Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)
This lecture provides an introduction to computational neuroscience.
Students will be introduced to the necessary biological background and then
we will study how to model such biological substrate, primarily from an
information processing perspective. We will study biological neural
networks at the level of the synapse, the neuron, and entire neuronal
circuits. One of the aims is also to teach students to navigate the
neuroscience literature, and to introduce them to the range of possible
applications of computational disciplines in this dynamically developing
field. The exercise sess
Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)
Přednáška podává úvod do výpočetních neurověd. Studentům představíme
potřebné biologické základy a pak se budeme věnovat tomu, jak tento
biologický substrát modelovat, především
z pohledu zpracování informace. Budeme studovat biologické neuronové sítě
na úrovni synapse, neuronu, i celých neuronálních okruhů. Dílčím cílem je
naučit studenty orientovat
se v odborné literatuře z oblasti neurověd, a představit jim škálu možného
uplatnění výpočetních disciplin v této dynamicky se rozvíjející oblasti.
Cvičení se týká zejména výpočetního modelování neurálních systémů pomocí
nejmodernějších
Course completion requirements -
Last update: Mgr. Ján Antolík, Ph.D. (27.06.2023)
1) A computational modelling task
2) Written test
Last update: Mgr. Ján Antolík, Ph.D. (27.06.2023)
1/ Úloha z výpočetního modelování, včetně sepsání reportu
2/ Písemný test
Literature -
Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)
Neuroscience: Exploring the Brain (Hardcover)
by Mark F Bear (Author), Barry Connors (Author), Michael Paradiso (Author); Lippincott Williams & Wilkins
Mechanisms of Memory: J. David Sweatt; Elsevier
Fundamentals of Computational Neuroscience by Thomas Trappenberg (Author); Oxford University Press
Theoretical Neuroscience: Computational and Mathematical Modeling of Neural Systems by Peter Dayan (Author), L. F. Abbott (Author); The MIT Press
Sternberg, R. J.: Kognitivní psychologie; Portál
Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)
Literatura:
Neuroscience: Exploring the Brain (Hardcover)
by Mark F Bear (Author), Barry Connors (Author), Michael Paradiso (Author); Lippincott Williams & Wilkins
Mechanisms of Memory: J. David Sweatt; Elsevier
Fundamentals of Computational Neuroscience by Thomas Trappenberg (Author); Oxford University Press
Theoretical Neuroscience: Computational and Mathematical Modeling of Neural Systems by Peter Dayan (Author), L. F. Abbott (Author); The MIT Press
Sternberg, R. J.: Kognitivní psychologie; Portál
Syllabus -
Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)
1) Living neuron: action potential, synapses, neurotransmiters, ion channels, spiking models (Hodgkin-Huxley model, leaky integrate & fire, Izhikevich), information coding by neurons
2) Neuroanatomy introduction
3) Visual system: anatomy, function and computational models
4) Architecture of neocortex, cortical columns
5) Motor cortex
Last update: RNDr. Tomáš Holan, Ph.D. (17.04.2024)