Chemical Informatics - MC270P10M

• Title: Chemická informatika
• Guaranteed by: Department of Organic Chemistry (31-270)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2023
• Semester: summer
• E-Credits: 2
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:1/1, C [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: cancelled
• Language: Czech
• Explanation: kurz má stejný obsah jako MC270P10
• Additional information: http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=1413
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: doc. RNDr. Jindřich Jindřich, CSc.
• Incompatibility : MC270P10
• Interchangeability : MC270P10

Annotation

English

Communication in chemistry: molecular visualization tools and Internet sites; chemistry newsgroups and discussion lists; science writing aids (software); the publication process - primary, secondary, and tertiary sources. How and where to start: guides to chemical information sources and databases; general information on computer searching; current awareness, reviews, and document delivery; background reading: dictionaries, encyclopedias, and other books; introduction to Chemical Abstracts, Beilstein CrossFire, Current Contents.

Last update: KROUTIL (27.04.2004)

Czech

Formou praktických cvičení v e-learningovém prostředí Moodle se studenti seznámí se základy datových formátů používaných (nejen) v chemii, (txt, html, jpg, gif, mol, smiles, ...), o toku informací ve vědeckém světě, s obecnými i specializovanými zdroji informací (internet, CAS, Reaxys, Web of Science, patentové databáze, ...) a o tom, jak tyto zdroje a (i chemický) software efektivně využívat při vypracování vědeckých pojednání (bakalářských prací).

Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.05.2012)

Literature

Veškeré studijní materiály potřebné ke zvládnutí předmětu jsou dostupné na http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=1413 pro studenty zapsané do kurzu.

Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.09.2014)

Requirements to the exam

Pro udělení zápočtu je nutné splnit následující:

• zaregistrovat se v systému moodle.orgchem.cz, kde probíhá online komunikace mezi vyučujícím a studenty

• každý týden vyřešit úspěšně a včas cvičení k tématům daného týdne (~ 1 h týdně)

• vyřešit závěrečný test, který se skládá z otázek řešených v rámci průběžných cvičení (test se řeší v hodině online, je nutné dosáhnout alespoň 60% bodů)

Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.05.2012)

Syllabus

1. Vizualizace pomocí HTML, základy HTML, formáty datových souborů, webové prohlížeče a pluginy. E-mailové diskuzní skupiny.

2. Nástroje k tvorbě vědeckých pojednání - Přehled software vhodného k tvorbě vědeckých publikací. Publikační proces - definice pojmů primární, sekundární a terciární literatura, bibilografické databáze - obecný popis.

3. Průvodci chemickými zdroji (Database sumary sheets, vyhledávací obecné a specializované servery, adresáře online, tištěné příručky). Počítačové hledání (na Internetu - adresáře, vyhledávací servery, relační databáze, vyhledávácí dotazy - úvod do SQL).

4. Průběžné sledování informací - current awareness, e-mail alerts, časopisy online, bibliografické databáze (Web of Science), doručování dokumentů. Sovníky, Encyklopedie, Tabulky.

5. SciFinder.. Návod k používání software pro přístup k databázím CAS - CA Plus, Registry, ...

6. Hledání podle textových údajů (autoři, subjekt, identifikátory sloučeniny). Tištěná Chemical Abstracts.

7. Hledání fyzikálních a chemických vlastností sloučenin (Beilstein Handbook).

8. Reaxys - webová aplikace pro přístup k databázím Beilstein, Gmelin a Patent Chemistry database.

9. Patenty. Definice, podmínky pro udělení, způsob ochrany práv, patentové databáze. Toxikologické informace. Bezpečnostní listy (MSDS), toxikologické databáze (Toxnet, HSDB).

10. Příkazový řádek MS Windows. Základy tvorby skriptů/dávkových úloh.

11. Jak připravit prezentaci v PowerPointu. Získávání a organizace materiálu pro vizuální prezentaci, základy rozložení a návrhu prezentace.

12. Závěrečný online test.

Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.05.2012)