Biochemistry - PFYB033
Title: Biochemie
Guaranteed by: Department of Biomedical Foundation in Kinanthropology (51-300200)
Faculty: Faculty of Physical Education and Sport
Actual: from 2024
Semester: winter
Points: 0
E-Credits: 2
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:2/0, C [HT]
Extent per academic year: 28 [hours]
Capacity: 80 / unknown (unknown)
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Explanation: https://www.facebook.com/groups/739012476451349/about
Additional information: https://teams.microsoft.com/l/team/19%3a1653ade2b86440b0b2857585835e6f39%40thread.tacv2/conversations?groupId=2e1f8cb3-5c54-42a0-9052-6f126582b412&tenantId=e09276da-f934-4086-bf08-8816a20414a2
Note: deregister from the credit exam date if a requisite was not fulfilled
course can be enrolled in outside the study plan
enabled for web enrollment
priority enrollment if the course is part of the study plan
Guarantor: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D.
Teacher(s): doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D.
In complex pre-requisite: PBML021
Examination dates   WS schedule   Noticeboard   
Annotation -
The course focuses on basic biochemical topics covering the composition of living matter, main nutrients (sugar, fats, proteins), their metabolism (glycolysis, gluconeogenesis, beta-oxidation of fatty acids, lipogenesis, ornithine cycle, Krebs cycle and cellular respiration). In addition, attention is paid to proteosynthesis, the structure and function of nucleic acids, polarization/depolarization of the plasma membrane with regard to conduction of excitation, events on the neuromuscular plate and muscle contraction. Attention is also paid to biologically active substances such as vitamins, antioxidants and signaling molecules.
Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (27.10.2023)
Aim of the course - Czech

Cílem předmětu je především seznámit získat teoretické znalosti v oblasti základů biochemie:

Obecné principy biochemie: složení živé/neživé hmoty, regulace, enzymy, signální molekuly, hormon, vitamíny

Biochemie sacharidů: Rozdělení sacharidů; jejich odvozování pro aldózy a ketózy; typy zobrazování sacharidů (Fischerova projekce, Tollensova, Haworthova); významné zástupce monosacharidů, oligosacharidů, význam oligosacharidů pro buněčnou signalizaci a určení krevních skupin, významné zástupce polysacharidů jejich rozdělení; Biochemické přeměny sacharidů, fosforečné estery, degradace složitějších sacharidů na jednodušší, glykolýza =  vznik pyruvátu, aerobní a anaerobní přeměny pyruvátu, vznik AcetylCoA, Laktátový cyklus, Pentózový cyklus

Biochemie lipidů: Rozdělení lipidů, popsat obecnou strukturu triacylklicerolu, vysvětlit esterifikaci, význam a evoluci odvozených lipidů, způsob transportu lipidů v krvi; Obecně degradaci lipidů, odbourávání mastné kyseliny (beta-oxidaci), strukturu Koenzymu A, vznik acylCoAa, vznik acetylCoA,

Biochemie proteinu a aminokyselin: Rozdělení aminokyselin na esenciální/neesenciální, kódované/nekódované, obecnou strukturu aminokyselin, triviální názvy a charakter kódovaných aminokyselin, popsat průběh proteosyntézy; Způsoby detoxikace amoniaku, ornitinový cyklus, enzymy

Membránový potenciál a vznik vzruchu a nervosvalový systém: klidový membránový potenciál, akční potenciál, distribuce iontů, výpočet membránového  potenciálu, popis nervosvalového spojení (od nervu ke svalu, od impulzu ke kontrakci), charakteristika svalové tkáně, strukturu kosterního svalu, složení svalu, princip svalové kontrakce; zdroje energie pro svalovou práci

Metabolické přeměny: Krebsův cyklus a dýchací řetězec, makroergické látky

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (22.09.2023)
Course completion requirements - Czech

Požadavky na zápočet:
písemný test na 30 b, 15 min

Výstupy z biochemie:

znalosti:

složení živé hmoty

hlavní živiny - cukry, tuky, bílkoviny  - jejich rozdělení a charakteristika

metabolické přeměny hlavních živin (glykolýza, beta-oxidace, Krebsův cyklus, buněčné dýchání....)

proteosyntéza (princip, význam, posloupnost, začlenění v rámci buňky)

nukleové kyseliny (struktura, funkce, význam)

polarizace/depolarizace plasmatické membrány, přenos vzruchu, děje na nervosvalové ploténce a svalová kontrakce

biologicky aktivní látky (vitamíny, antioxidanty, signální molekuly)

Podmínky uznávání zpočtu:

Zápočet lze uznat pouze v případě, že

1)      datum jeho složení není starší než 3 roky,

3)      sylaby předmětů se neliší o více než 10%

4)      uchazeč předloží kompletní žádost o uznání zápočtu včetně studijním oddělením potvrzeným výpisem studijních povinností a pro uchazeče z jiných fakult též vyučujícím (u kterého byla zkouška/zápočet absolvována) potvrzeným sylabem předmětu včetně platného kontaktu na vyučujícího.

5)      kompletní žádost je doručena na sekretariát katedry Biomedicínského základu v kinantropologii k paní Kopřivové (E324, 3. patro) do 31.10 každého daného roku

Studenti se specifickými potřebami v učení (SPU):

V případě, že jste studentem/studentkou se specifickými studijními potřebami, které Vám znemožňují aktivní účast ve výuce, nebo objektivním způsobem znevýhodňují psaní závěrečného testu, tak je třeba tuto skutečnost doložit věrohodným dokumentem, např. vyjádřením pedagogicko-psychologické poradny a to nejpozději do 31.10 emailem obsahujícím všechny potřebné dokumenty dokládající vaši SPU. Na pozdější žádosti, či žádosti nepodložené lékařským/psychologickým posudkem nebude brán zřetel.

Příklad: V případě, že např. trpíte určitým stupněm dislexie a z toho důvodu potřebujete na psaní testu více času, což v případě digitálního společného testu není možné zajistit, tak si zkoušející vyhrazuje právo změnit formu testu např. na test v papírové formě.

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (27.10.2023)
Literature - Czech

BENDER, D. A., et al. Harper's Illustrated Biochemistry. McGraw-Hill Medical, 2012.
DAVIDSON, V.L., et al. Biochemistry. Baltimore, Md.: Lippincott, William, 1999.
KODÍČEK, M., VALENTOVÁ, O., HYNEK, R. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2018.
KOOLMAN, J., RÖHM, K.-H. Barevný atlas biochemie. Grada, 2012.
KLOUDA, P. Základy biochemie. Pavel Klouda, 2005.
JAKLOVÁ DYTRTOVÁ, J. , JAKL, M., ŠTEFFL, M. Základy biochemie. Praha: UK FTVS, 2023.

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (27.10.2023)
Requirements to the exam - Czech

Požadavky na zápočet:
písemný test (75%)

Výstupy z biochemie:

znalosti:

složení živé hmoty

hlavní živiny - cukry, tuky, bílkoviny  - jejich rozdělení a charakteristika

metabolické přeměny hlavních živin (glykolýza, beta-oxidace, Krebsův cyklus, buněčné dýchání....)

proteosyntéza (princip, význam, posloupnost, začlenění v rámci buňky)

nukleové kyseliny (struktura, funkce, význam)

polarizace/depolarizace plasmatické membrány, přenos vzruchu, děje na nervosvalové ploténce a svalová kontrakce

biologicky aktivní látky (vitamíny, antioxidanty, signální molekuly)

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (27.10.2023)
Syllabus -

Lectures:

1. Composition of living matter, microelements, macroelements

2. Sugars and macroergic substances

3. Lipids

4. Proteins, Amino acids

5. Nucleic acids

6. Metabolism of sugars

7. Fat metabolism

8. Protein metabolism, ammonia detoxification

9. Energy metabolism (Krebs cycle, cellular respiration)

10. Membrane potential, transport

11. Muscle contraction

12. Biologically active substances (vitamin, antioxidant, signal molecules)

13. Proteosynthesis

14. Biochemical reactions, Enzymes

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (27.10.2023)
Learning resources - Czech

Přednášky probíhají prezenčně.

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=11112

Klíč je: Bioch23!
Pro rychlou komunikace a další materiály je FB:
https://www.facebook.com/groups/739012476451349

Videa z přednášek jsou na: @janadytrtova2289

Last update: Jaklová Dytrtová Jana, doc. RNDr. PhDr. Ing., Ph.D. (31.10.2023)