Communication in chemistry: molecular visualization tools and Internet sites; chemistry newsgroups and discussion lists; science writing aids (software); the publication process - primary, secondary, and tertiary sources. How and where to start: guides to chemical information sources and databases; general information on computer searching; current awareness, reviews, and document delivery; background reading: dictionaries, encyclopedias, and other books; introduction to Chemical Abstracts (SciFinder), Beilstein (Reaxys), Web of Science.
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.05.2012)
Formou praktických cvičení v e-learningovém prostředí Moodle se studenti seznámí se základy datových formátů používaných (nejen) v chemii, (txt, html, jpg, gif, mol, smiles, ...), o toku informací ve vědeckém světě, s obecnými i specializovanými zdroji informací (internet, CAS, Reaxys, Web of Science, patentové databáze, ...) a o tom, jak tyto zdroje a (i chemický) software efektivně využívat při vypracování vědeckých pojednání (bakalářských prací).
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.05.2012)
Literature -
All materials needed to complete the course are available at http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=1413 for the students signed for the course.
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (01.06.2018)
Veškeré studijní materiály potřebné ke zvládnutí předmětu jsou dostupné na http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=1413 pro studenty zapsané do kurzu.
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (08.09.2014)
Requirements to the exam -
To complete the course, a student has to fulfill the following:
- sign into the online course on dl2.cuni.cz
- solve in time an assignment for every lecture (once a week) to at least 60 %
- solve the final online test, to at least 60 %
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (01.06.2018)
Pro udělení zápočtu je nutné splnit následující:
- příhlásit se do kurzu na dl2.cuni.cz, kde probíhá online komunikace mezi vyučujícím a studenty - každý týden vyřešit úspěšně a včas cvičení k tématům daného týdne (~ 1 h týdně) - vyřešit závěrečný test, který se skládá z otázek řešených v rámci průběžných cvičení (test se řeší v hodině online, je nutné dosáhnout alespoň 60% bodů)
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (01.06.2018)
Syllabus -
1. Visualization using HTML, basics of HTML, data file formats, web browsers and plugins. E-mail discussion groups.
2. Tools to create scientific documents - Overview of software used for the creation of scientific publications. Publication process - definition of terms primary, secondary and tertiary literature, bibliographic databases.
3. Guides to chemical resources (Database summary sheets, search servers). Computer searching (search servers, relational databases, basics of SQL).
4. Current awareness, e-mail alerts, online journals, bibliographic databases (Web of Science), documents delivery. Dictionaries, encyclopedia, tables.
5. SciFinder. How to use software to access CAS databases - CA Plus, Registry, ...
6. Reaxys - basics of compounds search.
7. Zotero - personal bibliographics database.
8. Patents. Definition, conditions for assignment, protection of rights, patent databases. Toxicological information. Safety data sheets (MSDS), toxicological databases (Toxnet, HSDB).
10. Command line - MS Windows. Basics of batch scripts.
11. How to prepare PowerPoint presentations. Organization of material for visual presentation, the layout of presentation.
12. Cambridge Structural Database.
13. Final online test.
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (01.06.2018)
1. Vizualizace pomocí HTML, základy HTML, formáty datových souborů, webové prohlížeče a pluginy. E-mailové diskuzní skupiny.
2. Nástroje k tvorbě vědeckých pojednání - Přehled software vhodného k tvorbě vědeckých publikací. Publikační proces - definice pojmů primární, sekundární a terciární literatura, bibilografické databáze - obecný popis.
3. Průvodci chemickými zdroji (Database sumary sheets, vyhledávací obecné a specializované servery, adresáře online, tištěné příručky). Počítačové hledání (na Internetu - adresáře, vyhledávací servery, relační databáze, vyhledávácí dotazy - úvod do SQL).
4. Průběžné sledování informací - current awareness, e-mail alerts, časopisy online, bibliografické databáze (Web of Science), doručování dokumentů. Sovníky, Encyklopedie, Tabulky.
5. SciFinder.. Návod k používání software pro přístup k databázím CAS - CA Plus, Registry, ...
6. Reaxys - základy vyhledávání (sloučeniny).
7. Zotero - osobní bibliografická databáze.
8. Patenty. Definice, podmínky pro udělení, způsob ochrany práv, patentové databáze. Toxikologické informace. Bezpečnostní listy (MSDS), toxikologické databáze (Toxnet, HSDB).
10. Příkazový řádek MS Windows. Základy tvorby skriptů/dávkových úloh.
11. Jak připravit prezentaci v PowerPointu. Získávání a organizace materiálu pro vizuální prezentaci, základy rozložení a návrhu prezentace.
12. Cambridge Structural Database.
13. Závěrečný online test.
Last update: Jindřich Jindřich, doc. RNDr., CSc. (01.06.2018)
