The lecture is a mixture of Biochemistry, Molecular Biology, Structural Biology and Computer Science for obtaining, storing, organizing, and analyzing biological and genetic and structural information for understanding its activity in living organisms. Main goal is to convert multitude of complex data into useful information and knowledge. Data includes gene and protein sequences, cDNA, nucleotide sequences, protein and DNA structures. Data are obtained from gene sequencing, combinatorial chemical synthesis, gene-expression investigations, pharmicogenomics, proteomic studies, x-ray crystallography and other methods of study. These Information are used to build synthetic and predictive models allowing scientists to better understand complex living systems. Future applications in biology, chemistry, pharmaceuticals, medicine, and agriculture
Lectures - in Czech -
Last update: Liberda Jiří, RNDr., Ph.D. (16.12.2009)
Přednáška Bioinformatika je kombinací biochemie, molekulární biologie, strukturální biologie a výpočetních metod aplikovaných v počítačovém zpracování dat. Tyto discipliny slouží k získání, uchování, organizaci a analýze biologických, genetických a strukturálních informací a následnému pochopení významu a úlohy studovaného systému v živých organismech. Hlavním cílem je transformace komplexních dat do takového schematu který umožňuje studovat systém v jeho komplexnosti. Data která jsou bioinformatikou uchovávána a využívána zahrnují genové a proteinové sekvence, cDNA, nukleotidové sekvence a strukturu jak proteinů tak DNA. Data jsou získávána experimentálními technikami jakými jsou např. Sekvenace, kombinatoriální chemická syntéza, exprese genů, farmakologické a proteomické studie, roentgenová krystalografie a ostatní metody. Využitím těchto dat je možné vybudovat syntetické a prediktivní modely dovolující lépe pochopit živým systémům jako celku. Bioinformatika je hojně využívána v biologii, chemii, farmacii, medicině a zemědělství.
Last update: SIMONAT (25.04.2002)
Literature - Czech
Materiály ke zkoušce, aktualizované dle nejnovějšího stavu informací.
Last update: Hudeček Jiří, prof. RNDr., CSc. (15.05.2012)
Requirements to the exam
biological, sequential and structural databases
methods for comparison of sequences
pairwise and multiple alignments
phylogenetic trees ad their constructions
classification of protein structures
methods of secondary structure predictions for RNA and proteins
