pro EBM, aplikace biomedicínské statistiky na klinické problémy, práce s hesly a počítačovou bezpečností, práce s osobními údaji a profesionalismus nejen na sociálních sítích, ukázka postupů při tvorbě umělé inteligence, základy zpracování obrazu, prezentační dovednosti.

Teoretická témata:

Počítačová bezpečnost a informační systémy ve zdravotnictví

Zdravotnický profesionalizmus a ochrana osobních údajů

Medicína založená na důkazech

Biomedicínská statistika

Zpracování obrazu a 3D technologie

Umělá inteligence ve zdravotnictví

Literature - Czech
Last update: RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. (18.02.2017)

Centre for Evidence-Based Medicine Toronto. In: KT Clearinghouse [online]. [2017] [cit. 2017-02-17]. Dostupné z: http://ktclearinghouse.ca/cebm/intro

Markéta Pavlíková: Co je EBM a proč je potřeba Dostupné z: http://www.biostatisticka.cz/wp-content/prilohy/EBM-LF1.pdf

Jana Zvárová: Biomedicínská statistika I. Základy statistiky pro biomedicínské obory. Karolinum, 2016. http://www.cupress.cuni.cz/ink2_stat/index.jsp?include=podrobnosti&id=16979

Karel Zvára: Biomedicínská statistika IV. Základy statistiky v prostředí R. Karolinum, 2013. http://www.cupress.cuni.cz/ink2_ext/index.jsp?include=podrobnosti&id=230791

Špunda, M., Dušek, J. a kol.: Zdravotnická informatika, Karolinum 2007, Praha

Kasal, P., Svačina, Š. a kol.: Lékařská informatika, Karolinum 1998, Praha

Shortliffe, E.H., Cimino, J.J.: Biomedical Informatics, Third Edition, Springer 2006, New York, USA

Entry requirements - Czech
Last update: RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. (20.05.2021)

Vstupním předpokladem jsou základní znalosti informatiky na středoškolské úrovni.
Minimální předpokládaný rozsah vstupních znalostí:  Práce s kancelářskými programy, pojmy: hardware, software, operační systém, adresář, soubor, jméno a přípona souboru, algoritmus, program, počítačová síť, internet, služby (e-mail, WWW apod.), emailová adresa, URL, virus, hoax.

----------------------------------------------------------------------------------

Rozsáhlejší absenci vstupních znalostí si lze doplnit absolvováním nepovinného volitelného předmětu (v zimním semestru) jehož náplní jsou základní předpokládané vstupní znalosti pro povinný předmět "Zdravotnická informatika" (v letním semestru). "Úvod do zdravotnické informatiky (B02123)"

Course completion requirements - Czech
Last update: Mgr. Jan Zeman, Ph.D. (18.02.2022)

Informace k organizaci a průběhu klasifikovaného zápočtu 

 

Pro hodnocení výkonu studenta a získání klasifikovaného zápočtu se bere v potaz vypracování všech průběžně zadávaných příkladů a závěrečné přezkoušení.

Při závěrečném přezkoušení student absolvuje test - teoretické otázky ze základních pojmů zdravotnické informatiky. 

Education plan -
 
Schedule scheduled
Schedule ticket Date From - To Education type Theme Teacher Files NoteHodnocení
23bB00364p1

Groups of students
1.LEK-b
Thu 29.02.2024 13:30 - 15:00 lecture Medicína založená na důkazech (Štuka) RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. EBM definice, význam EBM, principy EBM, hierarchie vědeckého důkazu, kazuistiky, průřezová studie, studie případů a kontrol, kohortové studie, randomizované studie, metaanalýzy, korelace vs. kauzalita, zdroje zkreslení EBM studií, typy zkreslení, konfirmační zkreslení, chyby metaanalýz, postup hledání důkazů pro EBM, PICO, zdroje důkazů pro EBM
Thu 14.03.2024 13:30 - 15:00 lecture Ochrana osobních údajů a lékařský profesionalizmus v době sociálních sítí. (Štuka) RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. GDPR, osobní údaje, organizační údaje, citlivé údaje, podmínky zpracování citlivých údajů, Úřad pro ochranu osobních údajů, lékařský profesionalismus, sociální sítě z pohledu lékařského profesionalismu a bezpečnosti, agregace dat, manipulace na sociálních sítích, digitální stopa.
Thu 28.03.2024 13:30 - 15:00 lecture Základy biomedicínské statistiky pro EBM 1 (Štěpánek) MUDr. Ing. Lubomír Štěpánek, Ph.D. Princip testování hypotéz, hladina významnosti, interval spolehlivosti, pravděpodobnost, poměr šancí (odds ratio, OR), relativní riziko (relative risk, RR) a další míry asociace, čtyřpolní tabulka, pravděpodobnost v klinické praxi, Bayesova věta, věrohodnostní poměr, diagnostické testy, senzitivita testu, specificita testu, falešná pozitivita a negativita testu, statistické principy screeningu, screeningové síto.
Thu 11.04.2024 13:30 - 15:00 lecture Základy biomedicínské statistiky pro EBM 2 (Štěpánek) MUDr. Ing. Lubomír Štěpánek, Ph.D. Vybrané testy hypotéz pro některé typické situace a otázky lékařského výzkumu (t-testy, chí-kvadrát testy), chyba prvního a druhého typu, vhodná vizualizace pro vybrané problémy a jak interpretovat typické diagramy v lékařském výzkumu, Simpsonův paradox (a jeho aplikace na efekt očkování proti covid-19), Odysseův syndrom (problém zvýšené falešné pozitivity při mnohočetném testování), statistika pro podporu lékařova rozhodování, volba diagnostického testu, threshold metoda, Suttonův zákon.
Thu 25.04.2024 13:30 - 15:00 lecture Umělá inteligence a její využití ve zdravotnictví (Zeman, Štuka) Mgr. Jan Zeman, Ph.D. Strojové učení, neuronové sítě, hluboké učení, velké jazykové modely, meze a potenciál AI, odlišení AI od lidského vědomí, využití AI v medicíně.
Thu 09.05.2024 13:30 - 15:00 lecture Zpracování medicínského obrazu (Dušek) Ing. Jaroslav Dušek, Ph.D. Přehled a principy zobrazovacích metod, invazivní vs. neinvazivní, radiační zátěže běžných vyšetření, digitalizace obrazu, vzorkování, kvantování, diskretizace a lidský zrak, obrazové formáty, ztrátové vs. bezztrátové, obrazová komprese, velikost souborů, zpracování obrazu, jas, kontrast, histogram, změny parametrů obrazu, odčítání obrazů​ - digitální subtrakční angiografie​, pokročilé úpravy obrazu, spektrální analýza, segmentace, prahování, výpočetní tomografie, registrace, ultrazvuk, doppler, PACS, DICOM.
Thu 23.05.2024 13:30 - 15:00 lecture Bezpečnost dat a zdravotnické informační systémy (Kajzar) MUDr. Petr Kajzar Ochrana informací, důvěrnost dat, integrita dat, dostupnost dat, přístup k datům, identifikace, autentizace, autorizace, digitální certifikát, kvalifikovaný certifikát, komerční certifikát, elektronický podpis (prostý, zaručený, kvalifikovaný), časové razítko, cíle útoků ve zdravotnictví, znaky a obrana proti phishingu, viru, spyware, ransomware, DDoS, spamu, hoaxu, práce s hesly, soukromí na internetu, ochrana zařízení a dat.
23bB00364p2

Groups of students
1.LEK-a
Wed 21.02.2024 10:45 - 12:15 lecture Medicína založená na důkazech (Štuka) RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. EBM definice, význam EBM, principy EBM, hierarchie vědeckého důkazu, kazuistiky, průřezová studie, studie případů a kontrol, kohortové studie, randomizované studie, metaanalýzy, korelace vs. kauzalita, zdroje zkreslení EBM studií, typy zkreslení, konfirmační zkreslení, chyby metaanalýz, postup hledání důkazů pro EBM, PICO, zdroje důkazů pro EBM
Wed 06.03.2024 10:45 - 12:15 lecture Ochrana osobních údajů a lékařský profesionalizmus v době sociálních sítí. (Štuka) RNDr. Čestmír Štuka, MBA, Ph.D. GDPR, osobní údaje, organizační údaje, citlivé údaje, podmínky zpracování citlivých údajů, Úřad pro ochranu osobních údajů, lékařský profesionalismus, sociální sítě z pohledu lékařského profesionalismu a bezpečnosti, agregace dat, manipulace na sociálních sítích, digitální stopa.
Wed 20.03.2024 10:45 - 12:15 lecture Základy biomedicínské statistiky pro EBM 1 (Štěpánek) MUDr. Ing. Lubomír Štěpánek, Ph.D. Princip testování hypotéz, hladina významnosti, interval spolehlivosti, pravděpodobnost, poměr šancí (odds ratio, OR), relativní riziko (relative risk, RR) a další míry asociace, čtyřpolní tabulka, pravděpodobnost v klinické praxi, Bayesova věta, věrohodnostní poměr, diagnostické testy, senzitivita testu, specificita testu, falešná pozitivita a negativita testu, statistické principy screeningu, screeningové síto.
Wed 03.04.2024 10:45 - 12:15 lecture Základy biomedicínské statistiky pro EBM 2 (Štěpánek) MUDr. Ing. Lubomír Štěpánek, Ph.D. Vybrané testy hypotéz pro některé typické situace a otázky lékařského výzkumu (t-testy, chí-kvadrát testy), chyba prvního a druhého typu, vhodná vizualizace pro vybrané problémy a jak interpretovat typické diagramy v lékařském výzkumu, Simpsonův paradox (a jeho aplikace na efekt očkování proti covid-19), Odysseův syndrom (problém zvýšené falešné pozitivity při mnohočetném testování), statistika pro podporu lékařova rozhodování, volba diagnostického testu, threshold metoda, Suttonův zákon.
Wed 17.04.2024 10:45 - 12:15 lecture Umělá inteligence a její využití ve zdravotnictví (Zeman, Štuka) Mgr. Jan Zeman, Ph.D. Strojové učení, neuronové sítě, velké jazykové modely, odlišení AI od lidského vědomí, využití AI v medicíně.
Wed 01.05.2024 10:45 - 12:15 lecture Zpracování medicínského obrazu (Smutek) doc. MUDr. Ing. Daniel Smutek, Ph.D. Přehled a principy zobrazovacích metod, invazivní vs. neinvazivní, radiační zátěže běžných vyšetření, digitalizace obrazu, vzorkování, kvantování, diskretizace a lidský zrak, obrazové formáty, ztrátové vs. bezztrátové, obrazová komprese, velikost souborů, zpracování obrazu, jas, kontrast, histogram, změny parametrů obrazu, odčítání obrazů​ - digitální subtrakční angiografie​, pokročilé úpravy obrazu, spektrální analýza, segmentace, prahování, výpočetní tomografie, registrace, ultrazvuk, doppler, PACS, DICOM.
Wed 15.05.2024 10:45 - 12:15 lecture Bezpečnost dat a zdravotnické informační systémy (Kajzar) MUDr. Petr Kajzar Ochrana informací, důvěrnost dat, integrita dat, dostupnost dat, přístup k datům, identifikace, autentizace, autorizace, digitální certifikát, kvalifikovaný certifikát, komerční certifikát, elektronický podpis (prostý, zaručený, kvalifikovaný), časové razítko, cíle útoků ve zdravotnictví, znaky a obrana proti phishingu, viru, spyware, ransomware, DDoS, spamu, hoaxu, práce s hesly, soukromí na internetu, ochrana zařízení a dat.
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html